Phương pháp thống kê để kiểm tra giả thuyết đột biến trung tính bằng đa hình DNA.
Tóm tắt
Bài báo này nghiên cứu mối quan hệ giữa hai ước lượng biến đổi di truyền ở cấp độ DNA, cụ thể là số lượng vị trí phân ly và số lượng khác biệt nucleotide trung bình được ước lượng từ so sánh cặp. Kết quả cho thấy mối tương quan giữa hai ước lượng này lớn khi kích thước mẫu nhỏ và giảm dần khi kích thước mẫu tăng lên. Dựa trên mối quan hệ thu được, một phương pháp thống kê để kiểm tra giả thuyết đột biến trung tính được phát triển. Phương pháp này chỉ cần dữ liệu về đa hình DNA, cụ thể là sự biến đổi di truyền trong quần thể ở cấp độ DNA. Một phương pháp mô phỏng máy tính đơn giản, được sử dụng để thu được phân phối của một thống kê mới được phát triển, cũng sẽ được trình bày. Áp dụng phương pháp thống kê này cho năm vùng trình tự DNA ở Drosophila melanogaster, kết quả cho thấy sự chèn/xóa lớn (lớn hơn 100 bp) là có hại. Điều này cho thấy rằng chọn lọc tự nhiên chống lại sự chèn/xóa lớn là rất yếu, do đó một lượng lớn biến đổi vẫn được duy trì trong một quần thể.