Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Sự phát triển quần thể của tác nhân gây bệnh héo cà phê Gibberella xylarioides phản ánh sự phân hóa liên quan đến cây chủ
Tóm tắt
Sự biến đổi của 45 dòng văn hóa Gibberella xylarioides được phân lập từ cây cà phê ở châu Phi đã được đánh giá bằng cách giải mã gen yếu tố kéo dài dịch mã phần tử, phân tích biến hình chiều dài đoạn cắt DNA (RFLP) giàu A + T và phân tách ngón tay polymerase chuỗi lặp đơn giản (ISSR). Kết quả đã được phân tích liên quan đến loài cây chủ và khả năng sinh sản để xác định các loài sinh học (BS). Thêm vào đó, năm dòng "lịch sử" được phân lập trước những năm 1990 và được coi là thuộc về G. xylarioides đã được thu thập từ các bộ sưu tập văn hóa được công nhận quốc tế và thêm 10 dòng của nhiều loài Gibberella/Fusarium spp., được phân lập từ loài Coffea spp., đã được đưa vào để cung cấp các so sánh ngữ cảnh. Giải mã không gian liên gen ribosome (IGS) đã được thực hiện cho các đại diện của BS được đề xuất. Kết quả xác nhận tất cả các dòng đều là G. xylarioides và các dòng thuộc nhóm vô sinh 4 (SG4) có thể đại diện cho một hoặc nhiều loài "ẩn dấu" bổ sung. Dấu vân tay ISSR cho thấy một sự khác biệt liên quan đến chủ thể duy nhất, gợi ý sự lây lan clon ổn định và điều này được hỗ trợ bởi các mẫu DNA band giàu A + T nhất quán cho tất cả các dòng. Ngược lại, các trình tự IGS xác định các sự kiện phát sinh chủng loại tiềm năng liên quan đến BS.
Từ khóa
#Gibberella xylarioides #bệnh héo cà phê #phân tích RFLP #dấu vân tay ISSR #sự phân hóa di truyềnTài liệu tham khảo
citation_journal_title=Molecular Plant - Microbe Interactions; citation_title=Relationships among pathogenic and non-pathogenic isolates of Fusarium oxysporum based on partial sequence of the intergenic spacer region of the ribosomal DNA; citation_author=DJ Appel, TR Gordon; citation_volume=9; citation_publication_date=1996; citation_pages=125-138; citation_doi=10.1094/MPMI-9-0125; citation_id=CR1
citation_journal_title=Annual Review of Ecology and Systematics; citation_title=Fungal molecular systematics; citation_author=TD Bruns, TJ White, JW Taylor; citation_volume=22; citation_publication_date=1991; citation_pages=525-564; citation_doi=10.1146/annurev.es.22.110191.002521; citation_id=CR2
citation_title=The Genus
; citation_publication_date=1971; citation_id=CR3; citation_author=C Booth; citation_publisher=Commonwealth Mycological Institute
citation_title=C.M.I. Descriptions of pathogenic fungi and bacteria. Set 3; citation_publication_date=1964; citation_id=CR4; citation_author=C Booth; citation_author=JM Waterston; citation_publisher=Commonwealth Mycological Institute
citation_journal_title=FAO Plant Protection Bulletin; citation_title=International assistance in plant pathology in developing countries, with particular relevance to FAO programmes; citation_author=L Chiarappa; citation_volume=17; citation_publication_date=1969; citation_pages=1-8; citation_id=CR5
citation_journal_title=Plant Systematics and Evolution; citation_title=DNA extraction and PCR amplification method suitable for fresh, herbarium stored and lichenized fungi; citation_author=OF Cubero, A Crespo, J Fatehi, PD Bridge; citation_volume=216; citation_publication_date=1999; citation_pages=243-249; citation_doi=10.1007/BF01084401; citation_id=CR6
citation_title=Sur une maladie très grave du caféier en Oubangui; citation_publication_date=1940; citation_id=CR7; citation_author=R Figueres; citation_publisher=Rapport. Ministère des Colonies
citation_title=Introduction; citation_inbook_title=Coffee Wilt Disease; citation_publication_date=2009; citation_pages=1-6; citation_id=CR8; citation_author=J Flood; citation_publisher=CAB International
citation_journal_title=Bulletin Agricole du Congo Belge; citation_title=Observations préliminaires sur une trachéomycose de Coffea robusta
; citation_author=J Fraselle; citation_volume=XLI; citation_publication_date=1950; citation_pages=361-372; citation_id=CR9
citation_journal_title=Mycologia; citation_title=
Gibberella xylarioides (anamorph: Fusarium xylarioides), a causative agent of coffee wilt disease in Africa, is a previously unrecognized member of the G. fujikuroi species complex; citation_author=DM Geiser, ML Lewis Ivey, G Hakiza, JH Juba, SA Miller; citation_volume=97; citation_publication_date=2005; citation_pages=191-201; citation_doi=10.3852/mycologia.97.1.191; citation_id=CR10
citation_title=Coffee wilt disease in Ethiopia; citation_inbook_title=Coffee Wilt Disease; citation_publication_date=2009; citation_pages=50-68; citation_id=CR11; citation_author=A Girma; citation_author=A Million; citation_author=H Hindorf; citation_author=Z Arega; citation_author=D Teferi; citation_author=C Jefuka; citation_publisher=CAB International
citation_journal_title=Mycological Research; citation_title=Characterisation of dark septate fungi (DSE) using inter-simple-sequence-repeat-anchored polymerase chain reaction (ISSR-PCR) amplification; citation_author=CR Grünig, TN Sieber, O Holdenrieder; citation_volume=105; citation_publication_date=2001; citation_pages=24-32; citation_doi=10.1017/S0953756200003658; citation_id=CR12
citation_title=Coffee wilt disease in Uganda; citation_inbook_title=Coffee Wilt Disease; citation_publication_date=2009; citation_pages=28-49; citation_id=CR13; citation_author=GJ Hakiza; citation_author=DT Kyetere; citation_author=P Musoli; citation_author=P Wetala; citation_author=J Njuki; citation_author=P Kucel; citation_author=P Aluka; citation_author=A Kangire; citation_author=J Ogwang; citation_publisher=CAB International
citation_journal_title=Supplément Colonial a la Revue de Mycologie; citation_title=La carbunculariose du Caféier; citation_author=R Heim; citation_volume=15; citation_publication_date=1950; citation_pages=89-98; citation_id=CR14
citation_journal_title=Mathematical Biosciences; citation_title=Branch and bound algorithms to determine minimal evolutionary trees; citation_author=MD Hendy, D Penny; citation_volume=59; citation_publication_date=1982; citation_pages=277-290; citation_doi=10.1016/0025-5564(82)90027-X; citation_id=CR15
citation_title=Coffee wilt disease in Democratic Republic of Congo; citation_inbook_title=Coffee Wilt Disease; citation_publication_date=2009; citation_pages=7-27; citation_id=CR16; citation_author=A Kalonji-Mbuyi; citation_author=P Tshilenge-Djim; citation_author=NT Saiba; citation_publisher=CAB International
Kilambo, D., Kaiza, D. & Swai, F.B. (1997). Observations of wilt disease in some coffee growing areas in Tanzania. In: Proceedings of the 1st Regional Workshop on Coffee Wilt disease (tracheomycosis). International Conference Centre, Kampala, Uganda.
Kilambo, D.L., Ng’homa, N.M., Mtenga, D.J., Teri, J.M., Nzallawahe, T., Rutherford, M. & Masumbuko, L. (2006). Progress towards searching for durable resistance to Fusarium Wilt (Fusarium xylarioides) in Coffea canephora germplasm in Tanzania. Proceedings of the 21st International Scientific Conference on Coffee Science (ASIC), 11–15 September 2006, Montpellier, France. pp 1386–1389.
citation_title=Status of coffee wilt disease in Tanzania; citation_inbook_title=Coffee Wilt Disease; citation_publication_date=2009; citation_pages=69-82; citation_id=CR19; citation_author=DL Kilambo; citation_author=NM Ng’homa; citation_author=JM Teri; citation_author=L Masumbuko; citation_publisher=CAB International
citation_journal_title=Journal of Molecular Evolution; citation_title=A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences; citation_author=M Kimura; citation_volume=16; citation_publication_date=1980; citation_pages=111-120; citation_doi=10.1007/BF01731581; citation_id=CR20
citation_journal_title=Phytopathologische Zeitschrift; citation_title=
Gibberella xylarioides Heim et Saccas on arabica coffee in Ethiopia; citation_author=J Kranz, M Mogk; citation_volume=78; citation_publication_date=1973; citation_pages=365-366; citation_doi=10.1111/j.1439-0434.1973.tb04186.x; citation_id=CR21
Lejeune, J. B. H. (1958). Rapport au Gouvernement Impérial d’Éthiopie sur la production caféière (Vol. 797). Rome: FAO.
citation_journal_title=Applied and Environmental Microbiology; citation_title=
Gibberella xylarioides sensu lato from Coffea canephora: a new mating population in the Gibberella fujikuroi species complex; citation_author=PCE Lepoint, FTJ Munaut, HMM Maraite; citation_volume=71; citation_publication_date=2005; citation_pages=8466-8471; citation_doi=10.1128/AEM.71.12.8466-8471.2005; citation_id=CR23
Lepoint, P. (2006). Speciation within the African coffee wilt pathogen. PhD thesis, Université Catholique de Louvain, Belgium.
citation_journal_title=Journal of General Microbiology; citation_title=Mitochondrial DNA in Fusarium oxysporum is a 46.5 kilobase pair circular molecule; citation_author=AC Marriott, SA Archer, KW Buck; citation_volume=130; citation_publication_date=1984; citation_pages=3001-3008; citation_id=CR25
citation_journal_title=Café Cacao Thé; citation_title=Contribution aux recherches sur la trachéomycose du Caféier en Côte d’Ivoire; citation_author=M Meiffren; citation_volume=5; citation_publication_date=1961; citation_pages=28-37; citation_id=CR26
Nirenberg, H. (1976). Untersuchungen über die morphologische und biologische differenzierung in der Fusarium-Sektion Liseola. Mitteilungen aus der Biologischen Bundesanstalt für Land–und Forstwirtschaft (Berlin-Dahlem), 169, 1–117.
citation_journal_title=Molecular Phylogenetics and Evolution; citation_title=Two divergent intragenomic rDNA ITS2 types within a monophyletic lineage of the fungus Fusarium are non-orthologous; citation_author=K O’Donnell, E Cigelnik; citation_volume=7; citation_publication_date=1997; citation_pages=103-116; citation_doi=10.1006/mpev.1996.0376; citation_id=CR28
Oduor, G., Simons, S., Phiri, N., Njuki, J., Poole, J., Pinard, F., Kyetere, D., Hakiza, G., Musoli, P., Lukwago, G., Abebe, M., Tesfaye, A., Kilambo, D., Asiimwe, T. & Munyankere, P. (2003). Surveys to assess the extent and impact of coffee wilt disease in East and Central Africa. Final Technical Report, EU Contract No. ASA-RSP/CV-006. CAB International, UK.
citation_title=Biochemical techniques for filamentous fungi. IMI Technical Handbooks Vol. 1; citation_publication_date=1994; citation_id=CR30; citation_author=RRM Paterson; citation_author=PD Bridge; citation_publisher=CAB International
citation_journal_title=Netherlands Journal of Plant Pathology; citation_title=Resistance to Gibberella xylarioides in Coffea arabica: evaluation of screening methods and evidence for the horizontal nature of the resistance; citation_author=R Pieters, NA Graaff; citation_volume=86; citation_publication_date=1980; citation_pages=37-43; citation_doi=10.1007/BF02650392; citation_id=CR31
citation_journal_title=Phytopathology; citation_title=Current knowledge of coffee wilt disease, a major constraint to coffee production in Africa; citation_author=MA Rutherford; citation_volume=96; citation_publication_date=2006; citation_pages=663-666; citation_doi=10.1094/PHYTO-96-0663; citation_id=CR32
citation_title=Biology, taxonomy and epidemiology of the coffee wilt pathogen sensu
; citation_inbook_title=Coffee Wilt Disease; citation_publication_date=2009; citation_pages=99-119; citation_id=CR33; citation_author=MA Rutherford; citation_author=D Bieysse; citation_author=P Lepoint; citation_author=HMM Maraite; citation_publisher=CAB International
citation_journal_title=Agronomia Tropical; citation_title=La trachéomycose (carbunculariose) des Coffea excelsa, neo-arnoldiana et robusta en Oubangui-chari; citation_author=AM Saccas; citation_volume=6; citation_publication_date=1951; citation_pages=453-506; citation_id=CR34
citation_title=Molecular cloning: a laboratory manual; citation_publication_date=1989; citation_id=CR35; citation_author=J Sambrook; citation_author=EF Fritsch; citation_author=T Maniatis; citation_publisher=Cold Spring Harbor Laboratory Press
citation_title=Some diseases occurring in Kaffa Province, Ethiopia; citation_publication_date=1957; citation_id=CR36; citation_author=RB Stewart; citation_publisher=Imperial Ethiopian College of Agriculture and Mechanical Arts
citation_journal_title=Bulletin de la Societe Royale de Botanique de Belgique; citation_title=Contribution à l’étude des parasites des végétaux du Congo Belge; citation_author=RL Steyaert; citation_volume=80; citation_publication_date=1948; citation_pages=11-58; citation_id=CR37
citation_journal_title=Molecular Biology and Evolution; citation_title=MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0; citation_author=K Tamura, G Stecher, D Peterson, A Filipski, S Kumar; citation_volume=30; citation_publication_date=2013; citation_pages=2725-2729; citation_doi=10.1093/molbev/mst197; citation_id=CR38
citation_journal_title=Nucleic Acids Research; citation_title=CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice; citation_author=JD Thompson, DG Higgins, TJ Gibson; citation_volume=22; citation_publication_date=1994; citation_pages=4673-4680; citation_doi=10.1093/nar/22.22.4673; citation_id=CR39
citation_journal_title=Genetics; citation_title=Spore-killing meiotic drive factors in a natural population of the fungus Podospora anserina
; citation_author=M Gaag, AJM Debets, J Oosterhof, M Slakhorst, JAGM Thijssen, RF Hoekstra; citation_volume=156; citation_publication_date=2000; citation_pages=593-605; citation_id=CR40
citation_title=Plant clinic handbook. IMI Technical Series Handbook No.3; citation_publication_date=1998; citation_id=CR41; citation_author=JM Waller; citation_author=BJ Ritchie; citation_author=M Holderness; citation_publisher=CAB International