Mechanisms of Autophagy Initiation

Annual Review of Biochemistry - Tập 86 Số 1 - Trang 225-244 - 2017
James H. Hurley1, Lindsey N. Young1
1Department of Molecular and Cell Biology and California Institute of Quantitative Biosciences, University of California, Berkeley, California, and Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, California, 94720;

Tóm tắt

Autophagy is the process of cellular self-eating by a double-membrane organelle, the autophagosome. A range of signaling processes converge on two protein complexes to initiate autophagy: the ULK1 (unc51-like autophagy activating kinase 1) protein kinase complex and the PI3KC3–C1 (class III phosphatidylinositol 3-kinase complex I) lipid kinase complex. Some 90% of the mass of these large protein complexes consists of noncatalytic domains and subunits, and the ULK1 complex has essential noncatalytic activities. Structural studies of these complexes have shed increasing light on the regulation of their catalytic and noncatalytic activities in autophagy initiation. The autophagosome is thought to nucleate from vesicles containing the integral membrane protein Atg9 (autophagy-related 9), COPII (coat protein complex II) vesicles, and possibly other sources. In the wake of reconstitution and super-resolution imaging studies, we are beginning to understand how the ULK1 and PI3KC3–C1 complexes might coordinate the nucleation and fusion of Atg9 and COPII vesicles at the start of autophagosome biogenesis.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1016/j.jmb.2016.02.021

10.1146/annurev-biochem-060815-014556

10.1038/cdd.2012.72

10.1016/j.jmb.2016.02.004

10.1038/nrn3961

10.15252/embj.201490784

10.1016/j.cell.2011.10.026

10.1016/j.molcel.2014.03.009

10.1093/emboj/20.21.5971

10.1083/jcb.200803137

10.1038/nrm3696

10.1038/ncb2935

10.7554/eLife.08941

10.1038/ncb3215

10.1146/annurev-cellbio-092910-154005

10.1016/j.cell.2014.01.070

10.1016/j.sbi.2016.09.010

10.1016/j.molcel.2016.04.020

10.1016/j.cell.2011.06.022

10.1016/j.cell.2011.06.023

10.1016/j.tibs.2012.11.004

10.1016/j.jmb.2016.02.027

10.1016/j.ceb.2009.12.004

10.1016/j.ceb.2016.02.010

10.1016/j.jmb.2016.03.030

10.1074/jbc.M900573200

10.1091/mbc.e08-12-1248

10.1091/mbc.e08-12-1249

10.1083/jcb.200712064

10.1073/pnas.1220306110

10.1038/nsmb.3036

10.1080/15548627.2015.1076605

10.1016/j.str.2015.07.011

10.1038/nsmb.2822

10.1091/mbc.E04-11-1035

10.1091/mbc.E04-10-0894

10.1091/mbc.E04-08-0669

10.1016/j.bbrc.2009.09.034

10.1016/j.cell.2012.11.028

10.1042/BJ20101894

10.1021/cb500835z

10.1534/genetics.110.116566

10.4161/auto.6.8.13849

10.1016/j.molcel.2015.06.009

10.1016/j.devcel.2016.06.015

10.1016/j.molcel.2015.11.001

10.1073/pnas.1407214111

10.1038/ncomms10338

10.1083/jcb.150.6.1507

10.1016/j.tcb.2014.03.003

10.1128/MCB.01344-09

10.1038/emboj.2012.225

10.1080/15548627.2015.1068488

10.1038/ncb2329

10.4161/auto.7.6.15123

10.1126/science.1196371

10.1038/ncb2152

10.1073/pnas.1100844108

10.4161/auto.20586

10.1038/ncb3101

10.1111/j.1365-2443.2007.01050.x

10.1128/MCB.01082-08

10.1074/jbc.M112.378109

10.1073/pnas.1421092112

10.1111/j.1365-2443.2009.01299.x

10.1073/pnas.1302337110

10.1074/jbc.M112.411454

10.1038/nature09204

10.15252/embj.201592695

10.15252/embj.201694401

10.1016/j.molcel.2013.12.011

10.1016/j.molcel.2015.05.031

10.1038/ncb2757

10.1083/jcb.201002100

10.1371/journal.pgen.1004987

10.1002/embr.201438501

10.1091/mbc.E02-07-0413

10.1091/mbc.e07-08-0826

10.1016/j.tcb.2013.07.008

10.1016/j.str.2015.02.012

10.4161/auto.7.12.18027

10.1042/BCJ20160170

10.1083/jcb.152.3.519

10.1091/mbc.e08-01-0080

10.1074/jbc.273.35.22284

10.1091/mbc.E05-09-0841

10.1073/pnas.0810452105

10.1038/ncb1846

10.1038/ncb1854

10.1126/science.1184429

10.1038/ncomms1648

10.1074/jbc.M112.348250

10.1038/cr.2012.24

10.1021/bi900621w

10.7554/eLife.05115

10.1126/science.aac7365

10.1073/pnas.1016472108

10.1038/nsmb1194

10.1016/j.bpj.2012.11.3837

10.1083/jcb.129.2.321

10.1042/BJ20140515

10.1038/ncomms4920

10.1074/jbc.M114.561134

10.1083/jcb.201304123

10.1080/15548627.2016.1226736

10.1073/pnas.1603650113

10.1074/jbc.M700492200

10.1016/j.cell.2005.07.002

10.1038/nature05925

10.15252/embj.201592864

10.7554/eLife.05289

10.1016/j.cell.2012.12.016

10.1074/jbc.M115.704908

10.1038/ncomms9048

10.1038/embor.2008.246

10.1016/j.cell.2013.08.015

10.4161/auto.26058

10.1126/science.1225967

10.1083/jcb.200912089

10.1083/jcb.201202061

10.1091/mbc.e13-07-0381

10.1016/j.ceb.2014.02.005

10.1038/nrm3588

10.1038/ncb1991

10.4161/auto.5.8.10274

10.1080/15548627.2015.1017178

10.1128/JB.182.8.2125-2133.2000

10.1083/jcb.148.3.465

10.1091/mbc.E08-05-0544

10.1016/j.cell.2013.08.044

10.1016/S1534-5807(03)00402-7

10.1242/jcs.03172

10.1091/mbc.E09-11-0969

10.1242/jcs.131318

10.1242/jcs.094110

10.1074/jbc.M102346200

10.1074/jbc.M102342200

10.1016/j.cub.2014.04.048

10.1080/15548627.2016.1157237

10.1091/mbc.E11-09-0746

10.1016/j.tcb.2013.01.005

10.1091/mbc.12.11.3690

10.1083/jcb.201408075

10.1016/j.celrep.2016.01.047

10.1073/pnas.1000063107

10.1073/pnas.1316356110

10.7554/eLife.00947

10.7554/eLife.04135

10.1016/j.molcel.2015.09.010

10.1038/ncomms12420

10.1016/j.sbi.2016.08.006