Dự đoán giá trị hệ số cô đặc sinh học của các chất ô nhiễm hữu cơ dựa trên các mô tả MEDV lấy từ QSAR

Science in China Series B: Chemistry - Tập 50 - Trang 587-592 - 2007
ShiHai Cui1,2, Jing Yang1, ShuShen Liu2,3, LianSheng Wang2
1College of Chemistry and Environment, Nanjing Normal University, Nanjing, China
2State Key Laboratory of Pollution Control and Resources Reuse, School of the Environment Nanjing University, Nanjing, China
3Key Laboratory of Yangtze Aquatic Environment, Ministry of Education, College of Environmental Science and Engineering, Tongji University, Shanghai, China

Tóm tắt

Vector độ âm điện phân tử (MEDV) được sử dụng để mô tả cấu trúc hóa học của các chất ô nhiễm hữu cơ. Các mối quan hệ tuyến tính định lượng giữa các mô tả phân tử và giá trị BCF được phát triển thông qua phân tích hồi quy chọn lựa tốt nhất và hồi quy bậc nhất riêng. Các yếu tố cấu trúc chính ảnh hưởng đến hoạt tính sinh học là -CH2, -X, -C≮, -C≮, -O-. Các giá trị cao của r 2 và q 2 LOO cho thấy khả năng ước lượng tốt và độ ổn định của các mô hình. Khả năng dự đoán cho các mẫu bên ngoài được xác thực bởi mô hình được phát triển từ tập huấn luyện.

Từ khóa

#MEDV #hệ số cô đặc sinh học #chất ô nhiễm hữu cơ #mô tả phân tử #hồi quy.

Tài liệu tham khảo

Bintein S, Devillers J, Karcher W. Nonlinear Dependence of Fish Bioconcentration on n-Octanol/Water Partition Coefficient. SAR QSAR Environ Res, 1993, 1(1): 29–39 Devillers J, Bintein S, Domine D. Comparison of BCF Models Based on LogP. Chemosphere, 1996, 33(6): 1047–1065 Meylan W M, Howard P H, Boethling R S, Aronson D, Printup H, Gouichie S. Improved Method for Estimating Bioconcentration/Bioaccumulation Factor from Octanol/Water Partition Coefficient. Environ Toxicol Chem, 1999,18(4): 664–672 Gramatica P, Papa E. QSAR Modeling of Bioconcentration Factor by theoretical molecular descriptors. QSAR & Comb Sci, 2003, 22(3): 374–385 Lu X X, Tao S, Hu H, Dawson R W. Estimation of Bioconcentration Factors of Nonionic Organic Compounds in Fish by Molecular Connectivity Indices and Polarity Correction Factors. Chemosphere, 2000, 41(10): 1675–1688 Cramer R D, Patterson D E, Bunce J D. Comparative molecular field analysis (CoMFA). 1. Effect of shape on binding of steroids to carrier proteins. J Am Chem Soc, 1988, 110(18): 5959–5967 Klebe G, Abraham U. Comparative molecular similarity index analysis (CoMSIA) to study hydrogen-bonding properties and to score combinatorial libraries. J Comput Aid Mol Des, 1999, 13(1): 1–10 Cui S, Wang X, Liu S, Wang L. Predicting Inhibition Toxicity of Benzene Derivatives by Molecular Hologram Derived QSARs. SAR QSAR Environ Res, 2003, 14(3): 223–231 Hall L H, Kier L B. The electrotopological state: Structure information at the atomic level for molecular graph. J Chem Inf Comput Sci, 1991, 31(1): 76–83 Liu S S, Yin C S, Li Z L, Cai S X. QSAR Study of Steroid Benchmark and Dipeptides Based on MEDV-13. J Chem Inf Comput Sci, 2001, 41(2), 321–329 Liu S S, Yin C S, Wang L S. Combined MEDV-GA-MLR method for QSAR of three panels of steroids, dipeptides, and COX-2 inhibitors. J Chem Inf Comput Sci, 2002, 42(3):749–756 Liu S S, Liu H L, Shi Y Y, Wang L S. QSAR of Cyclooxygenase-2 (COX-2) inhibition by 2,3-diarylcyclopentenones based on MEDV-13. Int Elec J Mol Des, 2002, 1(6): 310–318 Eriksson L, Johansson E, Kettaneh-Wold N, Wold S. Multi-and Megavariate Data Analysis, Principles and Applications, Sweden Academy, Umea, 2001. 494–495 US EPA. Fish BCF. Ecological Effects Test Guidelines, OPPTS 850.1730. 1996