Chiến lược xác định các gen ứng cử vị trí dẫn đến kháng Marek bằng cách tích hợp vi mảng DNA và lập bản đồ gen

Animal Genetics - Tập 32 Số 6 - Trang 351-359 - 2001
Hans H. Cheng1, Vijaya G. Tirunagaru, Luc Sofer, Joan Burnside
1United States Department of Agriculture, Agricultural Research Service, Avian Disease and Oncology Laboratory, East Lansing, MI 48823, USA

Tóm tắt

Chọn giống hỗ trợ bằng dấu ấn (MAS) nhằm tăng cường khả năng kháng gen đối với bệnh Marek (MD), một loại ung thư tế bào T do virus herpes gây ra ở gà, là một giải pháp thay thế hấp dẫn để nâng cao kiểm soát bằng vắc-xin. Các nghiên cứu trước đây của chúng tôi chỉ ra rằng có nhiều locus đặc điểm số lượng (QTL) chứa một hoặc nhiều gen mang lại khả năng kháng gen đối với MD. Thật không may, rất khó để phân giải đủ các QTL này để xác định gen nguyên nhân và tạo ra các dấu ấn liên kết chặt chẽ. Một giải pháp khả thi là xác định các gen ứng cử vị trí dựa trên sự khác biệt về biểu hiện gen giữa gà kháng và nhạy cảm với MD bằng cách sử dụng các vi mảng axit deoxyribonucleic (DNA) tiếp theo là lập bản đồ gen cho các gen biểu hiện khác biệt. Trong nghiên cứu sơ bộ này, chúng tôi cho thấy các vi mảng DNA chứa khoảng 1200 gen hoặc các thẻ trình tự biểu hiện (ESTs) có khả năng phát hiện một cách tái lập sự khác biệt trong biểu hiện gen giữa các dòng ADOL 63 (kháng MD) và 72 (nhạy cảm với MD) ở các lymphocyte máu ngoại vi không nhiễm và nhiễm virus bệnh Marek (MDV). Dữ liệu từ vi mảng đã được xác thực bằng phản ứng chuỗi polymerase định lượng (PCR) và nhất quán với tài liệu trước đây về sự cảm ứng gen hoặc phản ứng miễn dịch. Việc tích hợp các vi mảng với dữ liệu lập bản đồ gen đã được thực hiện với mẫu gồm 15 gen. Mười hai trong số các gen này đã có gen đồng loại ở người được lập bản đồ. Bảy gen được định vị trên bản đồ liên kết ở gà như dự đoán bởi bản đồ so sánh người-gà, trong khi hai gen khác định nghĩa một nhóm syntenic bảo tồn mới. Quan trọng hơn, một trong số các gen có biểu hiện khác biệt được biết đến là mang lại khả năng kháng gen đối với MD trong khi một gen khác là ứng cử viên vị trí chính cho một QTL.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Adam M.D., 2000, The genome sequence of Drosophila melanogaster, Science, 287, 2185, 10.1126/science.287.5461.2185

10.1080/03079459808419296

10.1016/S0166-0934(96)02172-6

10.1038/46555

10.3382/ps.0720334

10.1023/A:1025685324830

DerS.D. ZhouA. WilliamsB.R.G. SilvermanR.H.(1998)Identification of genes differentially regulated by interferon α β or γ using oligonucleotide arrays.Proceedings of the National Academy of Sciences (USA)95 15 623–8.

DodgsonJ.B. ChengH.H. BurnsideJ.(in press)Integrating quantitative and molecular techniques in selection for disease resistance.Poultry Science (in press).

10.1038/4434

10.1046/j.1365-2052.1999.00527.x

Groenen M.A.M., 2000, A consensus linkage map of the chicken genome, Genome Research, 10, 137

10.1046/j.1365-2052.2000.00575.x

10.3382/ps.0620579

10.1126/science.285.5432.1390

LiuH.‐C. KungH.‐J. FultonJ.E. MorganR.W. ChengH.H.(2001)Growth hormone interacts with the Marek’s disease virus SORF2 protein and is associated with disease resistance in chicken.Proceedings of the National Academy of Sciences (USA)98 9203–8.

LuckS.(2001)Normalization and error estimation for expression profiles.Proceedings of BIOS2001: Microarrays Optical Technologies and Informatics.

10.1007/BF00357089

10.1128/JVI.75.1.533-539.2001

PurchaseH.G.(1985)Clinical disease and its economic impact. In:Marek’s Disease Scientific Basis and Methods of Control(ed. by L.N. Payne) pp. 17–42. Martinus Nkjhoff Publishing Boston USA.

10.1080/10495390009525951

10.1159/000056772

10.1089/omi.1.1998.3.13

10.1093/ps/76.5.743

10.1046/j.1365-2052.2001.00717.x

10.1006/geno.2000.6189

Vallejo R.L., 1998, Genetic mapping of quantitative trait loci affecting susceptibility to Marek’s disease induced tumors in F2 intercross chickens, Genetics, 148, 349, 10.1093/genetics/148.1.349

10.1046/j.1365-2052.1999.00457.x

ZhuH. CongJ.P. MamtoraG. GingerasT. ShenkT.(1998)Cellular gene expression altered by human cytomegalovirus: global monitoring with oligonucleotide arrays.Proceedings of the National Academy of Sciences (USA)95 14 470–5.

Thông tin
Thông tin xuất bản

Animal Genetics

Tập 32 Số 6

351-359

Thông tin tác giả