Một mảng microRNA tiết lộ sự điều chỉnh rộng rãi của microRNA trong quá trình phát triển não

RNA - Tập 9 Số 10 - Trang 1274-1281 - 2003
Anna M. Krichevsky1, Kevin S. King1, Christine P. Donahue1, Konstantin Khrapko2, Kenneth S. Kosik1
1Center For Neurologic Diseases Brigham and Women's Hospital and Harvard Medical School Boston, Massachusetts 02115, USA
2Harvard Institute of Human Genetics, Beth Israel Deaconess Medical Center and Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA

Tóm tắt

Gần đây, hàng trăm microRNA (miRNA) đã được nhân bản từ nhiều loại sinh vật khác nhau trên toàn bộ hệ sinh thái. Mặc dù miRNA có mức độ bảo tồn cao, chức năng của chúng nói chung, và đặc biệt là ở động vật có vú, vẫn chỉ mới bắt đầu được xác định. Ở đây, chúng tôi cho thấy rằng một mảng DNA oligonucleotide có thể được sử dụng thành công để phân tích song song các hồ sơ biểu hiện miRNA từ mô hoặc tế bào. Từ một tập hợp con các miRNA thể hiện trong não, chúng tôi đã thiết kế một mảng oligonucleotide với các mồi đặc hiệu cho 44 miRNA trưởng thành. Những mảng này cho thấy sự điều chỉnh chính xác của biểu hiện miRNA trong các giai đoạn phát triển não của động vật có vú. Khoảng 20% số miRNA đã được kiểm tra có sự thay đổi đáng kể trong biểu hiện trong quá trình phát triển não bình thường, và hai trong số đó, miR-9 và miR-131, đã bị điều chỉnh bất thường ở chuột thiếu presenilin-1, những con chuột này có những khiếm khuyết nghiêm trọng trong phát triển não. Các bản sao có mẫu biểu hiện được điều chỉnh trên mảng đã được xác nhận bằng các bản Northern blot. Thêm vào đó, một phân tích sinh tin học của các miRNA được điều chỉnh theo phát triển đã gợi ý các mục tiêu mRNA tiềm năng. Các mảng cũng tiết lộ miRNA phân bố đến các polyribosome đang dịch mã trong các neuron nguyên phát, nơi chúng có thể điều chỉnh quá trình dịch mã. Do đó, các mảng oligonucleotide cung cấp một công cụ mới để nghiên cứu biểu hiện miRNA trong một loạt các bối cảnh sinh học và bệnh lý. Việc tạo ra các cụm của các miRNA đồng biểu hiện sẽ góp phần vào việc hiểu rõ hơn về sự điều chỉnh, chức năng của chúng, và phát hiện các mục tiêu mRNA.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1016/S0959-437X(00)00108-8

10.1016/S0960-9822(03)00287-2

10.1126/science.1077906

10.1016/S0092-8674(03)00231-9

10.1101/gad.1025202

10.1016/S0896-6273(00)80652-2

10.1261/rna.2141503

10.1046/j.0022-3042.2002.00760.x

10.1016/S0092-8674(01)00431-7

2000, Development, 127, 2593, 10.1242/dev.127.12.2593

10.1126/science.1062961

10.1016/S1534-5807(03)00025-X

10.1101/gad.927801

10.1016/S0896-6273(01)00508-6

10.1126/science.1064921

10.1016/S0960-9822(02)00809-6

10.1126/science.1065062

10.1126/science.1065329

10.1016/0092-8674(93)90529-Y

10.1126/science.1080372

10.1126/science.1076311

10.1016/S0896-6273(02)00978-9

10.1101/gad.974702

10.1146/annurev.neuro.25.112701.142909

10.1038/35075094

10.1006/dbio.1999.9523

1991, Dev. Brain Res., 61, 105

10.1038/35002607

10.1016/S0092-8674(02)00863-2

10.1016/S0092-8674(00)80244-5

10.1016/S0959-437X(02)00318-0

10.1016/S1097-2765(00)80245-2

10.1016/0092-8674(93)90530-4

10.1073/pnas.96.8.4650

Thông tin
Thông tin xuất bản

RNA

Tập 9 Số 10

1274-1281

Thông tin tác giả