Ảnh hưởng của đất và thực vật đến cấu trúc cộng đồng vi sinh vật

Canadian Journal of Microbiology - Tập 48 Số 11 - Trang 955-964 - 2002
Jeffrey S. Buyer1, Daniel P. Roberts, Estelle Russek‐Cohen
1Sustainable Agricultural Systems Laboratory, USDA-ARS, Building 001 BARC-West, Beltsville, MD 20705-2350, USA.

Tóm tắt

Chúng tôi đã nghiên cứu ảnh hưởng của hai loài thực vật khác nhau (ngô và đậu nành) và ba loại đất khác nhau đến cấu trúc cộng đồng vi sinh vật trong vùng rễ (rhizosphere). Giả thuyết làm việc của chúng tôi là hiệu ứng vùng rễ sẽ mạnh nhất đối với các vi sinh vật dị dưỡng hiếu khí phát triển nhanh, trong khi sẽ có ít hoặc không có hiệu ứng vùng rễ đối với các vi sinh vật oligotrophic và các vi sinh vật phát triển chậm khác. Vi khuẩn và nấm có thể nuôi cấy có mật độ quần thể cao hơn trong vùng rễ so với trong đất tổng thể. Các cộng đồng được đặc trưng bởi phân tích axit béo trong đất và bằng các thử nghiệm sử dụng mẫu nền cho vi khuẩn và nấm. Phân tích axit béo cho thấy có một hiệu ứng đất rất mạnh nhưng ít hiệu ứng thực vật đối với cộng đồng vi sinh vật, cho thấy cấu trúc cộng đồng vi sinh vật tổng thể không bị ảnh hưởng bởi vùng rễ. Có một hiệu ứng vùng rễ mạnh mẽ được phát hiện qua thử nghiệm sử dụng mẫu nền đối với cấu trúc cộng đồng vi sinh vật hiếu khí dị dưỡng phát triển nhanh, với các mẫu kiểm soát đất và mẫu vùng rễ được phân biệt rõ ràng với nhau. Có một hiệu ứng vùng rễ yếu hơn nhiều trên các cộng đồng nấm so với các cộng đồng vi khuẩn như đã được đo bằng các thử nghiệm sử dụng mẫu nền. Ở cấp độ phân tích cộng đồng thô này, cộng đồng vi sinh vật vùng rễ bị ảnh hưởng nhiều nhất bởi các hiệu ứng đất, và vùng rễ chỉ ảnh hưởng đến một phần nhỏ tổng số vi khuẩn. Từ khóa: vùng rễ, cộng đồng vi sinh vật, axit béo, sử dụng mẫu nền.

Từ khóa

#vùng rễ #cộng đồng vi sinh vật #axit béo #sử dụng mẫu nền

Tài liệu tham khảo

Bååth E., 1998, Appl. Environ. Microbiol., 64, 238, 10.1128/AEM.64.1.238-245.1998

Buyer J.S., 1995, Appl. Environ. Microbiol., 61, 1839, 10.1128/AEM.61.5.1839-1842.1995

Buyer J.S., 1999, Can. J. Microbiol., 45, 138, 10.1139/w98-227

Buyer J.S., 2001, J. Microbiol. Methods, 45, 53, 10.1016/S0167-7012(01)00221-4

Cavigelli M.A., 1995, Plant Soil, 170, 99, 10.1007/BF02183058

Duineveld B., 1998, Appl. Environ. Microbiol., 64, 4950, 10.1128/AEM.64.12.4950-4957.1998

Duineveld B., 2001, Appl. Environ. Microbiol., 67, 172, 10.1128/AEM.67.1.172-178.2001

Frostegård, 1993, Soil Biol. Biochem., 25, 723, 10.1016/0038-0717(93)90113-P

Garland J.L., 1991, Appl. Environ. Microbiol., 57, 2351, 10.1128/AEM.57.8.2351-2359.1991

Gelsomino A., 1999, J. Microbiol. Methods, 38, 1, 10.1016/S0167-7012(99)00054-8

Janssen P.H., 2002, Appl. Environ. Microbiol., 68, 2391, 10.1128/AEM.68.5.2391-2396.2002

Maloney P.E., 1997, Microb. Ecol., 34, 109, 10.1007/s002489900040

Marschner P., 2002, Brazil. Biol. Fertil. Soils, 35, 68, 10.1007/s00374-001-0435-3

Miller H.J., 1990, Symbiosis, 9, 337

Normander P., 2000, Appl. Environ. Microbiol., 66, 4372, 10.1128/AEM.66.10.4372-4377.2000

Norton J.M., 1991, Appl. Environ. Microbiol., 57, 1161, 10.1128/AEM.57.4.1161-1167.1991

Rondon M.R., 1999, Trends Biotechnol., 17, 403, 10.1016/S0167-7799(99)01352-9

Semenov A.M., 1991, Microb. Ecol., 22, 239, 10.1007/BF02540226

Semenov A.M., 1999, Microb. Ecol., 37, 116, 10.1007/s002489900136

Smalla K., 2001, Appl. Environ. Microbiol., 67, 4742, 10.1128/AEM.67.10.4742-4751.2001

Smit E., 1999, Appl. Environ. Microbiol., 65, 2614, 10.1128/AEM.65.6.2614-2621.1999

Watve M., 2000, Curr. Sci. (Bangalore), 78, 1535

Wieland G., 2001, Appl. Environ. Microbiol., 67, 5849, 10.1128/AEM.67.12.5849-5854.2001

Zak J.C., 1994, Soil Biol. Biochem., 26, 1101, 10.1016/0038-0717(94)90131-7

Zelles L., 1994, Soil Biol. Biochem., 26, 439, 10.1016/0038-0717(94)90175-9

Zelles L., 1995, Plant Soil, 170, 115, 10.1007/BF02183059