Structural basis for the mechanism of inhibition of uridine phosphorylase from Salmonella typhimurium

Crystallography Reports - Tập 55 Số 1 - Trang 41-57 - 2010
A.A. Lashkov1, Н. Е. Жухлистова1, S.E. Sotnichenko1, Azat Gabdulkhakov1, A.M. Mikhailov1
1Shubnikov Institute of Crystallography, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia

Tóm tắt

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

N. Kemeny, Semin. Surg. Oncol. 3(3), 190 (1987).

M. Ligo, K. Nishikata, Y. Nakajiama, et al., Biochem. Pharmacol. 39(7), 1247 (1990).

S. Matsusaka, H. Yamasaki, M. Fukushima, and I. Wakabayashi, Chemotherapy 53(1), 36 (2007).

O. H. Temmink and M. de Bruin, Int. J. Biochem. Cell Biol. 38(10), 1759 (2006).

R. Yan, L. Wan, G. Pizzorno, and D. Caj, Front Biosci. 11, 2759 (2006).

M. H. Kouni, F. N. Naguib, J. G. Niedzwicki, et al., J. Biol. Chem. 263(13), 6081 (1988).

B. M. Jiménez, P. Kranz, C. S. Lee, et al., Biochem. Pharmacol. 38(21), 3785 (1989).

C. S. Lee, B. M. Jiménez, and W. J. O’sullivan, Mol. Biochem. Parasitol. 30(3), 271 (1988).

D. A. Beck and G. A. O’Donovan, Curr. Microbiol. 56(2), 162 (2008).

J. G. Niedzwicki, M. H. el Kouni, S. H. Chu, and S. Cha, Biochem. Pharmacol. 32(3), 399 (1983).

J. W. Choi, C. Y. Shin, M. S. Choi, et al., J. Neurotrauma 25(6), 695 (2008).

F. Balestri, C. Barsotti, and L. Lutzemberger, Neurochem. Int. 51(8), 517 (2007).

M. H. Kouni, F. N. Naguib, S. H. Chu, et al., Mol. Pharmacol. 34(2), 104 (1988).

O. K. Molchan, N. A. Dmitrieva, D. V. Romanova, et al., Biokhimiya 63(2), 235 (1998).

M. V. Dontsova, Yu. A. Savochkina, A. G. Gabdoulkhakov, et al., Acta Crystallogr. D 60, 709 (2004).

M. V. Dontsova, A. G. Gabdoulkhakov, O. K. Molchan, et al., Acta Crystallogr. F. 61, 337 (2005).

V. I. Timofeev, A. A. Lashkov, A. G. Gabdoulkhakov, et al., Acta Crystallogr. F. 63, 852 (2007).

W. J. Kabsch, Appl. Crystallogr. 21, 916 (1988).

A. J. McCoy, Acta Crystallogr. D 63, 32 (2007).

P. D. Adams, R. Grosse-Kunstleve, L.-W. Hung, et al., Acta Crystallogr. D 58, 1948 (2002).

P. Emsley and K. Cowtan, Acta Crystallogr. D 60, 2126 (2004).

G. N. Murshudov, A. A. Vagin, and E. J. Dodson, Acta Crystallogr. D 53, 240 (1997).

R. A. Laskowski, M. W. MacArthur, D. S. Moss, and J. M. Thornton, J. Appl. Crystallogr. 26, 283 (1993).

G. Vriend, J. Mol. Graph. 8, 52 (1990).

I. W. Davis, A. Leaver-Fay, V. B. Chen, et al., Nucleic Acids Res. 35, Web Server issue W375-W383 (2007).

W. L. DeLano, 2008. The PyMOL Molecular Graphics System; http://www.pymol.org .

E. Yu. Morgunova, A. M. Mikhailov, A. N. Popov, et al., FEBS Letters. 367, 83 (1995).

E. Yu. Morgunova, A. M. Mikhailov, A. A. Komissarov, et al., Kristallografiya 40(4), 672 (1995) [Crystallogr. Rep. (Engl. Transl.), 40 (4), 620 (1995)].

F. T. Burling, R. Kniewel, J. A. Buglino, et al., Acta Crystallogr. D 59, 73 (2003).

T. T. Caradoc-Davies, S. M. Cutfield, I. L. Lamont, et al., J. Mol. Biol. 337, 337 (2004).

A. A. Lashkov, N. E. Zhukhlistova, A. G. Gabdulkhakov, and A. M. Mikhailov, Kristallografiya 54(2), 291 (2009) [Crystallogr. Rep. (Engl. Transl.), 54 (2), 267 (2009)].

G. Koellner, A. Browska, B. Wielgus-Kutrowska, et al., J. Mol. Biol. 315, 351 (2002).

W. Bu, E. C. Settembre, M. H. Kouni, and S. E. Ealick, Acta Crystallogr. D 61, 863 (2005).