Kỹ thuật nhân bản cDNA mã hóa protein điều hòa phiên mã tương tác

Springer Science and Business Media LLC - Tập 17 - Trang 155-165 - 1993
S. C. Silver1, S. W. Hunt1,2
1Department of Microbiology and Immunology and the Thurston Arthritis Research Center, The University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, USA
2Department of Medicine, The University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, USA

Tóm tắt

Nhiều phương pháp nhằm phát hiện và nhân bản các protein điều hòa phiên mã tương tác đã được trình bày. Tất cả các kỹ thuật này có khả năng xác định một cách hiệu quả các tương tác cụ thể giữa hai protein phiên mã. Tuy nhiên, phương pháp nhân bản tương tác và hệ thống hai hybrid có ưu điểm bổ sung là tạo ra một trình tự cDNA biểu hiện trực tiếp. Các phương pháp khác, như nhân bản trung gian EMSA, đồng kết tủa miễn dịch, nhân bản hỗ trợ oligonucleotide/PCR, Southwestern và Farwestern, yêu cầu các thao tác bổ sung để thu được một clone cDNA. Rõ ràng, hệ thống nhân bản tương tác được lựa chọn sẽ phụ thuộc vào các protein đang được nghiên cứu.

Từ khóa

#protein điều hòa phiên mã #nhân bản cDNA #hệ thống hai hybrid #tính tương tác của protein #tương tác protein

Tài liệu tham khảo

Maniatis T, Goodbourn S & Fischer JA (1987) Science 236: 1237–1245 Korsmeyer SJ (1992) Annu. Rev. Immunol. 10: 785–807 Blau HM (1988) Cell 53: 673–674 Bishop JM (1991) Cell 64: 235–248 Lewin B (1991) Cell 64: 303–312 Varmus HE (1987) Science 238: 1337–1339 Gonczy P, Reith W, Barras E, Lisowska-Grospierre M, Griscella C, Adam MR & Mach B (1989) Mol. Cell. Biol. 9: 296–302 Reith W, Barras E, Satola S, Kobr M, Reinhart D, Sanchez CH & Mach B (1989) Proc. Natl. Acad. Sci USA 86: 4200–4204 Johnson PF & McKnight SL (1989) Annu. Rev. Biochem. 58: 799–839 Rosenfeld PJ & Kelly TJ (1986) J. Biol. Chem. 281: 1398–1408 Kadonaga JT & Tjian R (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83: 5889–5893 Singh H, LeBowitz JH, Baldwin AS Jr & Sharp PA (1988) Cell 52: 415–423 Singh H, Clerc RG & LeBowitz JH (1989) BioTechniques 7: 252. Sun X-H & Baltimore D (1991) Cell 64: 459–470 Lenardo MJ & Baltimore D (1989) Cell 58: 227–229 Blanar MA & Rutter WJ (1992) Science 256: 1014–1018 Macgregor PF, Abate C & Curran T (1990) Oncogene 5: 451–458 Blackwood EM & Eisenman RN (1991) Science 251: 1211–1217 Carlsten H, Nilsson LA & Tarkowski A (1986) Int. Arch. Allergy Appl. Immunol. 81: 322–325 Abate C, Luk D, Gentz R, Rauscher FJ III & Curran T (1990) Proc. Natl. Acad. Sci USA 87: 1032–1036 Fearon K & Mason TL (1992) J. Biol. Chem. 267: 5162–5170 Helfman DM, Feramisco JR, Fiddes JC, Thomas GP & Hughes SH (1983) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80: 31–35 Young RA & Davis RW (1983) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80: 1194–1198 Argango R, Adar R, Rozenblatt S & Sharon N (1992) Eur. J. Biochem. 205: 575–581 Pigiet VP & Schuster BJ (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83: 7643–7647 Fields S & Song O-K (1989) Nature 340: 245–246 Chien C, Bartel PL, Sternglanz R & Fields S (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 9578–9582 Golemis EA & Brent R (1992) Mol. Cell. Biol. 12: 3006–3014 Touchette N (1991) J. NIH Res. 3: 44–45 Hardy CFJ, Sussel L & Shore D (1992) Genes Devel. 6: 801–814 Yang X, Hubbard EJA & Carlson M (1992) Science 257: 680–682 Benezra R, Davis RL, Lockshon D, Turner DL & Weintraub H (1990) Cell 61: 49–59 Ruben SM, Dillon PJ, Schreck R, Henkel T, Chen C-H, Maher M, Baeuerle PA & Rosen CA (1991) Science 251: 1490–1493 Prendergast GC, Lawe D & Ziff EB (1991) Cell 65: 395–407 Pellegrino GR & Berg JM (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 671–675 Kao CC, Lieberman PM, Schmidt MC, Zhou Q, Pei R & Berk AJ (1990) Science 248: 1646–1650 Ausubel FM, Brent R, Kingston RE, Moore DD, Seidman JG, Smith JA & Struhl K (1990) Current Protocols in Molecular Biology. Greene Publishing Associated and Wiley-Interscience, New York Inostroza JA, Mermelstein FH, Ha I, Lane WS & Reinberg D (1992) Cell 70: 477–489 Halazonetis TD, Georgopoulos K, Greenberg ME & Leder P (1988) Cell 55: 917–924 Hope IA & Struhl K (1987) EMBO J. 6: 2781–2784 Dang CV, Barret J, Villa-Garcia M, Resar LMS, Kato GJ & Fearon ER (1991) Mol. Cell. Biol. 11: 954–962 Kaelin WG Jr, Pallas DC, DeCaprio JA, Kaye FJ & Livingston DM (1991) Cell 64: 521–532 Auwerx J & Sassone-Corsi P (1991) Cell 64: 983–993 Gillespie DAF & Eisenman RN (1989) Mol. Cell. Biol. 9: 865–868 Chittenden T, Livingston DM & Kaelin Jr WG (1991) Cell 65: 1073–1082 Hoeffler JP, Lustbader JW & Chen C (1991) Mol. Endocrinol. 5: 256–266 Briggs J, Kung VT, Gomez B, Kasper KC, Nagainis PA, Masino RS, Rice LS, Zuk RF & Ghazarossian VE (1990) BioTechniques 9: 598–606 Vinson CR, LaMarco KL, Johnson PF, Landschulz WH & McKnight SL (1988) Genes Devel. 2: 801–806