Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Phân tích meta dựa trên dân số ở người da trắng xác nhận mối liên hệ với COL5A1 và ZNF469 nhưng không phải COL8A2 với độ dày giác mạc trung tâm
Tóm tắt
Độ dày giác mạc trung tâm (CCT) đã trở thành một đặc điểm sinh học quan trọng trong rối loạn glaucoma có tính di truyền phức tạp. CCT có tính di truyền cao, và CCT mỏng là một yếu tố nguy cơ độc lập cho chẩn đoán và tiến triển của glaucoma góc mở. Các nghiên cứu liên kết toàn bộ genome đã cung cấp các locus di truyền liên quan đến CCT và có khả năng liên quan đến glaucoma góc mở. Sự phân bố của CCT và tỷ lệ mắc glaucoma trong các nghiên cứu dựa trên dân số đã cho thấy sự khác biệt giữa các dân tộc, cho thấy sự biến đổi theo chủng tộc trong các yếu tố di truyền của CCT. Chúng tôi đã tiến hành một nghiên cứu liên kết toàn bộ genome ở người da trắng (n = 3,931) từ Nghiên cứu Sức khỏe Gutenberg (Đức) và sau đó là xác nhận 30 SNP đáng chú ý (P < 10−5) trong Nghiên cứu Rotterdam (Hà Lan, n = 1,418). Trong một phân tích kết hợp, chúng tôi đã xác nhận các locus tính trạng định lượng trên nhiễm sắc thể 9q34 và 16q24 liên quan đến CCT. Trên nhiễm sắc thể 16q24, locus nằm trong một vùng giữa các gen gần gen ZNF469 (SNP hàng đầu: rs9938149, P = 1.45 × 10−12). Biến thể sai nghĩa ZNF469 liên quan đến một hội chứng có giác mạc rất mỏng (hội chứng giác mạc giòn). Locus thứ hai trên nhiễm sắc thể 9q34 đại diện cho vùng giữa gen RXRA và COL5A1 (SNP hàng đầu: rs3132306, P = 2.71 × 10−10). Collagen type 5 xác định đường kính của các sợi collagen giác mạc. Trong nghiên cứu GWA dựa trên dân số người da trắng của chúng tôi, chúng tôi nhấn mạnh sự tham gia của các gen liên quan đến collagen ảnh hưởng đến CCT ở người da trắng. Chúng tôi không thể xác nhận locus collagen type 8 trên nhiễm sắc thể 1 như đã báo cáo trong các nghiên cứu ở châu Á.
Từ khóa
#độ dày giác mạc trung tâm #glaucoma #di truyền #nghiên cứu liên kết toàn bộ genome #gen collagenTài liệu tham khảo
Abu A, Frydman M, Marek D, Pras E, Nir U, Reznik-Wolf H (2008) Deleterious mutations in the Zinc-Finger 469 gene cause brittle cornea syndrome. Am J Hum Genet 82:1217–1222
Amano S, Honda N, Amano Y, Yamagami S, Miyai T, Samejima T, Ogata M, Miyata K (2006) Comparison of central corneal thickness measurements by rotating Scheimpflug camera, ultrasonic pachymetry, and scanning-slit corneal topography. Ophthalmology 113:937–941
Birk DE (2001) Type V collagen: heterotypic type I/V collagen interactions in the regulation of fibril assembly. Micron 32:223–237
Birk DE, Fitch JM, Babiarz JP, Linsenmayer TF (1988) Collagen type I and type V are present in the same fibril in the avian corneal stroma. J Cell Biol 106:999–1008
Burvenich H, Burvenich E, Vincent C (2005) Dynamic contour tonometry (DCT) versus non-contact tonometry (NCT): a comparison study. Bull Soc Belge Ophtalmol 63–69
Charlesworth J, Kramer PL, Dyer T, Diego V, Samples JR, Craig JE, Mackey DA, Hewitt AW, Blangero J, Wirtz MK (2010) The path to open-angle glaucoma gene discovery: endophenotypic status of intraocular pressure, cup-to-disc ratio, and central corneal thickness. Invest Ophthalmol Vis Sci 51:3509–3514
Christensen AE, Knappskog PM, Midtbo M, Gjesdal CG, Mengel-From J, Morling N, Rodahl E, Boman H (2010) Brittle cornea syndrome associated with a missense mutation in the zinc-finger 469 gene. Invest Ophthalmol Vis Sci 51:47–52
Cornes BK, Khor CC, Nongpiur ME, Xu L, Tay WT, Zheng Y, Lavanya R, Li Y, Wu R, Sim X, Wang YX, Chen P, Teo YY, Chia KS, Seielstad M, Liu J, Hibberd ML, Cheng CY, Saw SM, Tai ES, Jonas JB, Vithana EN, Wong TY, Aung T (2012) Identification of four novel variants that influence central corneal thickness in multi-ethnic Asian populations. Hum Mol Genet 21:437–445
Desronvil T, Logan-Wyatt D, Abdrabou W, Triana M, Jones R, Taheri S, Del Bono E, Pasquale LR, Olivier M, Haines JL, Fan BJ, Wiggs JL (2010) Distribution of COL8A2 and COL8A1 gene variants in Caucasian primary open angle glaucoma patients with thin central corneal thickness. Mol Vis 16:2185–2191
Dimasi DP, Burdon KP, Craig JE (2009a) The genetics of central corneal thickness. Br J Ophthalmol
Dimasi DP, Chen JY, Hewitt AW, Klebe S, Davey R, Stirling J, Thompson E, Forbes R, Tan TY, Savarirayan R, Mackey DA, Healey PR, Mitchell P, Burdon KP, Craig JE (2009b) Novel quantitative trait loci for central corneal thickness identified by candidate gene analysis of osteogenesis imperfecta genes. Hum Genet
Estrada K, Abuseiris A, Grosveld FG, Uitterlinden AG, Knoch TA, Rivadeneira F (2009) GRIMP: a web- and grid-based tool for high-speed analysis of large-scale genome-wide association using imputed data. Bioinformatics 25:2750–2752
Fichard A, Kleman JP, Ruggiero F (1995) Another look at collagen V and XI molecules. Matrix Biol 14:515–531
Gordon MO, Beiser JA, Brandt JD, Heuer DK, Higginbotham EJ, Johnson CA, Keltner JL, Miller JP, Parrish RK, 2nd, Wilson MR, Kass MA (2002) The Ocular Hypertension Treatment Study: baseline factors that predict the onset of primary open-angle glaucoma. Arch Ophthalmol 120:714–720 (discussion 829–830)
Hofman A, van Duijn CM, Franco OH, Ikram MA, Janssen HL, Klaver CC, Kuipers EJ, Nijsten TE, Stricker BH, Tiemeier H, Uitterlinden AG, Vernooij MW, Witteman JC (2011) The Rotterdam Study: 2012 objectives and design update. Eur J Epidemiol 26:657–686
Huang J, Pesudovs K, Yu A, Wright T, Wen D, Li M, Yu Y, Wang Q (2011) A comprehensive comparison of central corneal thickness measurement. Optom Vis Sci 88:940–949
Ishibazawa A, Igarashi S, Hanada K, Nagaoka T, Ishiko S, Ito H, Yoshida A (2011) Central corneal thickness measurements with Fourier-domain optical coherence tomography versus ultrasonic pachymetry and rotating Scheimpflug camera. Cornea 30:615–619
Khan AO (2011) Genetics of primary glaucoma. Curr Opin Ophthalmol 22:347–355
Leske MC, Heijl A, Hyman L, Bengtsson B, Dong L, Yang Z (2007) Predictors of long-term progression in the early manifest glaucoma trial. Ophthalmology 114:1965–1972
Lu Y, Dimasi DP, Hysi PG, Hewitt AW, Burdon KP, Toh T, Ruddle JB, Li YJ, Mitchell P, Healey PR, Montgomery GW, Hansell N, Spector TD, Martin NG, Young TL, Hammond CJ, Macgregor S, Craig JE, Mackey DA (2010) Common genetic variants near the Brittle Cornea Syndrome locus ZNF469 influence the blinding disease risk factor central corneal thickness. PLoS Genet 6:e1000947
Malfait F, Wenstrup RJ, De Paepe A (2010) Clinical and genetic aspects of Ehlers–Danlos syndrome, classic type. Genet Med 12:597–605
Marchini J, Howie B, Myers S, McVean G, Donnelly P (2007) A new multipoint method for genome-wide association studies by imputation of genotypes. Nat Genet 39:906–913
Medeiros FA, Sample PA, Zangwill LM, Bowd C, Aihara M, Weinreb RN (2003) Corneal thickness as a risk factor for visual field loss in patients with preperimetric glaucomatous optic neuropathy. Am J Ophthalmol 136:805–813
Meek KM, Fullwood NJ (2001) Corneal and scleral collagens—a microscopist’s perspective. Micron 32:261–272
Miglior S, Pfeiffer N, Torri V, Zeyen T, Cunha-Vaz J, Adamsons I (2007) Predictive factors for open-angle glaucoma among patients with ocular hypertension in the European Glaucoma Prevention Study. Ophthalmology 114:3–9
Murase H, Sawada A, Mochizuki K, Yamamoto T (2009) Effects of corneal thickness on intraocular pressure measured with three different tonometers. Jpn J Ophthalmol 53:1–6
Pruim RJ, Welch RP, Sanna S, Teslovich TM, Chines PS, Gliedt TP, Boehnke M, Abecasis GR, Willer CJ (2010) LocusZoom: regional visualization of genome-wide association scan results. Bioinformatics 26:2336–2337
Purcell S, Neale B, Todd-Brown K, Thomas L, Ferreira MA, Bender D, Maller J, Sklar P, de Bakker PI, Daly MJ, Sham PC (2007) PLINK: a tool set for whole-genome association and population-based linkage analyses. Am J Hum Genet 81:559–575
Quigley HA, Broman AT (2006) The number of people with glaucoma worldwide in 2010 and 2020. Br J Ophthalmol 90:262–267
Resnikoff S, Pascolini D, Etya’ale D, Kocur I, Pararajasegaram R, Pokharel GP, Mariotti SP (2004) Global data on visual impairment in the year 2002. Bull World Health Organ 82:844–851
Rotival M, Zeller T, Wild PS, Maouche S, Szymczak S, Schillert A, Castagne R, Deiseroth A, Proust C, Brocheton J, Godefroy T, Perret C, Germain M, Eleftheriadis M, Sinning CR, Schnabel RB, Lubos E, Lackner KJ, Rossmann H, Munzel T, Rendon A, Erdmann J, Deloukas P, Hengstenberg C, Diemert P, Montalescot G, Ouwehand WH, Samani NJ, Schunkert H, Tregouet DA, Ziegler A, Goodall AH, Cambien F, Tiret L, Blankenberg S (2011) Integrating genome-wide genetic variations and monocyte expression data reveals trans-regulated gene modules in humans. PLoS Genet 7:e1002367
Sanfilippo PG, Hewitt AW, Hammond CJ, Mackey DA (2010) The heritability of ocular traits. Surv Ophthalmol 55:561–583
Segev F, Heon E, Cole WG, Wenstrup RJ, Young F, Slomovic AR, Rootman DS, Whitaker-Menezes D, Chervoneva I, Birk DE (2006) Structural abnormalities of the cornea and lid resulting from collagen V mutations. Invest Ophthalmol Vis Sci 47:565–573
Sun M, Chen S, Adams SM, Florer JB, Liu H, Kao WW, Wenstrup RJ, Birk DE (2011) Collagen V is a dominant regulator of collagen fibrillogenesis: dysfunctional regulation of structure and function in a corneal-stroma-specific Col5a1-null mouse model. J Cell Sci 124:4096–4105
Vitart V, Bencic G, Hayward C, Skunca Herman J, Huffman J, Campbell S, Bucan K, Navarro P, Gunjaca G, Marin J, Zgaga L, Kolcic I, Polasek O, Kirin M, Hastie ND, Wilson JF, Rudan I, Campbell H, Vatavuk Z, Fleck B, Wright A (2010) New loci associated with central cornea thickness include COL5A1, AKAP13 and AVGR8. Hum Mol Genet 19:4304–4311
Vithana EN, Aung T, Khor CC, Cornes BK, Tay WT, Sim X, Lavanya R, Wu R, Zheng Y, Hibberd ML, Chia KS, Seielstad M, Goh LK, Saw SM, Tai ES, Wong TY (2011) Collagen-related genes influence the glaucoma risk factor, central corneal thickness. Hum Mol Genet 20:649–658
Wenstrup RJ, Florer JB, Davidson JM, Phillips CL, Pfeiffer BJ, Menezes DW, Chervoneva I, Birk DE (2006) Murine model of the Ehlers–Danlos syndrome. col5a1 haploinsufficiency disrupts collagen fibril assembly at multiple stages. J Biol Chem 281:12888–12895
Wolfs RC, Klaver CC, Vingerling JR, Grobbee DE, Hofman A, de Jong PT (1997) Distribution of central corneal thickness and its association with intraocular pressure: the Rotterdam Study. Am J Ophthalmol 123:767–772
Zeller T, Wild P, Szymczak S, Rotival M, Schillert A, Castagne R, Maouche S, Germain M, Lackner K, Rossmann H, Eleftheriadis M, Sinning CR, Schnabel RB, Lubos E, Mennerich D, Rust W, Perret C, Proust C, Nicaud V, Loscalzo J, Hubner N, Tregouet D, Munzel T, Ziegler A, Tiret L, Blankenberg S, Cambien F (2010) Genetics and beyond—the transcriptome of human monocytes and disease susceptibility. PLoS One 5:e10693
