HLA‐DQ lại tiếp tục ghi điểm: Nghiên cứu liên kết toàn bộ gen xác nhận thêm HLA‐DQ trong chẩn đoán hen suyễn ở người lớn

Clinical and Experimental Allergy - Tập 42 Số 12 - Trang 1724-1733 - 2012
Jessica Lasky‐Su1,2, Blanca E. Himes2,3, Benjamin A. Raby1,2,4, Barbara J. Klanderman2, Jody S. Sylvia2, Christoph Lange1,5, Erik Melén6,2,7, Fernando D. Martínez8, Elliot Israel4, James Gauderman9, Frank D. Gilliland9, Patrick Sleiman10, Hákon Hákonarson10, Juan C. Celedón11, M. E. Soto‐Quiros12, Lydiana Ávila12, J J Lima13, Charles G. Irvin14, Stephen P. Peters15, Homer A. Boushey16, Vernon M. Chinchilli17, D. Mauger17, Kelan G. Tantisira1,2,4, Scott T. Weiss1,2,4,3
1Center for Genomic Medicine, Department of Medicine, Brigham and Women's Hospital, Boston, MA, USA
2Channing Laboratory, Department of Medicine, Brigham and Women's Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA, USA
3Partners Center for Personalized Genetic Medicine, Partners Health Care, Boston, MA, USA
4Division of Pulmonary and Critical Care Medicine, Department of Medicine, Brigham and Women's Hospital, Boston, MA, USA
5Department of Biostatistics, Harvard School of Public Health, Boston, MA USA
6Astrid Lindgren Children’s Hospital, Karolinska University Hospital, Stockholm, Sweden
7Institute of Environmental Medicine, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
8Respiratory Sciences Center, University of Arizona, Tuscon, AZ, USA
9Department of Preventive Medicine, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, CA, USA
10The Joseph Stokes Jr. Research Institute, The Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, USA
11Division of Pediatric Pulmonary Medicine, Allergy and Immunology, University of Pittsburgh School of Medicine, Pittsburgh, PA, USA
12Division of Pediatric Pulmonology, Hospital Nacional de Niños, San José, Costa Rica
13Nemours Children's Clinic, Centers for Clinical Pediatric Pharmacology & Pharmacogenetics, Jacksonville, FL, USA
14Vermont Lung Center, Department of Medicine and Physiology, University of Vermont, Burlington, VT, USA
15Center for Genomics and Personalized Medicine Research, Section on Pulmonary, Critical Care, Allergy and Immunologic Diseases, Wake Forest University School of Medicine, Winston Salem, NC, USA
16Division of Pulmonary/Critical Care and Allergy/Immunology, Department of Medicine, University of California at San Francisco, San Francisco, CA, USA
17Department of Biostatistics, Penn State College of Medicine, Hershey, PA, USA

Tóm tắt

Tóm tắtGiới thiệu

Hen suyễn là một bệnh hô hấp mãn tính phổ biến ở trẻ em và người lớn. Một yếu tố di truyền quan trọng ảnh hưởng đến nguy cơ mắc hen suyễn đã được nhận diện từ lâu, mới đây thông qua việc xác định nhiều gen (ví dụ: ORMDL3, PDE4D, HLA‐DQ, và TLE4) thông qua các nghiên cứu liên kết toàn bộ gen.

Mục tiêu

Xác định các biến thể di truyền liên quan đến trạng thái mắc hen suyễn bằng cách sử dụng dữ liệu nghiên cứu liên kết toàn bộ gen.

Phương pháp

Chúng tôi mô tả kết quả từ một nghiên cứu liên kết toàn bộ gen về hen suyễn được thực hiện trên 3855 đối tượng, sử dụng một bảng các 455 089 biến thể đơn nucleotide (SNPs).

Kết quả

Nghiên cứu liên kết toàn bộ gen đã dẫn đến việc ưu tiên 33 biến thể cho theo dõi ngay lập tức trong một nỗ lực tái lập nhiều giai đoạn. Trong số này, một biến thể phổ biến (rs9272346) nằm trong khoảng 1 Kb của HLA‐DQA1 (nhiễm sắc thể 6p21.3) có liên quan đến hen suyễn ở người lớn (P‐giá trị = 2.2E‐08) với bằng chứng nhất quán trong nhóm người lớn và trẻ em đa dạng hơn (P‐giá trị = 1.0E‐04). Hơn nữa, một số gen đã được xác định trong các GWAS hen suyễn trước đây cũng có liên quan đến hen suyễn trong quần thể của chúng tôi.

Kết luận

Tổng thể, các phát hiện của chúng tôi càng khẳng định thêm vùng HLA‐DQ trong bệnh sinh của hen suyễn. HLA‐DQA1 là thành viên thứ tư của gia đình HLA được phát hiện có liên quan đến hen suyễn, bên cạnh các biến thể đã được xác định trước đó là HLA‐DRA, HLA‐DQB1 và HLA‐DQA2.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1002/gepi.20182

10.1111/j.1398-9995.2008.01873.x

10.1164/rccm.200711-1644OC

10.1016/j.jaci.2008.06.041

10.1016/j.ajhg.2009.04.006

10.1371/journal.pgen.1000623

10.1016/j.jaci.2009.08.031

Li X, 2010, Genome‐wide association study of asthma identifies RAD50‐IL13 and HLA‐DR/DQ regions, J Allergy Clin Immunol, 125, e311

10.1056/NEJMoa0901867

10.1056/NEJMoa0906312

10.1086/521200

10.1111/j.1398-9995.2007.01377.x

Gao J, 2003, Association between HLA‐DQA1, ‐DQB1 gene polymorphisms and susceptibility to asthma in northern Chinese subjects, Chin Med J (Engl), 116, 1078

Movahedi M, 2008, Association of HLA class II alleles with childhood asthma and Total IgE levels, Iran J Allergy Asthma Immunol, 7, 215

Torgerson DG, 2011, Nature genetics, 887

10.1038/ejhg.2010.191

10.1016/j.jaci.2009.11.018

DeWan A, 2010, PDE11A associations with asthma: results of a genome‐wide association scan, J Allergy Clin Immunol, 126, e879

10.1016/j.jaci.2009.08.031

10.1038/ng0710-558

10.1016/j.jaci.2012.03.020

10.1016/S0197-2456(98)00044-0

10.1056/NEJM200010123431501

10.1056/NEJMoa1001278

10.1016/j.jaci.2004.11.014

Sutherland ER, 2009, Body mass index and phenotype in subjects with mild‐to‐moderate persistent asthma, J Allergy Clin Immunol, 123, e1321

10.1067/mai.2002.122635

10.1038/ng.201

10.1086/519795

10.1093/bioinformatics/17.8.742

10.1038/ng1847

Liptak T, 1958, On the combination of independent tests, Magyar Tud. Akad. Mat. Kutato’ Int.Ko'zl, 3, 171

10.1016/j.ajhg.2010.02.019

10.1164/ajrccm.149.1.8111601

Gao J, 2002, Relationship between HLA‐DQA1, ‐DQB1 genes polymorphism and susceptilibity to bronchial asthma among Northern Hans, Zhonghua Yi Xue Za Zhi, 82, 379

Guo X, 2001, Association between asthma and the polymorphism of HLA‐DQ genes, Zhonghua Jie He He Hu Xi Za Zhi, 24, 139

10.1046/j.1365-2222.1999.00461.x

10.1097/00005537-200003000-00017

10.1111/j.1399-0039.2005.00392.x

10.1038/jhg.2008.5

10.1086/427763

10.1186/1476-7961-8-5

10.1016/j.clim.2011.02.012

10.1016/j.ajhg.2008.01.018

Thông tin
Thông tin xuất bản

Clinical and Experimental Allergy

Tập 42 Số 12

1724-1733

Thông tin tác giả