Các biến dị di truyền của XPD, APE1 và MUTYH làm tăng nguy cơ ung thư đầu và cổ: ảnh hưởng của tương tác giữa các gen và môi trường

Tumor Biology - Tập 36 - Trang 7569-7579 - 2015
Sambuddha Das1, Aditi Bhowmik, Abhinandan Bhattacharjee2, Biswadeep Choudhury3, Momota Naiding4, Agniv Kr. Laskar1, Sankar Kumar Ghosh1, Yashmin Choudhury
1Department of Biotechnology, Assam University, Silchar, India
2Department of ENT, Silchar Medical College and Hospital, Silchar, India
3Department of Biochemistry, Silchar Medical College and Hospital, Silchar, India
4Department of Pathology, Silchar Medical College and Hospital, Silchar, India

Tóm tắt

Trong nghiên cứu hiện tại, chúng tôi đã điều tra ảnh hưởng của các biến dị gen sửa chữa DNA XPD Asp312Asn (G>A), APE1 Asp148Glu (T>G) và MUTYH Tyr165Cys (G>A) đến nguy cơ ung thư đầu và cổ (HNC) có liên quan đến việc sử dụng thuốc lá trong một quần thể ở Đông Bắc Ấn Độ. Đối tượng nghiên cứu bao gồm 80 bệnh nhân HNC và 92 đối chứng khỏe mạnh. Phương pháp genotyping được thực hiện bằng cách sử dụng hệ thống PCR kháng thể biến đổi (ARMS-PCR) cho XPD Asp312Asn (G>A) và PCR sử dụng hai cặp mồi đối kháng (PCR-CTPP) cho APE1 Asp148Glu (T>G) và MUTYH Tyr165Cys (G>A). Genotype XPD Asp/Asn làm tăng nguy cơ mắc HNC gấp 2 lần (tỉ lệ odds, OR = 2.072; 95% CI, 1.025–4.190; p < 0.05). Tương tác giữa gen APE1 Asp/Asp và XPD Asp/Asn cũng như giữa genotypes MUTYH Tyr/Tyr và XPD Asp/Asn làm tăng nguy cơ lần lượt thêm gấp 2.9 (OR = 2.97; 95% CI, 1.16–7.61; p < 0.05) và 2.3 (OR = 2.37; 95% CI, 1.11–5.10; p < 0.05). Nguy cơ này còn tăng cao hơn ở những người hút thuốc nặng với genotype XPD Asp/Asn và những người nhai thuốc lá nặng với genotype XPD Asn/Asn lần lượt gấp 7.7 (OR = 7.749; 95% CI, 2.53–23.70; p < 0.05) và 10 lần (OR = 10; 95% CI, 1.26–79.13; p < 0.05). Do đó, chúng tôi kết luận rằng các biến dị XPD Asp312Asn và APE1 Asp148Glu làm tăng nguy cơ mắc HNC có liên quan đến việc hút thuốc và/hoặc nhai thuốc lá trong quần thể nghiên cứu.

Từ khóa

#ung thư đầu và cổ #biến dị gen #tương tác gen-gene #tương tác gen-môi trường #thuốc lá

Tài liệu tham khảo

Jemal A, Tiwari RC, Murray T, Ghafoor A, Samuels A, Ward E, et al. Cancer statistics, 2004. CA Cancer J Clin. 2004;54(1):8–29. Sharma A, Madan R, Kumar R, Sagar P, Kamal VK, Thakar A, et al. Compliance to therapy-elderly head and neck carcinoma patients. Can Geriatr J. 2014;17(3):83–7. doi:10.5770/cgj.17.101. Kim MM, Califano JA. Molecular pathology of head-and-neck cancer. Int J Cancer. 2004;112(4):545–53. doi:10.1002/ijc.20379. Wissinger E, Griebsch I, Lungershausen J, Foster T, Pashos CL. The economic burden of head and neck cancer: a systematic literature review. Pharmacoeconomics. 2014;32(9):865–82. doi:10.1007/s40273-014-0169-3. Kaur J, Srivastava A, Ralhan R. Overexpression of p53 protein in betel- and tobacco-related human oral dysplasia and squamous-cell carcinoma in India. Int J Cancer. 1994;58(3):340–5. Vassallo R, Kroening PR, Parambil J, Kita H. Nicotine and oxidative cigarette smoke constituents induce immune-modulatory and pro-inflammatory dendritic cell responses. Mol Immunol. 2008;45(12):3321–9. doi:10.1016/j.molimm.2008.04.014. Khariwala SS, Hatsukami D, Hecht SS. Tobacco carcinogen metabolites and DNA adducts as biomarkers in head and neck cancer: potential screening tools and prognostic indicators. Head Neck. 2012;34(3):441–7. doi:10.1002/hed.21705. Hoeijmakers JH. Nucleotide excision repair. II: from yeast to mammals. Trends Genet. 1993;9(6):211–7. Hussien YM, Gharib AF, Awad HA, Karam RA, Elsawy WH. Impact of DNA repair genes polymorphism (XPD and XRCC1) on the risk of breast cancer in Egyptian female patients. Mol Biol Rep. 2012;39(2):1895–901. doi:10.1007/s11033-011-0935-7. Markkanen E, Dorn J, Hubscher U. MUTYH DNA glycosylase: the rationale for removing undamaged bases from the DNA. Front Genet. 2013;4:18. doi:10.3389/fgene.2013.00018. Li Q, Wang JM, Peng Y, Zhang SH, Ren T, Luo H, et al. Association of DNA base-excision repair XRCC1, OGG1 and APE1 gene polymorphisms with nasopharyngeal carcinoma susceptibility in a Chinese population. Asian Pac J Cancer Prev. 2013;14(9):5145–51. Hadi MZ, Coleman MA, Fidelis K, Mohrenweiser HW, Wilson 3rd DM. Functional characterization of APE1 variants identified in the human population. Nucleic Acids Res. 2000;28(20):3871–9. Ito H, Matsuo K, Hamajima N, Mitsudomi T, Sugiura T, Saito T, et al. Gene-environment interactions between the smoking habit and polymorphisms in the DNA repair genes, APE1 Asp148Glu and XRCC1 Arg399Gln, in Japanese lung cancer risk. Carcinogenesis. 2004;25(8):1395–401. doi:10.1093/carcin/bgh153. Marra G, Jiricny J. Multiple colorectal adenomas—is their number up? N Engl J Med. 2003;348(9):845–7. doi:10.1056/NEJMe030002. Sliwinski T, Przybylowska K, Markiewicz L, Rusin P, Pietruszewska W, Zelinska-Blizniewska H, et al. MUTYH Tyr165Cys, OGG1 Ser326Cys and XPD Lys751Gln polymorphisms and head neck cancer susceptibility: a case control study. Mol Biol Rep. 2011;38(2):1251–61. doi:10.1007/s11033-010-0224-x. Laine JP, Mocquet V, Bonfanti M, Braun C, Egly JM, Brousset P. Common XPD (ERCC2) polymorphisms have no measurable effect on nucleotide excision repair and basal transcription. DNA Repair (Amst). 2007;6(9):1264–70. doi:10.1016/j.dnarep.2007.02.010. Shen MR, Jones IM, Mohrenweiser H. Nonconservative amino acid substitution variants exist at polymorphic frequency in DNA repair genes in healthy humans. Cancer Res. 1998;58(4):604–8. Buch S, Zhu B, Davis AG, Odom D, Siegfried JM, Grandis JR, et al. Association of polymorphisms in the cyclin D1 and XPD genes and susceptibility to cancers of the upper aero-digestive tract. Mol Carcinog. 2005;42(4):222–8. doi:10.1002/mc.20086. Bhattacharjee A, Chakraborty A, Purkaystha P. Prevalence of head and neck cancers in the north east—an institutional study. Indian J Otolaryngol Head Neck Surg. 2006;58(1):15–9. doi:10.1007/BF02907731. Albarino CG, Romanowski V. Phenol extraction revisited: a rapid method for the isolation and preservation of human genomic DNA from whole blood. Mol Cell Probes. 1994;8(5):423–7. doi:10.1006/mcpr.1994.1060. Stephenson FH. Calculations for molecular biology and biotechnology: a guide to mathematics in the laboratory 2e. Academic Press; 2010. Wasson MK, Chauhan PS, Singh LC, Katara D, Dev Sharma J, Zomawia E, et al. Association of DNA repair and cell cycle gene variations with breast cancer risk in Northeast Indian population: a multiple interaction analysis. Tumour Biol. 2014;35(6):5885–94. doi:10.1007/s13277-014-1779-2. Olar A, Wani KM, Sulman EP, Mansouri A, Zadeh G, Wilson CD, et al. Mitotic index is an independent predictor of recurrence-free survival in meningioma. Brain Pathol. 2014. doi:10.1111/bpa.12174. Stanczyk M, Sliwinski T, Cuchra M, Zubowska M, Bielecka-Kowalska A, Kowalski M, et al. The association of polymorphisms in DNA base excision repair genes XRCC1, OGG1 and MUTYH with the risk of childhood acute lymphoblastic leukemia. Mol Biol Rep. 2011;38(1):445–51. doi:10.1007/s11033-010-0127-x. Shen E, Liu C, Wei L, Hu J, Weng J, Yin Q, et al. The APE1 Asp148Glu polymorphism and colorectal cancer susceptibility: a meta-analysis. Tumour Biol. 2014;35(3):2529–35. doi:10.1007/s13277-013-1334-6. Chen W, Wang Q, Liu M, Ding XB. The association of APE1 Asp148Glu gene polymorphisms and lung cancer risk: an updated meta-analysis. Tumour Biol. 2014;35(4):3597–603. doi:10.1007/s13277-013-1474-8. Duan XL, Gong H, Zeng XT, Ni XB, Yan Y, Chen W, et al. Association between XPD Asp312Asn polymorphism and esophageal cancer susceptibility: a meta-analysis. Asian Pac J Cancer Prev. 2012;13(7):3299–303. Wu KG, He XF, Li YH, Xie WB, Huang X. Association between the XPD/ERCC2 Lys751Gln polymorphism and risk of cancer: evidence from 224 case–control studies. Tumour Biol. 2014. doi:10.1007/s13277-014-2379-x. Zhai R, Chen F, Liu G, Su L, Kulke MH, Asomaning K, et al. Interactions among genetic variants in apoptosis pathway genes, reflux symptoms, body mass index, and smoking indicate two distinct etiologic patterns of esophageal adenocarcinoma. J Clin Oncol. 2010;28(14):2445–51. doi:10.1200/JCO.2009.26.2790. Choudhury JH, Choudhury B, Kundu S, Ghosh SK. Combined effect of tobacco and DNA repair genes polymorphisms of XRCC1 and XRCC2 influence high risk of head and neck squamous cell carcinoma in Northeast Indian population. Med Oncol. 2014;31(8):67. doi:10.1007/s12032-014-0067-8.