Nhận diện mẫu DNA vi khuẩn bằng điện di gel xung: Một cách tiếp cận hệ thống

Hình ảnh điện di gel xung (PFGE) chứa thông tin về ‘hình dạng băng’ có thể được sử dụng trong việc xác định vi khuẩn. Một cách tiếp cận hệ thống được thiết kế để giải quyết vấn đề nhận diện mẫu DNA PFGE của vi khuẩn, yêu cầu xử lý hình ảnh, trích xuất đặc trưng, tiền xử lý dữ liệu, phân loại và đưa ra quyết định cuối cùng. Bài báo này mô tả nghiên cứu, phát triển và thử nghiệm của một hệ thống hoàn chỉnh để giải quyết vấn đề xác định này, bao gồm phân tích đường cong đặc trưng hoạt động của bộ thu nhận (ROC). Các biến thể do việc chuẩn bị gel tại các phòng thí nghiệm khác nhau bởi các kỹ thuật viên khác nhau cũng được xem xét. Cách tiếp cận này được áp dụng để nhận diện vi khuẩn E. coli O157:H7 với kết quả xuất sắc.