Mammalian Biology

Population size, one of the basic biological parameters is particularly difficult to estimate for nocturnal animals with cryptic life style and little individual distinctiveness like Eurasian otters (Lutra lutra). Because telemetric methods often fail and also expose the animals to a high risk of injuries and even mortality, we analysed DNA and hormones of spraints to obtain data on population density and structure of free-living otters in a Nature Park in north-eastern Germany. We were able to assign 53 different individual profiles from faecal samples and obtained six more profiles from animals found dead inside the park. The total population estimate (n = 59) consisted of at least 32 males and 27 females; 33 animals were adult, 23 younger than 2 years (three of unknown age). Marking points were frequented by up to 12 individuals. Estimated density was one animal per 4.7 km of shoreline. The genotypically estimated total population size was more than 2.5 times as high as estimated in the past census. The method was also suited to compare otter population densities in different areas or at different times in the same area.

The Arabian tahr (Arabitragus jayakari) occurs only in the mountains of northern Oman and the United Arab Emirates. The species is classified as Endangered due to its small declining population. In this study, we combined genetic and landscape ecology techniques in order to inform landscape scale conservation and genetic management of Arabian tahr. Using 540 base pairs of mitochondrial control region in a dataset of 53 samples, we found eight haplotypes, which fell into two haplogroups. Population genetic analysis using a panel of 14 microsatellite loci also showed a weak, but significant division. Analyses of landscape connectivity supported the genetic results showing poor connectivity between populations in the far south of the study area and those in the north. The most likely location of corridors connecting Arabian tahr populations were identified. Many corridors between tahr populations are impeded by multi-lane highways and restoration of these connections is required to maintain population viability of Arabian tahr. Owing to limited genetic samples outside of Wadi Sareen, further sampling is needed to elucidate both mtDNA and the nuclear structure of Arabian tahr more fully. Our study provides a toolkit that may be used for future genetic and connectivity monitoring of the Arabian tahr population.

In the past century the Italian wolf has been repeatedly indicated as a distinct subspecies, Canis lupus italicus, due to its unique morphology and its distinctive mtDNA control region (CR) monomorphism. However, recent studies on wolf x dog hybridization in Italy documented the presence of a second mtDNA CR haplotype (W16), previously found only in wolves from Eastern Europe, casting doubts on the genetic uniqueness of the Italian wolves. To test whether this second haplotype belongs to the Italian wolf population, we genotyped 92 wolf DNA samples from Italy, Slovenia, Greece and Bulgaria at four mtDNA regions (control-region, ATP6, COIII and ND4 genes) and at 39 autosomal microsatellites. Results confirm the presence of two mtDNA multi-fragment haplotypes (WH14 and WH19) in the Italian wolves, distinct from all the other European wolves. Network analyses of the multi-fragment mtDNA haplotypes identified two strongly differentiated clades, with the Italian wolf WH14 and WH19 multi-fragment haplotypes rooted together. Finally, Bayesian clustering clearly assigned all the wolves sampled in Italy to the Italian population, regardless of the two different multi-fragment haplotypes. These results demonstrate that the W16 CR haplotype is part of the genetic pool of the Italian wolf population, reconfirming its distinctiveness from other European wolves. Overall, considering the presence of unique mtDNA and Y-linked haplotypes, the sharply different frequencies of genome-wide autosomal alleles and the distinct morphological features of Italian wolves, we believe that this population should be considered a distinct subspecies.

Nguy cơ tử vong của động vật ăn thịt lớn do các nguyên nhân từ con người tăng cao ở những khu vực có tần suất gặp gỡ giữa con người và động vật ăn thịt cao. Việc tái định cư là một công cụ tiềm năng nhằm giảm thiểu những xung đột này và tái thiết lập quần thể hoang dã. Xác định các địa điểm tái định cư phù hợp cho hổ là rất quan trọng để bảo đảm tương lai của chúng. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã đánh giá định lượng tính khả thi của môi trường sống trong một khu vực tái định cư cho hổ trên bán đảo Kampar, một cảnh quan đất than bùn lớn ở Sumatra. Cảnh quan này là thiết yếu cho việc bảo tồn quần thể hổ địa phương, nhưng vai trò của nó như một môi trường sống cho hổ ít được điều tra. Chúng tôi đã tiến hành nghiên cứu này trong một khu vực có nhiều loại hình sử dụng đất ôm trọn một diện tích 7.045,89 km2. Chúng tôi áp dụng phân tích yếu tố sinh thái học của sinh vật (ENFA) để mô hình hóa tính khả thi của môi trường sống bằng cách sử dụng dữ liệu hiện diện của loài và các biến sinh thái địa lý làm cơ sở. Mô hình dự đoán rằng khoảng 60% diện tích nghiên cứu là môi trường sống phù hợp cho hổ với các mức độ khả thi khác nhau. Các đặc điểm môi trường sống của hổ trong khu vực nghiên cứu không giống với các đặc điểm môi trường sống của hổ toàn cầu, và giá trị chuyên môn cao thu được cho thấy rằng hổ sinh sống trong những môi trường rất hẹp. Xét đến mật độ thấp của hổ trong các khu vực đất than bùn, chúng tôi ước tính rằng sức chứa của toàn bộ cảnh quan Kampar khoảng 13 con hổ. Do đó, để bảo tồn một quần thể hổ khả thi, cần thiết duy trì sự kết nối giữa các vùng đất than bùn Kampar và cảnh quan Kerumutan nằm ở phía nam bán đảo Kampar.