A comprehensive evaluation of normalization methods for Illumina high-throughput RNA sequencing data analysis

Briefings in Bioinformatics - Tập 14 Số 6 - Trang 671-683 - 2013
Marie‐Agnès Dillies1, Andrea Rau2, Julie Aubert3, Christelle Hennequet-Antier4, Marine Jeanmougin5, Nicolas Servant6, Céline Keime7, Guillemette Marot8,9, David Castel10, Jordi Estellé11, Grégory Guernec12, Bernd Jagla4, Rute A. Tomaz13, Dénis Laloë2, Caroline Le Gall14, Brigitte Schaeffer15, Stéphane Le Crom16, Mickaël Guedj15, Florence Jaffrézic2
1PF2 - Puces à ADN (Plate-Forme 2) (25-28 rue du Docteur Roux 75724 Paris Cedex 15 - France)
2GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative (Domaine de Vilvert F-78252 Jouy-en-Josas - France)
3MIA-Paris - Mathématiques et Informatique Appliquées (16 rue Claude Bernard 75231 PARIS CEDEX 05 - France)
4CMIP - Centre Médical de l'Institut Pasteur (209-211 rue de Vaugirard F-75015 Paris - France)
5SG - Laboratoire Statistique et Génome (23 boulevard de France 91 037 Évry, France - France)
6Cancer et génome: Bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système complexe (26 rue d'Ulm - 75248 Paris cedex 05 - France)
7Institute of Genetics [Illkirch] (1, rue Laurent Fries, 67404 Illkirch - France)
8METRICS - Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694 (1, place de Verdun 59045 - Lille cedex - France)
9MODAL - MOdel for Data Analysis and Learning (France)
10LEFG - Laboratoire d'Exploration Fonctionnelle des Génomes (2, rue Gaston Crémieux 91000 EVRY - France)
11CNAG - Centro Nacional de Análisi Genómico (Generalitat de Catalunya - Departament de SalutGeneralitat de Catalunya - Departament d'InnovacióMinisterio de Ciendia e InnovaciónParc Científic de Barcelona baldiri reixac, 4 pcb - tower i 08028 Barcelona - Spain)
12ESIM - Epidémiologie des maladies infectieuses et modélisation (Faculte de Médecine Saint-Antoine 27, Rue Chaligny 75571 Paris Cedex 12 - France)
13Unité MIAJ - INRA - Mathématiques et Informatique Appliquées (Centre de Jouy-en-Josas Domaine de Vilvert F78352 JOUY-EN-JOSAS Cedex - France)
14Methodomics (Toulouse - France)
15INRA (INRA, UR 0341 Mathématiques et Informatique Appliquées, F-78352, Jouy-en-Josas, France - France)
16Genomique ENS - GenomiqueENS (GenomiqueENS Institut de Biologie de l’École normale supérieure - IBENS 46, rue d'Ulm 75230 Paris Cedex 05 France - France)

Tóm tắt

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

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