Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Phân tích phương sai hồi quy của các đặc điểm trái cây liên quan đến các dấu hiệu phân tử trong cây anh đào
Tóm tắt
Việc sử dụng các dấu hiệu phân tử hỗ trợ cho việc nghiên cứu sự liên kết giữa dấu hiệu gen và các đặc điểm có giá trị sinh học và nông nghiệp trong các vật liệu di truyền đa dạng. Trong nghiên cứu này, mối liên hệ giữa các dấu hiệu lặp lại chuỗi đơn giản (SSR) và dấu hiệu DNA đa hình ngẫu nhiên (RAPD) với các đặc điểm trái cây đã được khảo sát trong hai bộ sưu tập cây anh đào bằng cách áp dụng phân tích hồi quy nhiều biến (MRA). Ba mươi tám kiểu gen SSR và 135 đoạn RAPD đã được tìm thấy có liên quan đến 14 đặc điểm ảnh hưởng đến trái cây. Một số dấu hiệu SSR và RAPD có liên quan đến hơn một đặc điểm trái cây trong MRA. Sự liên kết như vậy có thể phát sinh do hiệu ứng pleiotropic của locus đặc điểm số lượng liên kết đến các đặc điểm khác nhau. Ví dụ, một số dấu hiệu SSR và RAPD có liên quan đến cả bốn đặc điểm bao gồm sự nứt trái, độ cứng của trái, tổng chất rắn hòa tan (TSS) và hình dạng trái. Ngoài ra, một số dấu hiệu có quan hệ tương quan với cả bốn nhân tố của TSS, anthocyanin, màu da trái và màu thịt trái, cho thấy có sự tương quan đáng kể giữa các đặc điểm này. Do đó, có thể sử dụng những dấu hiệu này cùng với các đặc điểm hình thái trong các chương trình lai giống cây anh đào để xác định các bố mẹ phù hợp nhằm sản xuất các quần thể bản đồ và giống lai. Ngoài ra, những kết quả này có thể hữu ích trong các chương trình lai giống hỗ trợ bằng dấu hiệu khi không có thông tin di truyền khác khả dụng.
Từ khóa
#dấu hiệu phân tử #hồi quy nhiều biến #cây anh đào #đặc điểm trái cây #dấu hiệu SSR #dấu hiệu RAPDTài liệu tham khảo
Affifi AA, Clark V (1984) Computer-aided multivariate analysis. Van Nostrand Reinhold, New York
Basaki T, Choukan R, Khayam-Nekouei SM, Mardi M, Majidi E, Faraji S, Zeinolabedini M (2011) Association analysis for morphological traits in pomegranate (Punica geranatum L.) using microsatellite markers. Mid East J Sci Res 9:410–417
Beaver JA, Iezzoni AF (1993) Allozyme inheritance in tetraploid sour cherry (Prunus cerasus L.). J Amer Soc Hort Sci 118:873–877
Beyer M, Hahn R, Peschel S, Harz M, Knoche M (2002) Analysing fruit shape in sweet cherry (Prunus avium L.). Sci Hortic 96:139–150
Chatterjee SN, Nagaraja GM, Srivastava PP, Naik G (2004) Morphological and molecular variation of Morus laevigata in India. Genetica 121:133–143
Christensen JV (1996) Rain-induced cracking of sweet cherries: its causes and prevention. In: Webster AD, Looney NE (eds) Cherries: crop physiology, production and uses. Oxon, UK, pp 297–327
Clarke JB, Sargent DJ, Boskovic RI, Belaj A, Tobutt KR (2009) A cherry map from the inter-specific cross Prunus avium ‘Napoleon’ 9 P. nipponica based on microsatellite, gene-specific and isoenzyme markers. Tree Genet Genomes 5:41–51
Considine JA, Kriedemann PE (2000) Fruit splitting in grapes: determination of the critical turgor pressure. Austral J Agr Res 23:7–24
Crane MB, Lawrence WJC (1929) Genetical and cytological aspects of incompatibility and sterility in cultivated fruits. J Pomol Hortic Sci 7:276–301
Culp TW, Harrell DC, Kerr T (1979) Some genetic implications in the transfer of high fiber strength genes to upland cotton. Crop Sci 19:481–484
Demirsoy H, Demirsoy L (2004) A study on the relationships between some fruit characteristics in cherries. Fruits 59:219–223
Doyle JJ, Doyle JL (1987) A rapid isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochem Bull 19:11–15
Ebrahimi A, Naghavi MR, Sabokdast M, Moradi AS (2011) Association analysis of agronomic traits with microsatellite markers in Iranian barley landraces barley. J Mod Genet 24:15–23
Gao L, Mazza G (1995) Characterization, quantification, and distribution of anthocyanins and colorless phenolics in sweet cherries. J Agric Food Chem 43:343–346
Gomez KA, Gomez AA (1984) Statistical procedures for agricultural research, 2nd edn. Wiley, New York
Hara M, Oki K, Hoshino K, Koboi T (2003) Enhancement of anthocyanin biosynthesis by sugar in radish (Raphanus sativus) hypocotyl. Plant Sci 164:259–265
Hiratsuka S, Onodera H, Kawai W, Kubo T, Itoh H, Wada R (2001) ABA and sugar effects on anthocyanin formation in grape berry cultured in vitro. Sci Hort 90:121–130
Huang XM, Wang HC, Gao FF, Huang HB (1999) A comparative study of the pericarp of litchi cultivars susceptible and resistant to fruit-cracking. J Hort Sci Biotech 74:351–354
Jugran A, Rawat S, Dauthal P, Mondal S, Bhatt ID, Rawal RS (2013) Association of ISSR markers with some biochemical traits of Valeriana jatamansi Jones. Ind Crops Prod 44:671–676
Kar PK, Srivastava PP, Awasthi AK, Urs SR (2008) Genetic variability and association of ISSR markers with some biochemical traits in mulberry (Morus spp.) genetic resources available in India. Tree Genet Genomes 4:75–83
Khadivi-Khub A, Zamani Z, Bouzari N (2007) Study of fruit cracking and doubled fruit in some sweet cherry cultivars. Fifth horticulture congress. Shiraz, Iran (in Farsi)
Khadivi-Khub A, Zamani Z, Bouzari N (2008) Evaluation of genetic diversity in some Iranian and foreign sweet cherry cultivars by using RAPD molecular markers and morphological traits. Hortic Environ Biotechnol 49:188–196
Khadivi-Khub A, Zamani Z, Fatahi MR (2012) Multivariate analysis of Prunus subgen. Cerasus germplasm in Iran using morphological variables. Genet Resour Crop Evol 59:909–926
Krahl KH, Lansari A, Iezzoni AF (1991) Morphological variation within a sour cherry collection. Euphytica 52:47–55
Ma HX, Bai GH, Carver BF, Zhou LL (2005) Molecular mapping of a quantitative trait locus for aluminium tolerance in wheat cultivar Atlas 66. Theor Appl Genet 112:51–57
Martino LS, Manavella FA, García DA, Salato G (2008) Phenology and fruit quality of nine sweet cherry cultivars in South Patagonia. Acta Hort 795:841–848
Meredith WR Jr, Bridge RR (1971) Breakup of linkage block in cotton, Gossypium hirsutum L. Crop Sci 11:695–697
Miller PA, Rawlings JO (1967) Breakup of linkage block in cotton, Gossypium hirsutum L. Crop Sci 11:695–698
Mishra RK, Sen-Mandi S (2004) Molecular profiling and development of DNA marker associated with drought tolerance in tea clones growing in Darjeeling. Curr Sci 87:60–66
Mondal S, Badigannvar AM (2010) Molecular diversity and association of SSR markers to rust and late leaf spot resistance in cultivated groundnut (Arachis hypogaea L.). Plant Breed 129:68–71
Pacifico D, Miselli F, Micheler M, Carboni A, Paolo R, Mandolino G (2006) Genetics and marker assisted selection of the chemotype in Canabis sativa L. Mol Breed 17:257–268
Perez R, Navarro F, Sanchez MA, Ortiz JM, Morales R (2010) Analysis of agromorphological descriptors to differentiate between duke cherry (Prunus x gondouinii (Poit. & Turpin) Rehd.) and its progenitors: sweet cherry (Prunus avium L.) and sour cherry (Prunus cerasus L.). Chilean J Agri Res 70:34–49
Perez-Sanchez R, Gomez-Sanchez MA, Morales-Corts R (2008) Agromorphological characterization of traditional Spanish sweet cherry (Prunus avium L.), sour cherry (Prunus cerasus L.) and duke cherry (Prunus x gondouinii Rehd.) cultivars. Span J Agri Res 6:42–55
Rakonjac V, Fotiric Aksic M, Nikolic D, Milatovic D, Colic S (2010) Morphological characterization of ‘Oblacinska’ sour cherry by multivariate analysis. Sci Hort 125:679–684
Rakshit A, Rakshit S, Singh J, Chopra SK, Balyan HS, Gupta PK, Bhat SR (2010) Association of AFLP and SSR markers with agronomic and fibre quality traits in Gossypium hirsutum L. J. Genet. 89:155–162
Roy SN, Bargmann RE (1957) Tests of multiple independence and the associated confidence-bounds. North Carolina Institute of Statistics Mimeograph Series No. 175
Ruan CJ, Li H, Mopper S (2009) Characterization and identification of ISSR markers associated with resistance to dried-shrink disease in sea buckthorn. Mol Breed 24:255–268
Sekse L (2008) Fruit cracking in sweet cherries—some recent advances. Acta Hort 795:615–625
Shalini KV, Manjunatha S, Lebrun P, Berger A, Baudouin L, Pirany N, Ranganath RM, Prasad DT (2007) Identification of molecular markers associated with mite resistance in coconut (Cocos nuciferaL.). Genome 50:35–42
Shen XL, Guo WZ, Lu QX, Zhu XF, Yuan YL, Zhang TZ (2007) Genetic mapping of quantitative trait loci for fiber quality and yield trait by RIL approach in Upland cotton. Euphytica 155:371–380
Simon G (2006) Review on rain induced fruit cracking of sweet cherries (Prunus avium L.), its causes and the possibilities of prevention. Int J Hort Sci 12(3):27–35
Simon G, Hrotkó K, Magyar L (2004) Fruit quality of sweet cherry cultivars grafted on four different rootstocks. Acta Hort 658(1):65–370
Song XF, Song TM, Dai JR, Rocheford TR, Collaborative Working Group on Underutilized (2004) QTL mapping of kernel oil concentration with high-oil maize by SSR markers. Maydica 49:41–48
Tehrani G, Brown SK (1992) Pollen-incompatibility and self-fertility in sweet cherry. Plant Breed Rev 9:368–370
Vijayan K, Srivatsava PP, Nair CV, Awasthi AK, Tikader A, Sreenivasa B, Urs SR (2006) Molecular characterization and identification of markers associated with yield traits in mulberry using ISSR markers. Plant Breed 125:298–301
Virk PS, Ford-Lloyd BV, Jackson MT, Pooni HS, Clemeno TP, Newbury HJ (1996) Predicting quantitative variation within rice germplasm using molecular markers. Heredity 76:296–304
Wünsch A (2009) Cross-transferable polymorphic SSR loci in Prunus species. Sci Hort 120:348–352
Yamaguchi M, Sato I, Ishiguro M (2002) Influences of epidermal cell size and flesh firmness on cracking susceptibility in sweet cherry (Prunus avium L.) cultivars and selections. J Japan Soc Hort Sci 71:738–746
Zeng L, Meredith WR, Gutierrez OA, Boykin DL (2009) Identification of association between SSR markers and fiber traits in an exotic germplasm derived from multiple cross among Gossypium tetraploid species. Theor Appl Genet 119:93–103
