Dereeper, 2008, Nucleic Acids Res., 36, W465, 10.1093/nar/gkn180
Bailey, 2009, Nucleic Acids Res., 37, W202, 10.1093/nar/gkp335
Reinert, 2009, J. Comput. Biol., 16, 1615, 10.1089/cmb.2009.0198
Chou, 2005, Bioinformatics, 21, 10, 10.1093/bioinformatics/bth466
Chou, 2001, Proteins: Struct., Funct., Genet., 43, 246, 10.1002/prot.1035
Chou, 2001, Proteins: Struct., Funct., Genet., 44, 60, 10.1002/prot.1072
Shen, 2008, Anal. Biochem., 373, 386, 10.1016/j.ab.2007.10.012
Lin, 2013, J. Biomed. Sci. Eng., 6, 435, 10.4236/jbise.2013.64054
Chou, 2003, Proteins: Struct., Funct., Genet., 53, 282, 10.1002/prot.10500
Chou, 2003, J. Cell. Biochem., 90, 1250, 10.1002/jcb.10719
Chou, 2004, J. Cell. Biochem., 91, 1085, 10.1002/jcb.10790
Pan, 2003, J. Protein Chem., 22, 395, 10.1023/A:1025350409648
Chou, 2004, J. Cell. Biochem., 91, 1197, 10.1002/jcb.10790
Wang, 2004, Protein Eng., Des. Sel., 17, 509, 10.1093/protein/gzh061
Cai, 2005, J. Proteome Res., 4, 967, 10.1021/pr0500399
Gao, 2005, Amino Acids, 28, 373, 10.1007/s00726-005-0206-9
Liu, 2005, Protein J., 24, 385, 10.1007/s10930-005-7592-4
Shen, 2005, Biochem. Biophys. Res. Commun., 334, 288, 10.1016/j.bbrc.2005.06.087
Shen, 2005, Biochem. Biophys. Res. Commun., 337, 752, 10.1016/j.bbrc.2005.09.117
Cai, 2006, J. Theor. Biol., 238, 395, 10.1016/j.jtbi.2005.05.035
Mondal, 2006, J. Theor. Biol., 243, 252, 10.1016/j.jtbi.2006.06.014
Shen, 2006, J. Theor. Biol., 240, 9, 10.1016/j.jtbi.2005.08.016
Wang, 2006, J. Theor. Biol., 242, 941, 10.1016/j.jtbi.2006.05.006
Xiao, 2006, Amino Acids, 30, 49, 10.1007/s00726-005-0225-6
Xiao, 2006, J. Comput. Chem., 27, 478, 10.1002/jcc.20354
Zhang, 2006, Amino Acids, 30, 461, 10.1007/s00726-006-0263-8
Zhou, 2006, Proteins: Struct., Funct., Bioinf., 63, 681, 10.1002/prot.20898
Chen, 2007, J. Theor. Biol., 248, 377, 10.1016/j.jtbi.2007.05.019
Ding, 2007, Protein Pept. Lett., 14, 811, 10.2174/092986607781483778
Lin, 2007, Biochem. Biophys. Res. Commun., 354, 548, 10.1016/j.bbrc.2007.01.011
Lin, 2007, J. Comput. Chem., 28, 1463, 10.1002/jcc.20554
Mundra, 2007, Pattern Recognit. Lett., 28, 1610, 10.1016/j.patrec.2007.04.001
Shi, 2007, Amino Acids, 33, 69, 10.1007/s00726-006-0475-y
Zhang, 2007, Amino Acids, 33, 623, 10.1007/s00726-007-0496-1
Diao, 2008, Amino Acids, 34, 111, 10.1007/s00726-007-0550-z
Ding, 2008, Pattern Recognit. Lett., 29, 1887, 10.1016/j.patrec.2008.06.007
Fang, 2008, Amino Acids, 34, 103, 10.1007/s00726-007-0568-2
Jiang, 2008, Protein Pept. Lett., 15, 392, 10.2174/092986608784246443
Jiang, 2008, Amino Acids, 34, 669, 10.1007/s00726-008-0034-9
Li, 2008, Amino Acids, 34, 119, 10.1007/s00726-007-0545-9
Li, 2008, Protein Pept. Lett., 15, 612, 10.2174/092986608784966930
Lin, 2008, J. Theor. Biol., 252, 350, 10.1016/j.jtbi.2008.02.004
Lin, 2008, Protein Pept. Lett., 15, 739, 10.2174/092986608785133681
Shi, 2008, Amino Acids, 35, 321, 10.1007/s00726-007-0623-z
Xiao, 2008, J. Comput. Chem., 29, 2018, 10.1002/jcc.20955
Xiao, 2008, J. Theor. Biol., 254, 691, 10.1016/j.jtbi.2008.06.016
Zhang, 2008, J. Theor. Biol., 253, 310, 10.1016/j.jtbi.2008.03.015
Zhang, 2008, Amino Acids, 35, 591, 10.1007/s00726-008-0086-x
Zhang, 2008, Amino Acids, 34, 565, 10.1007/s00726-007-0010-9
Zhang, 2008, J. Theor. Biol., 250, 186, 10.1016/j.jtbi.2007.09.014
Chen, 2009, Protein Pept. Lett., 16, 27, 10.2174/092986609787049420
Chou, 2009, Curr. Proteomics, 6, 262, 10.2174/157016409789973707
Ding, 2009, Protein Pept. Lett., 16, 351, 10.2174/092986609787848045
Gao, 2009, Anal. Biochem., 387, 54, 10.1016/j.ab.2009.01.018
Georgiou, 2009, J. Theor. Biol., 257, 17, 10.1016/j.jtbi.2008.11.003
Li, 2009, Amino Acids, 37, 415, 10.1007/s00726-008-0170-2
Lin, 2009, Acta Biotheor., 57, 321, 10.1007/s10441-008-9067-4
Qiu, 2009, Anal. Biochem., 390, 68, 10.1016/j.ab.2009.04.009
Xiao, 2009, J. Appl. Crystallogr., 42, 169, 10.1107/S0021889809002751
Zeng, 2009, J. Theor. Biol., 259, 366, 10.1016/j.jtbi.2009.03.028
Esmaeili, 2010, J. Theor. Biol., 263, 203, 10.1016/j.jtbi.2009.11.016
Gao, 2010, Anal. Biochem., 398, 52, 10.1016/j.ab.2009.10.040
Gu, 2010, Shengwu Yixue Gongchengxue Zazhi, 27, 500
Gu, 2010, Protein Pept. Lett., 17, 559, 10.2174/092986610791112693
Kandaswamy, 2010, Protein Pept. Lett., 17, 1473, 10.2174/0929866511009011473
Liu, 2010, Protein Pept. Lett., 17, 1263, 10.2174/092986610792231528
Mohabatkar, 2010, Protein Pept. Lett., 17, 1207, 10.2174/092986610792231564
Nanni, 2010, J. Theor. Biol., 266, 1, 10.1016/j.jtbi.2010.06.006
Niu, 2010, Protein Pept. Lett., 17, 1466, 10.2174/092986610791112738
Qiu, 2010, Protein Pept. Lett., 17, 715, 10.2174/092986610791190372
Sahu, 2010, Comput. Biol. Chem., 34, 320, 10.1016/j.compbiolchem.2010.09.002
Wang, 2010, Protein Pept. Lett., 17, 1441, 10.2174/0929866511009011441
Chou, 2011, J. Theor. Biol., 273, 236, 10.1016/j.jtbi.2010.12.024
Ding, 2011, Protein Pept. Lett., 18, 58, 10.2174/092986611794328708
Guo, 2011, J. Comput. Chem., 32, 1612, 10.1002/jcc.21740
Hayat, 2011, J. Theor. Biol., 271, 10, 10.1016/j.jtbi.2010.11.017
Hu, 2011, Protein Pept. Lett., 18, 552, 10.2174/092986611795222795
Jingbo, 2011, J. Theor. Biol., 284, 16, 10.1016/j.jtbi.2011.06.003
Liao, 2011, Protein Pept. Lett., 18, 1086, 10.2174/092986611797200931
Lin, 2011, J. Theor. Biol., 269, 64, 10.1016/j.jtbi.2010.10.019
Lin, 2011, Protein Pept. Lett., 18, 1219, 10.2174/092986611797642797
Lin, 2011, Afr. J. Biotechnol., 10, 16963
Liu, 2011, Protein Pept. Lett., 18, 1244, 10.2174/092986611797642661
Mohammad Beigi, 2011, J. Struct. Funct. Genomics, 12, 191, 10.1007/s10969-011-9120-4
Qiu, 2011, J. Mol. Graphics Modell., 30, 129, 10.1016/j.jmgm.2011.06.014
Shi, 2011, Protein Pept. Lett., 18, 625, 10.2174/092986611795222768
Shu, 2011, Protein Pept. Lett., 18, 1233, 10.2174/092986611797642706
Wang, 2011, Protein Pept. Lett., 18, 684, 10.2174/092986611795446085
Wang, 2011, Protein Pept. Lett., 18, 480, 10.2174/092986611794927947
Xiao, 2011, Curr. Bioinf., 6, 251, 10.2174/1574893611106020251
Xiao, 2011, Mol. BioSyst., 7, 911, 10.1039/C0MB00170H
Zia Ur, 2011, Protein Pept. Lett., 18, 872, 10.2174/092986611796011491
Zou, 2011, J. Comput. Chem., 32, 271, 10.1002/jcc.21616
Cao, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 1163, 10.2174/092986612803216999
Chen, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 422, 10.2174/092986612799789332
Du, 2012, Anal. Biochem., 425, 117, 10.1016/j.ab.2012.03.015
Fan, 2012, J. Theor. Biol., 304, 88, 10.1016/j.jtbi.2012.03.017
Fan, 2012, Amino Acids, 43, 545, 10.1007/s00726-011-1143-4
Hayat, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 411, 10.2174/092986612799789387
Li, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 375, 10.2174/092986612799789369
Liao, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 1133, 10.2174/092986612803217051
Lin, 2012, PLoS One, 7, e49040, 10.1371/journal.pone.0049040
Liu, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 439, 10.2174/092986612799789378
Mei, 2012, J. Theor. Biol., 293, 121, 10.1016/j.jtbi.2011.10.015
Mei, 2012, J. Theor. Biol., 310, 80, 10.1016/j.jtbi.2012.06.028
Nanni, 2012, Amino Acids, 43, 657, 10.1007/s00726-011-1114-9
Nanni, 2012, IEEE/ACM Trans. Comput. Biol. Bioinf., 9, 467, 10.1109/TCBB.2011.117
Niu, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 940, 10.2174/092986612802084492
Qin, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 388, 10.2174/092986612799789350
Ren, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 1170, 10.2174/092986612803217088
Sun, 2012, Mol. BioSyst., 8, 3178, 10.1039/c2mb25280e
Wang, 2012, Comput. Biol. Med., 42, 564, 10.1016/j.compbiomed.2012.01.012
Yu, 2012, Amino Acids, 42, 1619, 10.1007/s00726-011-0848-8
Zhao, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 492, 10.2174/092986612800191080
Zia Ur, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 890, 10.2174/092986612801619589
Cao, 2013, Bioinformatics, 29, 960, 10.1093/bioinformatics/btt072
Chang, 2013, J. Comput.-Aided Mol. Des., 27, 91, 10.1007/s10822-012-9628-0
Chen, 2013, J. Theor. Biol., 318, 1, 10.1016/j.jtbi.2012.10.033
Fan, 2013, J. Theor. Biol., 334, 45, 10.1016/j.jtbi.2013.06.003
Georgiou, 2013, Open Bioinf. J., 7, 41, 10.2174/1875036201307010041
Gupta, 2013, SAR QSAR Environ. Res., 24, 597, 10.1080/1062936X.2013.773378
Huang, 2013, BioSystems, 113, 50, 10.1016/j.biosystems.2013.04.005
Huang, 2013, J. Theor. Biol., 335, 205, 10.1016/j.jtbi.2013.06.034
Lin, 2013, Int. J. Biomath., 6, 1350003, 10.1142/S1793524513500034
Liu, 2013, Mol. Inf., 32, 775, 10.1002/minf.201300084
Mohabatkar, 2013, Med. Chem., 9, 133, 10.2174/157340613804488341
Qin, 2013, Int. J. Quantum Chem., 113, 1660, 10.1002/qua.24383
Sarangi, 2013, Protein Pept. Lett., 20, 781, 10.2174/0929866511320070008
Wang, 2013, Protein Pept. Lett., 20, 309
Xiao, 2013, PLoS One, 8, e72234, 10.1371/journal.pone.0072234
Xiao, 2013, J. Theor. Biol., 337C, 71, 10.1016/j.jtbi.2013.08.013
Xiaohui, 2013, J. Theor. Biol., 332C, 211, 10.1016/j.jtbi.2013.03.010
Xie, 2013, Protein Eng., Des. Sel., 26, 735, 10.1093/protein/gzt042
Xu, 2013, PLoS One, 8, e55844, 10.1371/journal.pone.0055844
Xu, 2013, PeerJ, 1, e171, 10.7717/peerj.171
Liu, 2014, PLoS One, 9, e106691, 10.1371/journal.pone.0106691
Du, 2014, Int. J. Mol. Sci., 15, 3495, 10.3390/ijms15033495
Hajisharifi, 2014, J. Theor. Biol., 341, 34, 10.1016/j.jtbi.2013.08.037
Han, 2014, J. Theor. Biol., 344, 31, 10.1016/j.jtbi.2013.11.017
Hayat, 2014, Comput. Methods Programs Biomed., 116, 184, 10.1016/j.cmpb.2014.06.007
Jia, 2014, Int. J. Mol. Sci., 15, 10410, 10.3390/ijms150610410
Kong, 2014, J. Theor. Biol., 344, 12, 10.1016/j.jtbi.2013.11.021
Li, 2014, Biochimie, 104, 100, 10.1016/j.biochi.2014.06.001
Mondal, 2014, J. Theor. Biol., 356, 30, 10.1016/j.jtbi.2014.04.006
Nanni, 2014, J. Theor. Biol., 360C, 109, 10.1016/j.jtbi.2014.07.003
Qiu, 2014, Int. J. Mol. Sci., 15, 1746, 10.3390/ijms15021746
Qiu, 2014, BioMed Res. Int., 2014, 947416
Xu, 2014, J. Biomol. Struct. Dyn., 10.1080/07391102.2014.968624
Xu, 2014, Int. J. Mol. Sci., 15, 7594, 10.3390/ijms15057594
Xu, 2014, PLoS One, 9, e105018, 10.1371/journal.pone.0105018
Zhang, 2014, J. Theor. Biol., 363, 412, 10.1016/j.jtbi.2014.08.002
Zhang, 2014, Int. J. Mol. Sci., 15, 11204, 10.3390/ijms150711204
Zhang, 2014, J. Theor. Biol., 355, 105, 10.1016/j.jtbi.2014.04.008
Ding, 2014, BioMed Res. Int., 2014, 286419
Dehzangi, 2015, J. Theor. Biol., 364, 284, 10.1016/j.jtbi.2014.09.029
Huang, 2015, Protein Pept. Lett., 25666038
Jia, 2015, J. Theor. Biol., 377, 47, 10.1016/j.jtbi.2015.04.011
Khan, 2015, J. Theor. Biol., 365, 197, 10.1016/j.jtbi.2014.10.014
Liu, 2015, Mol. Inf., 34, 8, 10.1002/minf.201400025
Mandal, 2015, Med. Biol. Eng. Comput., 53, 331, 10.1007/s11517-014-1238-7
Liu, 2015, Mol. Genet. Genomics, 10.1007/s00438-015-1044-4
Zhong, 2014, Int. J. Mol. Sci., 15, 20072, 10.3390/ijms151120072
Chou, 2015, Med. Chem., 11, 218, 10.2174/1573406411666141229162834
Zhou, 2015, Med. Chem., 11, 216, 10.2174/1573406411666141229162618
Zhou, 2011, Talanta, 85, 1143, 10.1016/j.talanta.2011.05.043
Chen, 2013, Nucleic Acids Res., 41, e68, 10.1093/nar/gks1450
Zhou, 2013, J. Theor. Biol., 319, 1, 10.1016/j.jtbi.2012.11.024
Lin, 2014, Nucleic Acids Res., 42, 12961, 10.1093/nar/gku1019
Chen, 2014, Anal. Biochem., 462, 76, 10.1016/j.ab.2014.06.022
Chen, 2014, BioMed Res. Int., 2014, 623149
Feng, 2014, Genomics, 104, 229, 10.1016/j.ygeno.2014.08.011
Feng, 2014, Sci. World J., 2014, 740506
Chen, 2012, PLoS One, 7, e47843, 10.1371/journal.pone.0047843
Guo, 2014, Bioinformatics, 30, 1522, 10.1093/bioinformatics/btu083
Liu, 2015, J. Biomol. Struct. Dyn., 10.1080/07391102.2015.1014422
Liu, 2015, PLoS One, 10, e0121501, 10.1371/journal.pone.0121501
Liu, 2015, Anal. Biochem., 474, 69, 10.1016/j.ab.2014.12.009
Chen, 2014, Anal. Biochem., 456, 53, 10.1016/j.ab.2014.04.001
Hofacker, 2003, Nucleic Acids Res., 31, 3429, 10.1093/nar/gkg599
Liu, 2015, Mol. Genet. Genomics, 10.1007/s00438-015-1078-7
Liu, 2015, Nucleic Acids Res., 10.1093/nar/gkv458
Wang, 2008, Protein Pept. Lett., 15, 915, 10.2174/092986608785849308
Liu, 2012, J. Theor. Biol., 293, 49, 10.1016/j.jtbi.2011.10.004
Richmond, 2003, Nature, 423, 145, 10.1038/nature01595
Zhang, 2012, J. Biomol. Struct. Dyn., 29, 1081, 10.1080/073911012010525032
Zhao, 2010, Chromosome Res., 18, 777, 10.1007/s10577-010-9160-9
Rangannan, 2007, J. Biosci., 32, 851, 10.1007/s12038-007-0085-1
Jackson, 2010, Nat. Rev. Mol. Cell Biol., 11, 113, 10.1038/nrm2838
Saeys, 2007, Bioinformatics, 23, i418, 10.1093/bioinformatics/btm177
Hoskins, 2012, Trends Biochem. Sci., 37, 179, 10.1016/j.tibs.2012.02.009
Chen, 2015, Bioinformatics, 31, 119, 10.1093/bioinformatics/btu602
Liu, 2015, Bioinformatics, 31, 1307, 10.1093/bioinformatics/btu820
Chen, 2007, Amino Acids, 33, 423, 10.1007/s00726-006-0485-9
Qiu, 2014, J. Biomol. Struct. Dyn., 10.1080/07391102.2014.968875
Chou, 2007, Anal. Biochem., 370, 1, 10.1016/j.ab.2007.07.006
Wu, 2011, Mol. BioSyst., 7, 3287, 10.1039/c1mb05232b
Chou, 2012, Mol. BioSyst., 8, 629, 10.1039/C1MB05420A
Lin, 2013, Mol. BioSyst., 9, 634, 10.1039/c3mb25466f
Xiao, 2013, Anal. Biochem., 436, 168, 10.1016/j.ab.2013.01.019
Chen, 2012, PLoS One, 7, e35254, 10.1371/journal.pone.0035254
Chou, 2008, Nat. Protoc., 3, 153, 10.1038/nprot.2007.494
Chou, 2010, Nat. Sci., 2, 1090
Chou, 2013, Mol. BioSyst., 9, 1092, 10.1039/c3mb25555g
Sun, 2009, Intern. J. Pattern Recognit. Artif. Intell., 23, 687, 10.1142/S0218001409007326
Xiao, 2014, J. Biomol. Struct. Dyn., 10.1080/07391102.07392014.07998710
Zhang, 1995, J. Protein Chem., 14, 583, 10.1007/BF01886884
Zhang, 1992, Biophys. J., 63, 1523, 10.1016/S0006-3495(92)81728-9
Chou, 1993, J. Biol. Chem., 268, 16938, 10.1016/S0021-9258(19)85285-7
Chou, 2009, Nat. Sci., 1, 63
Min, 2013, BioMed Res. Int., 2013, 701317
Fan, 2014, Int. J. Mol. Sci., 15, 4915, 10.3390/ijms15034915
