Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Mối Quan Hệ Cấu Trúc—Hoạt Động của Peptide Ile-Ala-Val-Pro và Các Dẫn Xuất của Nó Được Khám Phá Sử Dụng Phương Pháp Bán Thực Nghiệm AM1
Tóm tắt
Nhiều peptide với các tính chất hạ cholesterol đã được nghiên cứu nhằm làm rõ mối quan hệ giữa cấu trúc và hoạt động. Phương pháp bán thực nghiệm AM1 và động lực học phân tử đã được sử dụng để xác định các đặc tính cấu trúc chung của những peptide này. Một mô hình toán học về mối quan hệ giữa cấu trúc và hoạt động đã được xây dựng. Theo mô hình này, một phần kỵ nước của các peptide này là một yếu tố cấu trúc cần thiết cho hoạt động sinh học của chúng. Proline hoạt động như một thành phần quan trọng trong các hợp chất này.
Từ khóa
#peptide #mối quan hệ cấu trúc-hoạt động #cholesterol #phần kỵ nước #prolineTài liệu tham khảo
D. A. Eisenberg, Am. J. Med., 104, 2S (1998).
P. R. Hebert, J. M. Gaziano, K. S. Chan, and C. H. Hennekens, J. Am. Med. Assoc., 278, 313 (1997).
M. Nakanishi, J. L. Goldstrein, and M. S. Brown, J. Biol. Chem., 263, 8929 (1988).
T. E. Meigs, R. S. Roseman, and R. D. Simoni, J. Biol. Chem., 271, 7916 (1996).
T. E. Meigs and R. D. Simoni, J. Biol. Chem., 267, 13547 (1992).
E. S. Istvan and J. Deisenhofer, Biochem. Biophys. Acta, 1529, 9 (2000).
E. S. Istvan, M. Palnitkar, S. K. Buchanan, and J. Deisenhofer, EMBO J., 19, 819 (2000).
H. H. Cheng, L. Xu, H. Kumagai, and R. D. Simoni, J. Biol. Chem., 274, 17171 (1999).
R. V. Omkumar and V. W. Rodwell, J. Biol. Chem., 269, 16862 (1994).
R. V. Omkumar, B. G. Darnay, and V. W. Rodwell, J. Biol. Chem., 269, 6810 (1994).
Z. H. Beg, J. A. Stonic, and H. B. Brewer, Jr., J. Biol. Chem., 260, 1682 (1985).
Z. H. Beg, J. A. Stonic, and H. B. Brewer, Jr., J. Biol. Chem., 262, 13228 (1987).
A. Endo, J. Med. Chem., 28, 401 (1985).
A. M. Gotto, Jr., Am J. Cardiol., 79, 1663 (1997).
E. S. Istvan and J. Deisenhofer, Science, 292, 1160 (2001).
D. Toroser and S. C. Huber, Arch. Biochem. Biophys., 355, 291 (1998).
F. McTaggart, L. Buckett, R. Davidson, G. Holdgate, A. McCormick, D. Scheneck, et al., Am. J. Cardiol., 87, 28B (2001).
E. S. Istvan, Atheroscler. Suppl., 4, 3 (2003).
M. Yoshikawa, T. Yamamoto, and Y. Takenaka, Soy Prot. Res., 2, 125 (1995).
K. S. Kim, M. J. Kim, J. S. Park, H. S. Sohn, and D. Y. Kwon, Food Sci. Biotechnol., 12, 157 (2003).
D. Y. Kwon, S. W. Oh, J. S. Lee, H. J. Yang, S. H. Lee, J. H. Lee, Y. B. Lee, and H. S. Sohn, Food Sci. Biotechnol., 11, 55 (2002).
V. V. Pak, M. Koo, N. Lee, J. S. Lee, T. D. Kasimova, and D. Y. Kwon, Chem. Nat. Comp. (submitted).
M. J. S. Dewar, E. G. Zoebish, E. F. Healy, and J. J. P. Stewart, J. Am. Chem. Soc., 107, 3902 (1985).
V. V. Pak, M. Koo, T. D. Kasimova, and D. Y. Kwon, Chem. Nat. Comp., 4, 324 (2004).
M. I. Aguilar, S. Mougos, J. Boublik, J. Rivier, and M. T. W. Hearn, J. Chromatogr., 646, 53 (1993).
A. W. Purcell, M. I. Aguilar, and M. T. W. Hearn, J. Chromatogr., 593, 103 (1992).
E. Lazoura, I. Maidonis, E. Bayer, and M. T. W. Hearn, Biophys. J., 72, 238 (1997).
R. S. Hodges, B.-Y. Zhu, N. E. Zhou, and C. T. Mant, J. Chromatogr. A, 676, 3 (1994).
B. N. Rao, A. Kumar, H. Balaram, A. Ravi, and P. Balaram, J. Am. Chem. Soc., 105, 7423 (1983).
E. Benedetti, A. Christensen, C. Gilon, W. Fuller, and M. Goodman, Biopolymers, 15, 2523 (1976).
P. A. Kollman, Acc. Chem. Res., 29, 461 (1996).
D. Beeman, J. Comput. Phys., 20, 130 (1976).
P. N. Lewis, F. A. Momany, and H. A. Scheraga, Biochem. Biophys. Acta, 303, 211 (1973).
S. L. Akhnazarov and V. V. Kafarov, Optimization of Experiment in Chemistry and Chemical Technology [in Russian], Vysshaya Shkola, Moscow (1978), pp. 158–165.
R. B. Silverman, The Organic Chemistry of Drug Design and Drug Action, Academic Press, New York (1992), pp. 71–74.
M. A. Khaled, V. Renugopalakrishnan, and D. W. Urry, J. Am. Chem. Soc., 98, 7547 (1976).
G. Boussard, M. Marraud, and A. Aubry, Biopolymers, 18, 1297 (1979).
A. Aubry and M. Marraud, Acta Crystallogr., Sect. C: Cryst. Struct. Commun., 41, 65 (1985).
R. Bhattacharyya and P. Chakbarti, J. Mol. Biol., 331, 925 (2003).