APE: Phân tích Phylogenetics và Tiến hóa bằng ngôn ngữ R

Tóm lược: Phân tích Phylogenetics và Tiến hóa (APE) là một gói phần mềm được viết bằng ngôn ngữ R, phục vụ cho việc nghiên cứu tiến hóa phân tử và phylogenetics. APE cung cấp cả các hàm tiện ích để đọc và ghi dữ liệu, cũng như thao tác với các cây phát sinh chủng loài, và cũng nhiều phương pháp nâng cao cho phân tích phylogenetics và tiến hóa (ví dụ: các phương pháp di truyền so sánh và dân số). APE tận dụng nhiều hàm R cho thống kê và đồ họa, và cũng cung cấp một khung linh hoạt để phát triển và thực hiện thêm các phương pháp thống kê cho phân tích các quá trình tiến hóa.

Sự có sẵn: Chương trình này miễn phí và có sẵn từ kho gói chính thức của R tại http://cran.r-project.org/src/contrib/PACKAGES.html#ape. APE được cấp phép theo Giấy phép Công cộng GNU.