Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Một loại polyomavirus mới từ khoang mũi của gấu trúc khổng lồ (Ailuropoda melanoleuca)
Virology Journal - 2017
Tóm tắt
Polyomavirus là những virus có khả năng lây nhiễm cho nhiều loài động vật có vú và chim khác nhau, gây ra nhiều kết quả khác nhau bao gồm nhiễm trùng không triệu chứng, bệnh toàn thân cấp tính và sự hình thành khối u. Các phương pháp metagenomics virus và PCR tổng quát đã được sử dụng để phát hiện axit nucleic của virus trong các mẫu từ gấu trúc khổng lồ bệnh và khỏe mạnh. Một loại polyomavirus mới, polyomavirus gấu trúc khổng lồ 1 (GPPyV1) từ khoang mũi của một con gấu trúc khổng lồ chết (Ailuropoda melanoleuca) đã được đặc trưng. Bộ gen của GPPyV1 có kích thước 5144 bp và chứa năm khung đọc mở (open-reading frames - ORF) dự đoán mã hóa cho các kháng nguyên T nhỏ và lớn cổ điển trong vùng sớm, và các protein vỏ VP1, VP2 và VP3 trong vùng muộn. Phân tích phát sinh chủng loại của kháng nguyên T lớn của GPPyV1 cho thấy GPPyV1 thuộc về một loài mới dự đoán trong chi Deltapolyomavirus, cùng nhóm với bốn loài polyomavirus ở người. VP1 và VP2 của GPPyV1 nằm trong nhóm Alphapolyomavirus. Nghiên cứu dịch tễ học của chúng tôi cho thấy loại polyomavirus mới này cũng đã được phát hiện trong các mẫu bông mũi và phân từ những con gấu trúc khổng lồ khỏe mạnh đang nuôi nhốt. Một loại polyomavirus mới được phát hiện ở gấu trúc khổng lồ và bộ gen hoàn chỉnh của nó đã được đặc trưng, có thể gây ra nhiễm trùng tiềm ẩn ở gấu trúc khổng lồ.
Từ khóa
Tài liệu tham khảo
DeCaprio JA, Garcea RL. A cornucopia of human polyomaviruses. Nature Reviews. Microbiology. 2013;11:264–76.
Gerits N, Moens U. Agnoprotein of mammalian polyomaviruses. Virology. 2012;432:316–26.
Calvignac-Spencer S, Feltkamp MCW, Daugherty MD, Moens U, Ramqvist T, Johne R, Ehlers B, Ehlers B. A taxonomy update for the family Polyomaviridae. Arch Virol. 2016;161:1739–50.
Yogo Y, Sugimoto C, Zhong S, Homma Y. Evolution of the BK polyomavirus: epidemiological, anthropological and clinical implications. Rev Med Virol. 2009;19:185–99.
Abend JR, Jiang M, Imperiale MJ. BK virus and human cancer: innocent until proven guilty. Semin Cancer Biol. 2009;19:252–60.
Gardner SD, Field AM, Coleman DV, Hulme B. New human papovavirus (B.K.) isolated from urine after renal transplantation. Lancet (London, England). 1971;1:1253–7.
Padgett BL, Walker DL, ZuRhein GM, Eckroade RJ, Dessel BH. Cultivation of papova-like virus from human brain with progressive multifocal leucoencephalopathy. Lancet (London, England). 1971;1:1257–60.
Feng H, Shuda M, Chang Y, Moore PS. Clonal integration of a polyomavirus in human Merkel cell carcinoma. Science (New York, NY). 2008;319:1096–100.
van der Meijden E, Janssens RWA, Lauber C, Bouwes Bavinck JN, Gorbalenya AE, Feltkamp MCW. Discovery of a new human polyomavirus associated with trichodysplasia spinulosa in an immunocompromized patient. PLoS Pathog. 2010;6:e1001024.
Ho J, Jedrych JJ, Feng H, Natalie AA, Grandinetti L, Mirvish E, Crespo MM, Yadav D, Fasanella KE, Proksell S, Kuan S-F, Pastrana DV, Buck CB, Shuda Y, Moore PS, Chang Y. Human polyomavirus 7-associated pruritic rash and viremia in transplant recipients. J Infect Dis. 2015;211:1560–5.
Siebrasse EA, Nguyen NL, Willby MJ, Erdman DD, Menegus MA, Wang D. Multiorgan WU Polyomavirus infection in bone marrow transplant recipient. Emerg Infect Dis. 2016;22:24–31.
Toptan T, Yousem SA, Ho J, Matsushima Y, Stabile LP, Fernández-Figueras M-T, Bhargava R, Ryo A, Moore PS, Chang Y. Survey for human polyomaviruses in cancer. JCI Insight. 2016;1
Johne R, Enderlein D, Nieper H, Müller H. Novel polyomavirus detected in the feces of a chimpanzee by nested broad-spectrum PCR. J Virol. 2005;79:3883–7.
Misra V, Dumonceaux T, Dubois J, Willis C, Nadin-Davis S, Severini A, Wandeler A, Lindsay R, Artsob H. Detection of polyoma and corona viruses in bats of Canada. The Journal of general virology. 2009;90(Pt 8):2015–22.
Groenewoud MJ, Fagrouch Z, van Gessel S, Niphuis H, Bulavaite A, Warren KS, Heeney JL, Verschoor EJ. Characterization of novel polyomaviruses from Bornean and Sumatran orang-utans. The Journal of general virology. 2010;91(Pt 3):653–8.
Rigatti LH, Toptan T, Newsome JT, Moore PS, Chang Y. Identification and characterization of novel rat Polyomavirus 2 in a Colony of X-SCID rats by P-PIT assay. mSphere. 2016;1:e00334–16.
Van Borm S, Rosseel T, Behaeghel I, Saulmont M, Delooz L, Petitjean T, Mathijs E, Vandenbussche F. Complete genome sequence of bovine Polyomavirus type 1 from aborted cattle, isolated in Belgium in 2014. Genome Announcements. 2016;4:e01646–15.
van Persie J, Buitendijk H, Fagrouch Z, Bogers W, Haaksma T, Kondova I, Verschoor EJ. Complete genome sequence of a novel chimpanzee Polyomavirus from a western common chimpanzee. Genome Announcements. 2016;4:e01406–15.
Nainys J, Timinskas A, Schneider J, Ulrich RG, Gedvilaite A. Identification of two novel members of the tentative genus Wukipolyomavirus in wild rodents. PLoS One. 2015;10:e0140916.
Murray ZL, Hall RJ, Moore NE, McInnes K, Tompkins DM, Wang J, White DJ. Discovery of novel virus sequences in an isolated and threatened bat species, the New Zealand lesser short-tailed bat (Mystacina Tuberculata). J Gen Virol. 2015;96:2442–52.
Chambers M, Murphy AA, Palser AL, Grierson S, Hill SC, Boschiroli M-L, Bhuachalla DN, Pybus OG, Cotten M, Lesellier S, Richomme C, Kellam P, Jarvis MA, Benson P, Ehlers B, Gormley E: Discovery of a polyomavirus in European badgers (Meles Meles) and the evolution of host range in the family Polyomaviridae. J Gen Virol 2015, 96:1411–1422.
Varsani A, Porzig EL, Jennings S, Kraberger S, Farkas K, Julian L, Massaro M, Ballard G, Ainley DG. Identification of an avian polyomavirus associated with Adelie penguins (Pygoscelis Adeliae). J Gen Virol. 2015;96(Pt_4):851–7.
Stevens H, Bertelsen MF, Sijmons S, Van Ranst M, Maes P. Characterization of a novel polyomavirus isolated from a fibroma on the trunk of an African elephant (Loxodonta Africana). PLoS One. 2013;8:e77884.
Dela Cruz FN, Giannitti F, Li L, Woods LW, Del Valle L, Delwart E, Pesavento PA. Novel polyomavirus associated with brain tumors in free-ranging raccoons, western United States. Emerg Infect Dis. 2013;19:77–84.
Zhang W, Li L, Deng X, Kapusinszky B, Pesavento PA, Delwart E. Faecal virome of cats in an animal shelter. The Journal of general virology. 2014;95(Pt 11):2553–64.
Zhang W, Li L, Deng X, Blümel J, Nübling CM, Hunfeld A, Baylis SA, Delwart E. Viral nucleic acids in human plasma pools. Transfusion. 2016;56:2248–55.
Liu Z, Yang S, Wang Y, Shen Q, Yang Y, Deng X, Zhang W, Delwart E. Identification of a novel human papillomavirus by metagenomic analysis of vaginal swab samples from pregnant women. Virol J. 2016;13:122.
Deng X, Naccache SN, Ng T, Federman S, Li L, Chiu CY, Delwart EL. An ensemble strategy that significantly improves de novo assembly of microbial genomes from metagenomic next-generation sequencing data. Nucleic Acids Res. 2015;
Siebrasse EA, Reyes A, Lim ES, Zhao G, Mkakosya RS, Manary MJ, Gordon JI, Wang D. Identification of MW polyomavirus, a novel polyomavirus in human stool. J Virol. 2012;86:10321–6.
Moens U, Krumbholz A, Ehlers B, Zell R, Johne R, Calvignac-Spencer S, Lauber C. Biology, evolution, and medical importance of polyomaviruses: an update. Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases. 2017;54:18–38.
Egli A, Infanti L, Dumoulin A, Buser A, Samaridis J, Stebler C, Gosert R, Hirsch HH. Prevalence of polyomavirus BK and JC infection and replication in 400 healthy blood donors. J Infect Dis. 2009;199:837–46.
GIRARDI AJ, SWEET BH, SLOTNICK VB, HILLEMAN MR. Development of tumors in hamsters inoculated in the neonatal period with vacuolating virus, SV-40. Proceedings of the Society for Experimental Biology and Medicine Society for Experimental Biology and Medicine (New York, NY). 1962;109:649–60.
Spurgeon ME, Lambert PF. Merkel cell polyomavirus: a newly discovered human virus with oncogenic potential. Virology. 2013;435:118–30.
Peng J, Li K, Zhang C, Jin Q: MW polyomavirus and STL polyomavirus present in tonsillar tissues from children with chronic tonsillar disease. Clinical Microbiology and Infection 2016, 22:97.e1–97.e3.
Buck CB, Van Doorslaer K, Peretti A, Geoghegan EM, Tisza MJ, An P, Katz JP, Pipas JM, McBride AA, Camus AC, McDermott AJ, Dill JA, Delwart E, Ng TFF, Farkas K, Austin C, Kraberger S, Davison W, Pastrana DV, Varsani A. The ancient evolutionary history of Polyomaviruses. PLoS Pathog. 2016;12:e1005574.
Lim ES, Reyes A, Antonio M, Saha D, Ikumapayi UN, Adeyemi M, Stine OC, Skelton R, Brennan DC, Mkakosya RS, Manary MJ, Gordon JI, Wang D. Discovery of STL polyomavirus, a polyomavirus of ancestral recombinant origin that encodes a unique T antigen by alternative splicing. Virology. 2013;436:295–303.
Tao Y, Shi M, Conrardy C, Kuzmin IV, Recuenco S, Agwanda B, Alvarez DA, Ellison JA, Gilbert AT, Moran D, Niezgoda M, Lindblade KA, Holmes EC, Breiman RF, Rupprecht CE, Tong S. Discovery of diverse polyomaviruses in bats and the evolutionary history of the Polyomaviridae. The Journal of general virology. 2013;94(Pt 4):738–48.