Intervirology

Việc phát hiện sớm các đột biến kháng virus là rất quan trọng trong lâm sàng đối với bệnh nhân đang nhận điều trị kháng virus. Xét nghiệm lý tưởng cần nhạy, cụ thể, chính xác, có thể tái tạo và dễ thực hiện, đạt được thông lượng cao và có khả năng phát hiện các đột biến hỗn hợp cũng như đột biến mới. Các lợi thế và nhược điểm của các kỹ thuật giải trình tự, xét nghiệm dò đường, công nghệ chip DNA, biện pháp chèn axit peptide nucleic, lai ghép hai đầu dò huỳnh quang và một kỹ thuật mới dựa trên phân tích khối phổ dựa trên bay hơi/ion hóa ma trận sẽ được thảo luận.

Since the isolation of the first giant virus, the Mimivirus, by T.J. Rowbotham in a cooling tower in Bradford, UK, and after its characterisation by our group in 2003, we have continued to develop novel strategies to isolate additional strains. By first focusing on cooling towers using our original time-consuming procedure, we were able to isolate a new lineage of giant virus called Marseillevirus and a new Mimivirus strain called Mamavirus. In the following years, we have accumulated the world's largest unique collection of giant viruses by improving the use of antibiotic combinations to avoid bacterial contamination of amoeba, developing strategies of preliminary screening of samples by molecular methods, and using a high-throughput isolation method developed by our group. Based on the inoculation of nearly 7,000 samples, our collection currently contains 43 strains of Mimiviridae (14 in lineage A, 6 in lineage B, and 23 in lineage C) and 17 strains of Marseilleviridae isolated from various environments, including 3 of human origin. This study details the procedures used to build this collection and paves the way for the high-throughput isolation of new isolates to improve the record of giant virus distribution in the environment and the determination of their pangenome.