Tại sao bạn lại tự đánh mình? Chẩn đoán tự miễn đơn gen bằng giải trình tự toàn bộ exome

Journal of Genetics - Tập 102 - Trang 1-7 - 2023
Lina M. Castano-Jaramillo1,2, Francisco Rivas Larrauri1, Selma C. Scheffler-Mendoza1, Alonso Gutierrez-Hernandez1, Juan Carlos Bustamante Ogando1,3, Paulina Colin4, Margarita Ortega Cisneros4, Sandra Rajme-López5, Edgar Alejandro Medina-Torres3, Laura Berron Ruiz3, Ana Luisa Rodriguez-Lozano1, Sara Elva Espinosa Padilla3, Marco Antonio Yamazaki-Nakashimada1, Saul O. Lugo Reyes3
1Clinical Immunology Department, Instituto Nacional de Pediatria, Mexico City, Mexico
2HOMI Fundacion Hospital Pediatrico la Misericordia, Bogota, Colombia
3Immune Deficiencies Laboratory, National Institute of Pediatrics, Mexico City, Mexico
4Hospital de Especialidades del Centro Medico Nacional de Occidente IMSS, Guadalajara, Mexico
5Infectious Diseases Department, National Institute of Medical Sciences and Nutrition “Dr Salvador Zubiran”, Mexico City, Mexico

Tóm tắt

Các rối loạn bẩm sinh của miễn dịch có thể xuất hiện với tự miễn dịch và tự viêm như những biểu hiện lâm sàng đặc trưng. Chúng tôi đã đặt mục tiêu xác định nguyên nhân đơn gen tiềm ẩn của các rối loạn tự miễn ở 26 bệnh nhân từ một bệnh viện nhi khoa tham chiếu tại Mexico thông qua giải trình tự toàn bộ exome. Chúng tôi đã chọn lọc cụ thể những bệnh nhân có tiền sử gia đình mắc các bệnh tự miễn, triệu chứng khởi phát sớm, và các rối loạn tự miễn khó kiểm soát hoặc tự miễn liên quan đến xu hướng nhiễm trùng. Chúng tôi đã xác định được các biến thể di truyền tương thích với kiểu hình của bệnh nhân ở 54% trong số các bệnh nhân. Các bệnh tự miễn thường do sự kết hợp của các yếu tố di truyền, nhưng các trường hợp xuất hiện ở độ tuổi trẻ thường kháng trị hoặc xuất hiện theo cụm, cũng như sự hiện diện của các triệu chứng tự miễn song song với các bệnh nhiễm trùng nên dấy lên nghi ngờ về một rối loạn bẩm sinh tiềm tàng của miễn dịch.

Từ khóa

#tự miễn dịch #giải trình tự exome #rối loạn bẩm sinh của miễn dịch #biến thể di truyền #bệnh tự miễn

Tài liệu tham khảo

Alarcón-Segovia D., Alarcón-Riquelme M. E., Cardiel M. H., Caeiro F., Massardo L., Villa A. R. et al. 2005 Familial aggregation of systemic lupus erythematosus, rheumatoid arthritis, and other autoimmune diseases in 1,177 lupus patients from the GLADEL cohort. Arthritis Rheum. 52, 1138–1147. Almlöf J. C., Nystedt S., Leonard D., Eloranta M.-L., Grosso G., Sjöwall C. et al. 2019 Whole-genome sequencing identifies complex contributions to genetic risk by variants in genes causing monogenic systemic lupus erythematosus. Hum. Genet. 138, 141–150. Alperin J. M., Ortiz-Fernández L. and Sawalha A. H. 2018 Monogenic lupus: a developing paradigm of disease. Front. Immunol. 9, 2496. Arango M.-T., Shoenfeld Y., Cervera R. and Anaya J.-M. 2013 Infection and autoimmune diseases. In Autoimmunity: from bench to bedside [Internet] El Rosario University Press, Bogota. Bousfiha A. A., Jeddane L., Ailal F., Benhsaien I., Mahlaoui N., Casanova J.-L. et al. 2013 Primary immunodeficiency diseases worldwide: more common than generally thought. J. Clin. Immunol. 33, 1–7. Bousfiha A., Jeddane L., Picard C., Al-Herz W., Ailal F., Chatila T. et al. 2020 Human inborn errors of immunity: 2019 update of the IUIS phenotypical classification. J. Clin. Immunol. 40, 66–81. Carneiro-Sampaio M. and Coutinho A. 2015 Early-onset autoimmune disease as a manifestation of primary immunodeficiency. Front. Immunol. 6, 185. Castley A. S. L. and Martinez O. P. 2012 Molecular analysis of complement component C4 gene copy number. Methods Mol. Biol. 882, 159–171. Ceccarelli F., Agmon-Levin N. and Perricone C. 2016 Genetic factors of autoimmune diseases. J. Immunol. Res. 2016, e3476023. Costagliola G., Cappelli S. and Consolini R. 2021 Autoimmunity in primary immunodeficiency disorders: an updated review on pathogenic and clinical implications. J. Clin. Med. 10, 4729. Dasdemir S., Yildiz M., Celebi D., Sahin S., Aliyeva N., Haslak F. et al. 2022 Genetic screening of early-onset patients with systemic lupus erythematosus by a targeted next-generation sequencing gene panel. Lupus 31, 330–337. Delgado-Vega A. M., Martínez-Bueno M., Oparina N. Y., López Herráez D., Kristjansdottir H., Steinsson K. et al. 2018 Whole exome sequencing of patients from multicase families with systemic lupus erythematosus identifies multiple rare variants. Sci. Rep. 8, 8775. Gutierrez-Arcelus M., Rich S. S. and Raychaudhuri S. 2016 Autoimmune diseases - connecting risk alleles with molecular traits of the immune system. Nat. Rev. Genet. 17, 160–174. Han J.-W., Zheng H.-F., Cui Y., Sun L.-D., Ye D.-Q., Hu Z. et al. 2009 Genome-wide association study in a Chinese Han population identifies nine new susceptibility loci for systemic lupus erythematosus. Nat. Genet. 41, 1234–1237. Harley J. B. and James J. A. 2006 Epstein-Barr virus infection induces lupus autoimmunity. Bull. NYU Hosp. Jt. Dis. 64, 45–50. Harris V. M., Koelsch K. A., Kurien B. T., Harley I. T. W., Wren J. D., Harley J. B. et al. 2019 Characterization of cxorf21 provides molecular insight into female-bias immune response in SLE pathogenesis. Front. Immunol. 10, 2160. Hom G., Graham R. R., Modrek B., Taylor K. E., Ortmann W., Garnier S. et al. 2008 Association of systemic lupus erythematosus with C8orf13-BLK and ITGAM-ITGAX. N. Engl. J. Med. 358, 900–909. Houen G. and Trier N. H. 2021 Epstein-Barr virus and systemic autoimmune diseases. Front. Immunol. 11. International Consortium for Systemic Lupus Erythematosus Genetics (SLEGEN), Harley J. B., Alarcón-Riquelme M. E., Criswell L. A., Jacob C. O., Kimberly R. P. et al. 2008 Genome-wide association scan in women with systemic lupus erythematosus identifies susceptibility variants in ITGAM, PXK, KIAA1542 and other loci. Nat. Genet. 40, 204–210. Jacobson D. L., Gange S. J., Rose N. R. and Graham N. M. 1997 Epidemiology and estimated population burden of selected autoimmune diseases in the United States. Clin. Immunol. Immunopathol. 84, 223–243. Jain S., Ponda P., Moreau J., and Sison C. 2015 The prevalence of immune deficiency in patients with evans syndrome: a retrospective chart review study. J. Allergy Clini. Immunol. 135, AB182. Jeong D. C. 2018 Monogenic autoimmune diseases. J. Rheum. Dis. 25, 213–220. Lee W.-F., Fan W.-L., Tseng M.-H., Yang H.-Y., Huang J.-L. and Wu C.-Y. 2022 Characteristics and genetic analysis of patients suspected with early-onset systemic lupus erythematosus. Pediatr. Rheumatol. Online J. 20, 68. Liu K., Kurien B. T., Zimmerman S. L., Kaufman K. M., Taft D. H., Kottyan L. C. et al. 2016 X Chromosome dose and sex bias in autoimmune diseases: increased prevalence of 47, XXX in systemic lupus erythematosus and Sjögren’s syndrome. Arthritis Rheumatol. 68, 1290–1300. Lo M. S., Zurakowski D., Son M. B. F. and Sundel R. P. 2013 Hypergammaglobulinemia in the pediatric population as a marker for underlying autoimmune disease: a retrospective cohort study. Pediatr. Rheumatol. 11, 42. Martínez-Valdez L., Deyà-Martínez A., Giner M. T., Berrueco R., Esteve-Solé A., Juan M. et al. 2017 evans syndrome as first manifestation of primary immunodeficiency in clinical practice. J. Pediatr. Hematol. Oncol. 39, 490–494. McLaren W., Gil L., Hunt S. E., Riat H. S., Ritchie G. R. S., Thormann A. et al. 2016 The ensembl variant effect predictor. Genome Biol. 17, 122. Munroe M. E., Anderson J. R., Gross T. F., Stunz L. L., Bishop G. A. and James J. A. 2020 Epstein-Barr functional mimicry: pathogenicity of oncogenic latent membrane protein-1 in systemic lupus erythematosus and autoimmunity. Front. Immunol. 11, 606936. Robinson J. T., Thorvaldsdóttir H., Wenger A. M., Zehir A. and Mesirov J. P. 2017 Variant review with the integrative genomics viewer. Cancer Res. 77, e31–e34. Sandhu V. and Quan M. 2017 SLE and serum complement: causative, concomitant or coincidental? Open Rheumatol. J. 11, 113–122. Shearer W. T., Rosenblatt H. M., Gelman R. S., Oyomopito R., Plaeger S., Stiehm E. R. et al. 2003 Lymphocyte subsets in healthy children from birth through 18 years of age: the Pediatric AIDS Clinical Trials Group P1009 study. J. Allergy Clin. Immunol. 112, 973–980. Surace A. E. A. and Hedrich C. M. 2019 The role of epigenetics in autoimmune/inflammatory disease. Front. Immunol. 10. The International Federation of Clinical Chemistry and Laboratory Medicine - IFCC. Tirosh I., Spielman S., Barel O., Ram R., Stauber T., Paret G. et al. 2019 Whole exome sequencing in childhood-onset lupus frequently detects single gene etiologies. Pediatr. Rheumatol. 17, 52. Wang H. and Liu M. 2021 Complement C4, infections, and autoimmune diseases. Front. Immunol. 12, 694928. Webb R., Kelly J. A., Somers E. C., Hughes T., Kaufman K. M., Sanchez E. et al. 2011 Early disease onset is predicted by a higher genetic risk for lupus and is associated with a more severe phenotype in lupus patients. Ann. Rheum. Dis. 70, 151–156. Yang W., Shen N., Ye D.-Q., Liu Q., Zhang Y., Qian X.-X. et al. 2010 Genome-wide association study in Asian populations identifies variants in ETS1 and WDFY4 associated with systemic lupus erythematosus. PLoS Genet. 6, e1000841.