Các trình tự retrovirus nội sinh được bảo vệ đồng tinh khiết với khả năng gây nhiễm trong bệnh Creutzfeldt-Jakob thí nghiệm

Archives of Virology - Tập 130 - Trang 301-316 - 1993
A. Akowitz1, E. E. Manuelidis1, L. Manuelidis1
1Yale Medical School, New Haven, USA

Tóm tắt

Scrapie và bệnh Creutzfeldt-Jakob (CJD) được gây ra bởi các tác nhân lây nhiễm được định nghĩa theo cách hiện tượng học. Chưa có phân tử hoặc hạt cụ thể nào của tác nhân được xác định. Các thuộc tính sinh học, chẳng hạn như nhân đôi tác nhân theo cấp số nhân và sự biến đổi chủng, cũng như các đặc điểm vật lý của khả năng gây nhiễm cho thấy một cấu trúc virus được bảo vệ. Một glycoprotein màng của vật chủ nặng 34 kDa (protein "prion") mà tập hợp ở các giai đoạn cuối của bệnh rất quan trọng trong bệnh lý và độ nhạy cảm với nhiễm trùng, nhưng không có khả năng gây nhiễm rõ ràng trong bất kỳ hình thức tinh khiết hoặc tái tổ hợp nào. Do đó, việc xác định các phân tử tương tự như virus là rất quan trọng. Để xác định axit nucleic giống virus, chúng tôi đã phát triển các phương pháp để tinh khiết đáng kể tác nhân CJD ở người từ não của chuột lang bị nhiễm thí nghiệm và đã chứng minh các dải LTR giống retrovirus được chọn ở các mức pg không đủ cho việc giải trình tự. Để định nghĩa thêm các trình tự giống virus này và những trình tự khác, chúng tôi đã phân lập axit nucleic từ các phần CJD có khả năng gây nhiễm cao và thử nghiệm hiệu quả của các phương pháp của chúng tôi bằng cách sử dụng một tín hiệu retrovirus được chọn. RNA chiết xuất từ một đỉnh Gaussian 120 S có khả năng gây nhiễm, được tinh sạch tái tạo khoảng 100.000 lần so với các axit nucleic ban đầu và chứa khoảng 20% khả năng gây nhiễm từ não ban đầu, đã được sử dụng để tạo ra một thư viện cDNA trong chiến lược khuếch đại độc lập chuỗi đối với các mức RNA thấp (<6 ng). Các thí nghiệm dừng mạnh tái tạo sử dụng một số mồi tRNA retrovirus đã chỉ ra rằng các trình tự IAP chuột lang Syria (SHIAP) nên có mặt trong cả lô CJD và các phần đối chứng không bị nhiễm. Bởi vì các hạt SHIAP cực kỳ kháng với sự biến tính, sự hiện diện của chúng trong một thư viện cDNA sẽ ngụ ý việc trích xuất đầy đủ các RNA được bảo vệ khác có nguồn gốc virus. Ít nhất 900 base của genome retrovirus IAP chuột lang Syria đã được xác định rõ ràng trong thư viện cDNA, và trong các bước PCR độc lập với các mồi được chọn, tất cả đều dựa trên các trình tự được nhân bản của chúng tôi. Các kết quả giải trình tự đã xác nhận sự hiện diện của LTR được bảo vệ và các động cơ retrovirus liền kề. Bởi vì các trình tự này cũng có mặt trong các chế phẩm đối chứng, chúng có thể đại diện cho các tạp chất virus nội sinh bình thường đồng lắng với khả năng gây nhiễm theo kích thước và độ đậm đặc. Mặt khác, LTR có thể điều khiển sự biểu hiện của nhiều trình tự đa dạng, và vẫn phải xem liệu các trình tự cụ thể của CJD có được truyền hoặc đóng gói cùng với các phức hợp IAP được bảo vệ hay không. Việc trích xuất và khuếch đại hiệu quả các axit nucleic SHIAP được bảo vệ với chiều dài đáng kể đặt nền tảng cho việc xác định các yếu tố virus được bảo vệ bổ sung có thể chỉ định tác nhân CJD.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Aiken JM, Williamson JL, Borchardt M, Marsh RF (1990) Presence of mitochondrial D-loop DNA in scrapie-infected brain preparations enriched for the prion protein. J Virol 64: 3265–3268 Akowitz A, Manuelidis L (1989) A novel cDNA/PCR strategy for efficient cloning of small amounts of undefined RNA. Gene 81: 295–306 Akowitz A, Sklaviadis T, Manuelidis EE, Manuelidis L (1990) Nuclease resistant polyadenylated RNAs of significant size are detected by PCR in highly purified Creutzfeldt-Jakob disease preparations. Microb Pathog 9: 33–45 Baker HF, Ridley RM, Crow TJ (1985) Experimental transmission of an autosomal dominant spongiform encephalopathy: does the infectious agent originate in the human genome? Br Med J 291: 299–302 Bellinger-Kawahara C, Cleaver JE, Diener TO, Prusiner SB (1987) Purified scrapie prions resist inactivation by UV-irradiation. J Virol 61: 159–166 Bruce ME, Dickinson AG (1987) Biological evidence that scrapie has an independent genome. J Gen Virol 68: 79–89 Bruce ME, McConnell I, Fraser H, Dickinson AG (1991) The disease characteristics of different strains of scrapie in Sinc congenic mouse lines: implications for the nature of the agent and host control of pathogenesis. J Gen Virol 72: 595–603 Canaani E, Dreazen O, Klar A, Rechavi G, Ram D, Cohen JB, Givol D (1983) Activation of the c-mos oncogene in a mouse plasmacytoma by insertion of an endogenous intracisternal A-particle genome. Proc Natl Acad Sci USA 80: 7118–7123 Czub MB, Braig HR, Diringer H (1986) Pathogenesis of scrapie: study of the temporal development of clinical symptoms of infectivity titers and scrapie-associated fibrils in brains of hamsters infected intraperitoneally. J Gen Virol 67: 2005–2009 Czub M, Braig HR, Diringer H (1988) Replication of the scrapie agent in hamsters infected intracerebrally confirms the pathogenesis of an amyloid-inducing virosis. J Gen Virol 69: 1753–1756 Diedrich JF, Minnigar H, Carp RI, Whitaker JN, Race R, Frey W, Haase AT (1991) Neuropathological changes in scrapie and Alzheimer's disease are associated with increased expression of Apoliopoprotein E and cathepsin D in astrocytes. J Virol 65: 4759–4768 Diringer H (1984) Sustained viremia in experimental hamster scrapie. Arch Virol 82: 105–109 Dickinson AG, Fraser H (1977) Scrapie: pathogenesis in inbred mice; an assessment of host control and response involving many strains of agent. In: ter Meulen V, Katz M (eds) Slow virus infections of the central nervous system. Springer, Wien New York, pp 3–14 Duguid JR, Rohwer RG, Seed B (1988) Isolation of cDNAs of scrapie-modulated RNAs by subtractive hybridization of a cDNA library. Proc Natl Acad Sci USA 85: 5738–5742 Duguid JR, Bohmont CW, Liu N, Tourtellotte WW (1989) Changes in brain expression shared by scrapie and Alzheimer disease. Proc Natl Acad Sci USA 86: 7260–7264 Ehlers B, Diringer H (1984) Dextran sulphate 500 delays and prevents mouse scrapie by impairment of agent replication in spleen. J Gen Virol 65: 1325–1330 Ehlers B, Rudolph R, Diringer H (1984) The reticuloendothelial system in scrapie pathogenesis. J Gen Virol 65: 423–428 Eklund C, Hadlow NJ, Kennedy RC (1963) Some properties of the scrapie agent and its behaviour in mice. Proc Soc Exp Biol 112: 974–979 Hawley RG, Shulman MJ, Hozui N (1984) Transposition of two different intracisternal A-particle elements into an immunoglobulin kappa-chain gene. Mol Cell Biol 4: 2565–2572 Heidmann O, Heidmann T (1991) Retrotransposition of a mouse IAP sequence tagged with an indicator gene. Cell 64: 159–170 Kimberlin RH, Walker CA (1986) Pathogenesis of scrapie (strain 263 K) in hamsters infected intracerebrally, intraperitoneally or intraoccularly. J Gen Virol 67: 255–263 Kuff EL, Leuders KK (1988) The intracisternal A-particle gene family: structure and functional aspects. Adv Cancer Res 51: 183–276 Kuroda Y, Gibbs CJ, Gajdusek DC (1983) Creutzfeldt-Jakob disease in mice: persistent viremia and preferential replication of virus in low density lymphocytes. Infect Immun 41: 154–161 Leuders KK, Kuff EL (1983) Comparison of the sequence organization of related retrovirus-like multigene families in three evolutionary distinct rodent genomes. Nucleic Acids Res 11: 4391–4408 Manuelidis EE (1985) Creutzfeldt-Jakob disease. J Neuropathol Exp Neurol 44: 1–17 Manuelidis EE, Angelo J, Kim JH, Manuelidis L (1976) Serial propagation of Creutzfeldt-Jakob disease in guinea pigs. Proc Natl Acad Sci USA 73: 223–227 Manuelidis EE, deFigueiredo JM, Kim JH, Fritch WW, Manuelidis L (1988) Transmission studies from blood of Alzheimer's disease patients and healthy relatives. Proc Natl Acad Sci USA 85: 4898–4901 Manuelidis EE, Fritch WW, Kim JH, Manuelidis L (1987) Immortality of cell cultures derived from brains of mice and hamsters infected with Creutzfeldt-Jakob disease agent. Proc Natl Acad Sci USA 84: 871–875 Manuelidis EE, Gorgacz EJ, Manuelidis L (1978) Viremia in experimental Creutzfeldt-Jakob disease. Science 200: 1069–1071 Manuelidis EE, Gorgacz EJ, Manuelidis L (1978) Transmission of Creutzfeldt-Jakob disease to mice with scrapie-like syndromes. Nature 271: 778–779 Manuelidis EE, Gorgacz EJ, Manuelidis L (1978) Interspecies transmission of Creutzfeldt-Jakob disease to Syrian hamsters with reference to clinical syndromes and strains of agent. Proc Natl Acad Sci USA 75: 3432–3436 Manuelidis EE, Kim JH, Manuelidis L (1986) Serial transmission of Gerstmann-Straussel Scheinker disease to different strains of hamsters. In: Abstracts X Interim. Congress of Neuropatholy, Stockholm, Sweden, 1986, p 166 Manuelidis EE, Kim JH, Mericangas JR, Manuelidis L (1985) Transmission of Creutzfeldt-Jakob disease from human blood. Lancet ii: 896–897 Manuelidis EE, Manuelidis L (1979) Clinical and morphological aspects of transmissible Creutzfeldt-Jakob disease. Prog Neuropathol 4: 1–26 Manuelidis EE, Manuelidis L (1989) Suggested links between different types of dementias: Creutzfeldt-Jakob disease, Alzheimer's disease and retroviral CNS infections. Alzheimer Dis Assoc Disord 3: 101–109 Manuelidis EE, Manuelidis L (1991) Search for a transmissible agent in Alzheimer's disease: studies of human buffy coat. In: Chesebro BW (ed) Transmissible spongiform encephalopathies, scrapie, BSE and related disorders. Springer, Berlin Heidelberg New York Tokyo, pp 275–280 (Current topics in microbiology and immunology, vol 172) Manuelidis L, Murdoch G, Manuelidis EE (1988) Potential involvement of retroviral elements in human dementias. CIBA Found Symp 135: 117–134 Manuelidis EE, Rorke LB (1989) Transmission of Alper's disease (chronic progressive encephalopathy) produces experimental Creutzfeldt-Jakob disease in hamsters. Neurology 39: 615–621 Manuelidis L, Sklaviadis T, Manuelidis EE (1987) Evidence suggesting that PrP is not the infectious agent in Creutzfeldt-Jakob disease. EMBO J 6: 341–347 Manuelidis L, Tesin DM, Sklaviadis T, Manuelidis EE (1987) Astrocyte gene expression in Creutzfeldt-Jakob disease. Proc Natl Acad Sci USA 84: 5937–5941 Marciani DJ, Kuff EL (1973) Isolation and partial characterization of the internal structural proteins from murine intracisternal A particles. Biochemistry 12: 5075–5083 Meyer N, Rosenbaum V, Schmidt B, Gilles K, Mirenda C, Groth D, Prusiner SB, Riesner D (1991) Search for a putative scrapie genome in purified prion fractions reveals a paucity of nucleic acids. J Gen Virol 72: 37–49 Murdoch GH, Sklaviadis T, Manuelidis EE, Manuelidis L (1990) Potential retroviral RNAs in Creutzfeldt-Jakob disease. J Virol 64: 1477–1486 Oesch B, Groth DF, Prusiner SB, Weissman C (1988) Search for a scrapie-specific nucleic acid: a progress report. CIBA Found Symp 135: 209–233 Oleszak EL, Manuelidis L, Manuelidis EE (1986) In vitro transformation elicited by Creutzfeldt-Jakob infected brain material. J Neuropathol Exp Neurol 45: 489–502 Ono M, Toh H, Miyata T, Awaya T (1985) Nucleotide sequence of the Syrian hamster intracisternal A-particle gene: close evolutionary relationship of type A particle gene to types B and D oncovirus genes. J Virol 55: 387–394 Ono M, Yasunaga T, Miyata T, Ushikubo H (1986) Nucleotide sequence of human endogenous retrovirus genome related to the mouse mammary tumor virus genome. J Virol 60: 589–598 Prusiner SB (1982) Novel proteinaceous infectious particles cause scrapie. Science 216: 136–144 Prusiner SB (1989) Scrapie prions. Annu Rev Microbiol 43: 345–374 Rubenstein R, Merz PA, Kascsak RJ, Scalici CL, Papini MC, Carp RI, Kimberlin RH (1991) Scrapie-infected spleens: analysis of infectivity, scrapie-associated fibrils, and protease-resistant proteins. J Infect Dis 164: 29–35 Shih A, Misra R, Rush MG (1989) Detection of multiple, novel reverse transcriptase coding sequences in human nucleic acids: relation to primate retroviruses. J Virol 65: 64–75 Sklaviadis T, Akowitz A, Manuelidis EE, Manuelidis L (1990) Nuclease treatment results in high specific purification of Creutzfeldt-Jakob disease infectivity with a density characteristic of a nucleic acid-protein complex. Arch Virol 112: 215–229 Sklaviadis T, Manuelidis L, Manuelidis EE (1989) Physical properties of the Creutzfeldt-Jakob disease agent. J Virol 63: 1212–1222 Sklaviadis T, Dreyer R, Manuelidis L (1992) Analysis of Creutzfeldt-Jakob disease infectious fractions by gel permeation chromatography and sedimentation field flow fractionation. Virus Res 26: 241–254 Taruscio D, Manuelidis L (1991) Integration site preferences of endogenous retroviruses. Chromosoma 101: 141–156 Tateishi J (1985) Transmission of Creutzfeldt-Jakob disease from human blood and urine into mice. Lancet ii: 1074 Tateishi J, Nagara H, Hikita K, Sato Y (1984) Amyloid plaques in the brains of mice with Creutzfeldt-Jakob disease. Ann Neurol 15: 278–280 Weiss R, Teich N, Varmos H, Coffin J (1984) RNA tumor viruses, 2nd edn. Cold Spring Harbor Laboratory, New York Wietgrefe SM, Zupanic M, Hasse A, Chesebro B, Race R, Frey W, Rustan T, Friedmann RL (1985) Cloning of a gene whose expression is increased in scrapie and in senile plaques in human brain. Science 230: 1177–1179 Xi YG, Ingrosso L, Ladogana A, Masullo C, Pocchiari M (1992) Amphotericin B treatment dissociates in vivo replication of the scrapie agent from PrP accumulation. Nature 356: 598–601