Hệ thống đồng nhất để chú thích microRNA

RNA - Tập 9 Số 3 - Trang 277-279 - 2003
Victor Ambros1, Bonnie Bartel2, David P. Bartel3, Christopher B. Burge4, James C. Carrington5, Xuemei Chen6, Gideon Dreyfuss7, Sean R. Eddy8, Samuel Gross9,10, Mhairi Marshall9,10, Marjori Matzke11, Gary Ruvkun12, Thomas Tuschl13
1Dartmouth Medical School Department of Genetics, Hanover, New Hampshire 03755, USA. [email protected]
2Department of Biochemistry and Cell Biology, Rice University, Houston, Texas 77005 USA
3Whitehead Institute for Biomedical Research, Massachusetts Institute of Technology, Department of Biology, Cambridge, Massachusetts 02139, USA
4Massachusetts Institute of Technology, Department of Biology, Cambridge, Massachusetts 02142, USA
5Center for Gene Research and Biotechnology, and Department of Botany and Plant Pathology, Oregon State University, Corvallis, Oregon 97331, USA
6Waksman Institute, Rutgers University, Piscataway, New Jersey 08854, USA
7Howard Hughes Medical Institute and Department of Biochemistry & Biophysics, University of Pennsylvania School of Medicine, Philadelphia, Pennsylvania 19104-6148, USA
8Howard Hughes Medical Institute, Washington University Department of Genetics, Saint Louis, Missouri 63110, USA
9Cambridge Center, Cambridge, MA 02142, USA;
10, The Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA, UK,
11Institute of Molecular Biology, Austrian Academy of Sciences, A-5020 Salzburg, Austria
12Department of Genetics, Harvard Medical School, and Department of Molecular Biology, Massachusetts General Hospital, Boston, Massachusetts 02114, USA.
13Research Group of Combinatorical Biochemistry, MPI for biophysical chemistry, Max Planck Society

Tóm tắt

MicroRNA (miRNA) là các sản phẩm gene RNA không mã hóa nhỏ, dài khoảng 22 nt, được xử lý bởi Dicer từ các precursors có cấu trúc thứ cấp hình kẹp tóc đặc trưng. Các hướng dẫn được trình bày để xác định và chú thích các miRNA mới từ các sinh vật đa dạng, đặc biệt để các miRNA có thể được phân biệt đáng tin cậy khỏi các RNA khác như RNA can thiệp nhỏ. Chúng tôi mô tả các tiêu chí cụ thể cho việc xác thực thực nghiệm các miRNA, và các quy ước trong việc đặt tên cho các miRNA và các gene miRNA. Cuối cùng, một trung tâm trực tuyến để phân bổ tên gene miRNA được cung cấp bởi cơ sở dữ liệu Rfam của các họ RNA.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1093/nar/gkg006

10.1126/science.1073827

10.1126/science.1064921

10.1126/science.1065062

10.1016/0092-8674(93)90529-Y

10.1126/science.1065329

10.1105/tpc.003210

10.1126/science.1076311

10.1006/jmbi.1999.2700

10.1101/gad.974702

1999, Dev. Biol., 2, 671

10.1016/S0960-9822(02)01017-5

10.1146/annurev.cellbio.18.012502.105832

10.1038/35002607

10.1101/gad.1004402

10.1016/S0092-8674(02)00863-2

10.1126/science.1072457

10.1016/S1097-2765(02)00541-5