Đánh giá tiềm năng dịch bệnh hô hấp trong các bệnh viện Pháp thông qua thu thập dữ liệu tiếp xúc gần (Tháng 4 - Tháng 6 năm 2020)

Scientific Reports - Tập 14 - Trang 1-11 - 2024
George Shirreff1,2,3, Bich-Tram Huynh1,2, Audrey Duval1, Lara Cristina Pereira1, Djillali Annane4, Aurélien Dinh5, Olivier Lambotte6,7, Sophie Bulifon8, Magali Guichardon9, Sebastien Beaune10, Julie Toubiana11, Elsa Kermorvant-Duchemin12, Gerard Chéron13, Hugues Cordel14, Laurent Argaud15, Marion Douplat16, Paul Abraham17, Karim Tazarourte18, Géraldine Martin-Gaujard19, Philippe Vanhems20,21, Delphine Hilliquin20, Duc Nguyen22, Guillaume Chelius23, Antoine Fraboulet23, Laura Temime3,24, Lulla Opatowski1,2, Didier Guillemot1,2,25
1Institut Pasteur, Epidemiology and Modelling of Antibiotic Evasion, Université Paris Cité, Paris, France
2UVSQ, Inserm, CESP, Anti-infective Evasion and Pharmacoepidemiology Team, Université Paris-Saclay, Montigny-le-Bretonneux, France
3Modélisation, Épidémiologie Et Surveillance Des Risques Sanitaires (MESuRS), Conservatoire National Des Arts Et Métiers, Paris, France
4IHU PROMETHEUS, Raymond Poincaré Hospital (APHP), INSERM, Université Paris Saclay Campus Versailles, Paris, France
5Service de Maladies Infectieuses Et Tropicales, AP-HP. Paris Saclay, Hôpital Raymond Poincaré, Garches, France
6Service de Médecine Interne Et Immunologie Clinique, AP-HP. Paris Saclay, Hôpital de Bicêtre, Le Kremlin Bicêtre, France
7UMR1184, IMVA-HB, Inserm, CEA, Université Paris Saclay, Le Kremlin Bicêtre, France
8Service de Pneumologie, AP-HP. Paris Saclay, Hôpital de Bicêtre, Le Kremlin Bicêtre, France
9Service de Gériatrie, AP-HP. Paris Saclay, Hôpital Paul Brousse, Villejuif, France
10Service Des Urgences Adultes, AP-HP. Paris Saclay, Hôpital Ambroise Paré, Boulogne-Billancourt, France
11Service de Pédiatrie Générale, AP-HP. Centre – Université Paris Cité, Hôpital Necker-Enfants Malades, Paris, France
12Service de Réanimation Néonatale, AP-HP. Centre – Université Paris Cité, Hôpital Necker-Enfants Malades, Paris, France
13Service Des Urgences Pédiatriques, AP-HP. Centre – Université Paris Cité, Hôpital Necker-Enfants Malades, Paris, France
14Service de Maladies Infectieuses Et Tropicales, AP-HP. Hôpitaux Universitaires Paris Seine-Saint-Denis, Hôpital Avicenne, Bobigny, France
15Service de Réanimation Adulte, Hospices Civils de Lyon - Université Claude Bernard, Hôpital Edouard Herriot, Lyon, France
16Service Des Urgences Adultes, Hospices Civils de Lyon - Université Claude Bernard, Hôpital Lyon Sud, Pierre-Bénite, France
17Service d’Anesthésie-Réanimation, Hospices Civils de Lyon - Université Claude Bernard, Hôpital Edouard Herriot, Lyon, France
18Service Des Urgences Adultes, Hospices Civils de Lyon - Université Claude Bernard, Hôpital Edouard Herriot, Lyon, France
19Service de Gériatrie, Hospices Civils de Lyon - Université Claude Bernard, Hôpital Edouard Herriot, Lyon, France
20Service Hygiène, Épidémiologie, Infectiovigilance Et Prévention, Hospices Civils de Lyon - Université Claude Bernard, Lyon, France
21Centre International de Recherche en Infectiologie, Team Public Health, Epidemiology and Evolutionary Ecology of Infectious Diseases (PHE3ID), Univ Lyon, Inserm, U1111, CNRS, UMR5308, ENS de Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France
22Service Des Maladies Infectieuses Et Tropicales, CHU de Bordeaux, Hôpital Pellegrin, Bordeaux, France
23INRIA, Lyon, France
24PACRI unit, Conservatoire National des Arts et Métiers, Institut Pasteur, Paris, France
25Department of Public Health, Medical Information, Clinical Research, AP-HP. Paris Saclay, Paris, France

Tóm tắt

Rủi ro lây truyền của SARS-CoV-2 trong các bệnh viện có thể vượt quá rủi ro trong cộng đồng nói chung do sự tương tác gần gũi (CPI) diễn ra thường xuyên hơn. Tuy nhiên, rủi ro dịch bệnh giữa các khoa vẫn chưa được mô tả rõ. Chúng tôi đã đo lường các CPI một cách trực tiếp bằng cách sử dụng cảm biến đeo được phát cho tất cả những người có mặt trong một khoa lâm sàng trong khoảng thời gian 36 giờ, trải qua 15 khoa trong ba bệnh viện từ tháng 4 đến tháng 6 năm 2020. Dữ liệu được thu thập từ 2114 người tham gia và kết hợp với một mô hình lây truyền đơn giản mô tả sự xuất hiện của một ca bệnh điển hình trong khoa để ước tính rủi ro bùng phát. Rủi ro dịch tễ ước tính dao động bốn lần, từ 0.12 ca nhiễm thứ phát một ngày trong trường hợp cấp cứu người lớn lên đến 0.49 ca mỗi ngày trong khoa nhi tổng quát. Rủi ro mà một ca bệnh điển hình mang lại cho một bệnh nhân thay đổi 20 lần giữa các khoa. Bằng cách sử dụng mô phỏng, chúng tôi đánh giá tác động tiềm năng đến rủi ro bùng phát nếu nhắm mục tiêu vào những cá nhân có kết nối nhiều nhất để phòng ngừa. Chúng tôi phát hiện rằng việc nhắm mục tiêu vào những người có thời gian tiếp xúc tích lũy cao nhất là hiệu quả nhất (giảm 20% cho 5% dân số được nhắm), và trung bình, tài nguyên được chi tiêu tốt hơn khi nhắm vào bệnh nhân. Nghiên cứu này tiết lộ các mẫu tương tác giữa các cá nhân trong bệnh viện trong thời gian đại dịch và mở ra các hướng nghiên cứu mới về rủi ro lây nhiễm qua đường không khí trong bệnh viện.

Từ khóa

#SARS-CoV-2 #rủi ro lây truyền #tiếp xúc gần gũi #dịch tễ học #bệnh viện

Tài liệu tham khảo

Read, J. M. et al. Hospital-acquired SARS-CoV-2 infection in the UK’s first COVID-19 pandemic wave. Lancet 398, 1037–1038 (2021).

Evans, S. et al. The impact of testing and infection prevention and control strategies on within-hospital transmission dynamics of COVID-19 in English hospitals. Philos. Transact. Royal Soc. B: Biol. Sci. 376, 20200268 (2021).

Temime, L. et al. A conceptual discussion about R0 of SARS-COV-2 in healthcare settings. Clin. Infect. Dis. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa682 (2020).

Smith, D. R. M. et al. Optimizing COVID-19 surveillance in long-term care facilities: A modelling study. BMC Med. 18, 386 (2020).

Abbas, M. et al. Nosocomial transmission and outbreaks of coronavirus disease 2019: The need to protect both patients and healthcare workers. Antimicrob. Resist. Infect Control 10, 1 (2021).

Smieszek, T. et al. How should social mixing be measured: Comparing web-based survey and sensor-based methods. BMC Infect. Dis. 14, 136 (2014).

Sick-Samuels, A. C. et al. Improving physical distancing among healthcare workers in a pediatric intensive care unit. Infect Control Hosp. Epidemiol. 1–6. https://doi.org/10.1017/ice.2021.501.

Lucet, J.-C. et al. Electronic sensors for assessing interactions between healthcare workers and patients under airborne precautions. PLOS ONE 7, e37893 (2012).

Hüttel, F. B. et al. Analysis of social interactions and risk factors relevant to the spread of infectious diseases at hospitals and nursing homes. PLOS ONE 16, e0257684 (2021).

Isella, L. et al. Close encounters in a pediatric ward: Measuring face-to-face proximity and mixing patterns with wearable sensors. PLOS ONE 6, e17144 (2011).

Vanhems, P. et al. Estimating potential infection transmission routes in hospital wards using wearable proximity sensors. PLOS ONE 8, e73970 (2013).

Hertzberg, V. S. et al. Contact networks in the emergency department: Effects of time, environment, patient characteristics, and staff role. Soc. Netw. 48, 181–191 (2017).

Duval, A. et al. Measuring dynamic social contacts in a rehabilitation hospital: Effect of wards, patient and staff characteristics. Sci. Rep. 8, 1686 (2018).

Wölfel, R. et al. Virological assessment of hospitalized patients with COVID-2019. Nature 581, 465–469 (2020).

Poletti, P. et al. Seroprevalence of and risk factors associated with SARS-CoV-2 infection in health care workers during the early COVID-19 pandemic in Italy. JAMA Netw. Open 4, e2115699 (2021).

Serafino, M. et al. Digital contact tracing and network theory to stop the spread of COVID-19 using big-data on human mobility geolocalization. PLOS Comput. Biol. 18, e1009865 (2022).

Ge, Y. et al. COVID-19 transmission dynamics among close contacts of index patients with COVID-19: A population-based cohort study in Zhejiang Province, China. JAMA Internal Med. 181, 1343–1350 (2021).

Lindsey, B. B. et al. Characterising within-hospital SARS-CoV-2 transmission events using epidemiological and viral genomic data across two pandemic waves. Nat. Commun. 13, 671 (2022).

Crawford, C. et al. Modeling of aerosol transmission of airborne pathogens in ICU rooms of COVID-19 patients with acute respiratory failure. Sci. Rep. 11, 11778 (2021).

Allen, J. G. & Ibrahim, A. M. Indoor air changes and potential implications for SARS-CoV-2 transmission. JAMA 325, 2112–2113 (2021).

Robles-Romero, J. M., Conde-Guillén, G., Safont-Montes, J. C., García-Padilla, F. M. & Romero-Martín, M. Behaviour of aerosols and their role in the transmission of SARS-CoV-2; a scoping review. Rev. Med. Virol. 32, 2297. https://doi.org/10.1002/rmv.2297 (2021).

Yang, F., Pahlavan, A. A., Mendez, S., Abkarian, M. & Stone, H. A. Towards improved social distancing guidelines: Space and time dependence of virus transmission from speech-driven aerosol transport between two individuals. Phys. Rev. Fluids 5, 122501 (2020).

R Core Team. R: A Language and Environment for Statistical Computing. (R Foundation for Statistical Computing, 2022).