Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Nghiên cứu mối quan hệ cấu trúc- hoạt tính định lượng của các chất ức chế proteasome chứa boron dạng dipeptide thông qua các mô tả toán học tính toán
Tóm tắt
Các chỉ số topo (TIs) và cặp nguyên tử (APs) đã được sử dụng để phát triển mô hình mối quan hệ cấu trúc-hoạt tính định lượng (QSAR) cho một tập hợp gồm 58 axit boronic dipeptide, những chất này là chất ức chế mạnh của proteasome và đã được ứng dụng trong điều trị nhiều loại ung thư khác nhau. Trong số ba phương pháp hồi quy tuyến tính được sử dụng để phát triển QSAR, cụ thể là hồi quy thành phần chính (PCR), hồi quy bình phương tối thiểu từng phần (PLS), và hồi quy độ chệch (RR), phương pháp cuối cùng đã cho ra các mô hình khả quan nhất trong khi hai phương pháp còn lại cho kết quả kém. Kết quả RR thu được trong bài báo này bằng cách sử dụng TIs và APs có thể so sánh với các kết quả CoMFA và CoMSIA được báo cáo trong tài liệu về cùng một tập hợp hợp chất.
Từ khóa
#QSAR #chỉ số topo #cặp nguyên tử #axit boronic #ức chế proteasome #mô hình hồi quy tuyến tínhTài liệu tham khảo
J. Adams, Y.T. Ma, R. Stein, M. Baevsky, L. Grenier, L. Plamonda, PCT Int. Appl., WO 1996013266. (1995)
Adams J., Palombella V.J., Sausville E.A., Johnson J., Destree A., Lazarus D.D., Maas J., Pien C.S., Prakash S., Elliott P.J.: Cancer Res. 59, 2615 (1999)
Adams J.: Trends Mol. Med. 8(Suppl), S49–S54 (2002)
Adams J.: Drug Discov. Today 8, 307 (2003)
Almond J.B., Cohen G.M.: Leukemia 16, 433 (2002)
S.C. Basak, D.K. Harriss, V.R. Magnuson, POLLY v. 2.3, Copyright of the University of Minnesota, 1988
S.C. Basak, G.D. Grunwald, APProbe. Copyright of the University of Minnesota, 1993
S.C. Basak, B.D. Gute, in Proceedings of the International Congress on Hazardous Waste: Impact on Human and Ecological Health, ed. by B.L. Johnson, C. Xintaras, J. S. Andrews (Princeton Scientific Publishing Co, Inc., 1997), pp. 492–504
Basak S.C., Gute B.D., Ghatak S.: J. Chem. Inf. Comput. Sci. 39, 255 (1999)
Basak S.C., Mills D., Hawkins D.M., El-Masri H.A.: SAR QSAR Environ. Res. 13, 649 (2002)
Basak S.C., Mills D., Hawkins D.M., El-Masri H.: Risk Analysis 23, 1173 (2003)
Basak S.C., Mills D., Mumtaz M.M., Balasubramanian K.: Indian J. Chem. 42A, 1385 (2003)
S.C. Basak, D. Mills, B.D. Gute, D.M. Hawkins, in Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR) Models of Mutagens and Carcinogens, ed. by R. Benigni (CRC Press, Boca Raton, FL, 2003), pp. 207–234
Basak S.C., Mills D., El-Masri H.A., Mumtaz M.M., Hawkins D.M.: Environ. Toxicol. Pharmacol. 16, 45 (2004)
S.C. Basak, D. Mills, ARKIVOC 2005, 308 (2005)
S.C. Basak, D. Mills, ARKIVOC 2005, 60 (2005)
Basak S.C., Mills D., Gute B.D.: SAR QSAR Environ. Res. 17, 515 (2006)
S.C. Basak, B.D. Gute, D. Mills, ARKIVOC 2006, 157 (2006)
Basak S.C., Natarajan R., Mills D., Hawkins D.M., Kraker J.J.: J. Chem. Inf. Model. 46, 65 (2006)
S.C. Basak, D. Mills, B.D. Gute, R. Natarajan, in Topics in Heterocyclic Chemistry, ed. by S.P Gupta Vol. 5: QSAR and Molecular Modeling Studies of Heterocyclic Drugs (Springer, Berlin-Heidelberg-New York, 2006), pp. 39–80
Corey E.J., Li W.-D.Z., Nagamitsu T., Fenteany G.: Tetrahedron 55, 3305 (1999)
Carhart R.E., Smith D.H., Venkataraghavan R.: J. Chem. Inf. Comput. Sci. 25, 64 (1985)
Delcros J.G., Floc’h M.D., Prigent C., Arlot-Bonnemains Y.: Curr. Med. Chem. 10, 479 (2003)
Fenteany G., Standaert R.F., Lane W.S., Choi S., Corey E.J., Schreiber S.L.: Science 268, 726 (1995)
Filip P.A., Balaban T.S., Balaban A.T.: J. Math. Chem. 1, 61 (1987)
Frank I.E., Friedman J.H.: Technometrics 35, 109 (1993)
Hawkins D.M., Basak S.C., Mills D.: J. Chem. Inf. Comput. Sci. 43, 579 (2003)
Hoerl A.E., Kennard R.W.: Technometrics 12, 55 (1970)
Hoerl A.E., Kennard R.W.: Technometrics 12, 69 (2005)
Hoskuldsson A.: J. Chemometrics 2, 211 (1988)
Hoskuldsson A.: J. Chemometrics 9, 91 (1995)
Kier L.B., Hall L.H.: Molecular Connectivity in Structure-Activity Analysis. Research Studies Press, Letchworth, Hertfordshire, U.K. (1986)
Kier L.B., Hall L.H.: Molecular Structure Description: The Electrotopological State. Academic Press, San Diego, CA (1999)
Kraker J.J., Hawkins D.M., Basak S.C., Natarajan R., Mills D.: Chemometr. Intell. Lab. Syst. 87, 33 (2007)
Molconn-Z Version 3.5, Hall Associates Consulting, Quincy, MA., 2000
Randic M.: J. Am. Chem. Soc. 97, 6609 (1975)
A.B. Roy, S.C. Basak, D.K. Harriss, V.R. Magnuson, in Mathematical Modelling Science Technology, ed. by X.J.R. Avula, R.E. Kalman, A.I. Liapis, E.Y. Rodin (Pergamon Press, New York, 1983), pp. 745–750
SAS Institute, Inc.: In SAS/STAT User Guide, Release 6.03 Edition. SAS Institute Inc., Cary, NC (1988)
Wold S.: Technometrics 35, 136 (1993)
Zhu Y.-Q., Lei M., Lu A.-J., Zhao X., Yin X.-J., Gao Q.-Z.: Eur. J. Med. Chem. 44, 1486 (2009)