Tính toán dữ liệu nhiệt động lực học cho các chuyển tiếp có phân tử học bất kỳ từ các đường cong nóng chảy ở trạng thái cân bằng

Biopolymers - Tập 26 Số 9 - Trang 1601-1620 - 1987
Luis A. Marky1, Kenneth J. Breslauer1
1Department of Chemistry, Rutgers, The State University of New Jersey, New Brunswick, New Jersey, 08903

Tóm tắt

Tóm tắt

Trong bài báo này, chúng tôi xây dựng các dạng tổng quát của các phương trình cần thiết để trích xuất dữ liệu nhiệt động lực học từ các đường cong chuyển tiếp ở trạng thái cân bằng trên các axit nucleic oligomeric và polymeric với tính phân tử bất kỳ. Đáng chú ý, vì các phương trình và giao thức là tổng quát, chúng cũng có thể được sử dụng để đặc trưng cho các quá trình cân bằng nhiệt động lực học trong các hệ thống khác ngoài axit nucleic. Chúng tôi sẽ tóm tắt cách thức các dạng giảm thiểu của các phương trình tổng quát đã được nhiều nhà nghiên cứu sử dụng để đánh giá các chuyển tiếp đơn phân tử và đôi phân tử, và sau đó giải thích làm thế nào những phương trình này có thể được tổng quát hóa để tính toán các tham số nhiệt động lực học từ những quan sát thực nghiệm phổ biến cho các chuyển tiếp có tính phân tử cao hơn. Chúng tôi nhấn mạnh các điểm mạnh và điểm yếu của từng phương pháp phân tích dữ liệu để các nhà nghiên cứu có thể chọn phương pháp phù hợp nhất cho hoàn cảnh thực nghiệm của họ. Chúng tôi cũng mô tả cách phân tích các đường cong nhiệt lượng riêng và các đường cong nóng chảy phân biệt không nhiệt lượng nhằm trích xuất cả dữ liệu nhiệt động lực học độc lập với mô hình và phụ thuộc vào mô hình cho các chuyển tiếp với bất kỳ tính phân tử nào. Các phương trình tổng quát và phương pháp phân tích được mô tả trong bài báo này sẽ đặc biệt hữu ích cho các phòng thí nghiệm hiện đang nghiên cứu các quá trình liên kết và phân ly trong axit nucleic có phân tử học lớn hơn hai.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Cantor C. R., 1980, Biophysical Chemistry, Part I. The Conformation of Biological Macromolecules

Bloomfield V. A., 1974, Physical Chemistry of Nucleic Acids

Ts'o P. O., 1974, Basic Principles in Nucleic Acid Chemistry, Vol. II

Hinz H., 1974, Biochemical Thermodynamics, 116

Breslauer K. J., 1985, Thermodynamic Data for Biochemistry and Biotechnology, 377

10.1073/pnas.83.11.3746

10.1038/230362a0

10.1038/newbio246040a0

10.1073/pnas.83.24.9373

10.1016/0022-2836(71)90341-X

10.1016/0022-2836(71)90342-1

10.1016/0022-2836(71)90434-7

10.1016/0022-2836(71)90434-7

10.1002/bip.1973.360120915

10.1002/bip.1973.360120609

10.1016/0022-2836(73)90096-X

10.1016/0022-2836(73)90118-6

10.1016/0022-2836(74)90357-X

10.1111/j.1432-1033.1974.tb03364.x

10.1016/S0022-2836(75)80171-9

10.1146/annurev.bi.36.070167.002203

10.1016/0301-4622(81)80013-0

10.1021/bi00509a001

10.1002/bip.1979.360180907

10.1093/nar/8.10.2295

10.1016/0301-4622(77)87023-3

10.1002/bip.360220416

10.1021/bi00295a025

10.1021/bi00338a008

10.1080/07391102.1984.10507514

10.1002/bip.1981.360201204

10.1016/0022-2836(73)90095-8

10.1021/bi00532a002

10.1021/bi00365a018

10.1021/bi00295a025

10.1080/07391102.1983.10507429

10.1016/0022-2836(70)90225-1

10.1016/0022-2836(70)90118-X

Poland D., 1970, Theory of Helix‐Coil Transitions in Biopolymers

10.1146/annurev.pc.13.100162.001131

10.1016/0022-2836(71)90158-6

10.1007/978-1-4613-4532-9_6

10.1021/ja01085a007

10.1002/bip.1966.360040209

10.1002/bip.1967.360050502

10.1016/0022-5193(82)90002-9

10.1016/S0006-3495(83)84292-1

10.1038/305829a0

10.1007/978-1-4684-7313-1_4

10.1021/bi00342a009

10.1002/bip.360260912

Privalov P. L., 1986, Methods in Enzymology, 4

10.1016/0301-4622(77)87024-5

Thông tin
Thông tin xuất bản

Biopolymers

Tập 26 Số 9

1601-1620

Thông tin tác giả