Cấu Trúc Di Truyền Quần Thể Của Cá Dúi Vàng, Horabagrus brachysoma, Đặc Hữu Và Nguy Cấp, Sử Dụng Các Đánh Dấu Allozyme

Biochemical Genetics - Tập 45 - Trang 637-645 - 2007
P. M. Abdul Muneer1, A. Gopalakrishnan1, K. K. Lal2, V. Mohindra2
1National Bureau of Fish Genetic Resources, Cochin Unit, Kochi, India
2National Bureau of Fish Genetic Resources, Lucknow, India

Tóm tắt

Sự biến đổi allozyme và cấu trúc gen của quần thể Horabagrus brachysoma trong ba quần thể tự nhiên từ vùng phía nam của dãy Western Ghats, Ấn Độ, đã được nghiên cứu thông qua điện di gel polyacrylamide. Sự biến đổi tại 14 loci từ 14 hệ enzyme đã được phân tích. Phân tích allozyme cho thấy mức độ biến đổi di truyền cao ở loài này, với trung bình số allele quan sát được trên mỗi locus là 2.357 và tỉ lệ dị hợp tử quan sát được là 0.178. Giá trị dương của chỉ số cố định (F_IS = 0.507) cho thấy sự thiếu hụt đáng kể của dị hợp tử trên mức quần thể. Xác suất có ý nghĩa rất lớn (P < 0.0001) cho tất cả các loci gợi ý rằng ba bộ mẫu này không thuộc về cùng một nguồn gen.

Từ khóa

#allozyme #Horabagrus brachysoma #cấu trúc di truyền #di truyền quần thể #Western Ghats

Tài liệu tham khảo

Belkhir K, Borsa P, Goudet J, Chikhi L, Bonhomme F (1997). Genetix vers. 4.05: Genetics logiciel sous Windows pour la génétique des populations. http://www.univ- montp2.fr/∼gentix/genetix/html CAMP (1998). Report of the workshop Conservation Assessment and Management Plan (CAMP) for freshwater fishes of India, organized by Zoo Outreach Organization and National Bureau of Fish Genetic Resources, Lucknow, held at NBFGR in September 1997. Zoo Outreach Organization, Coimbatore, India Ferguson A (1980) Biochemical systematics and evolution. Blackie and Son Ltd., Glasgow Ferguson A, Taggart JB, Prodohl PA, McMeel O, Thompson C, Stone C, McGinnity P, Hynes RA (1995) The application of molecular markers to the study and conservation of fish populations, with special reference to Salmo. J Fish Biol 47(Suppl. A):103–126 Kang SS, Chung MG (1997) Genetic variation and population structure in Korean endemic species, 4: Hemerocallis hakuunenesis (Liliaceae). J Plant Sci 110:209–217 Lal KK, Kumar D, Srivastava SK, Mukherjee A, Mohindra V, Prakash S, Sinha M, Ponniah AG (2004) Genetic variation in Tenualosa ilisha (Hamilton-Buchanan) population in river Ganges. Ind J Fish 51(1):33–42 Myers N, Mittermiler RA, Mittermiler CG, Da-Fonseca GAB, Kent J (2000) Biodiversity hotspots for conservation priorities. Nature 403:853–858 Nei M. (1978) Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics 89:583–590 Nevo E., Belles A., Ben Shlomo R. (1984) The evolutionary significance of genetic diversity: ecological, demographic and life history correlates. In Mani G. S. (ed.), Evolutionary dynamics of genetic diversity, Springer-Verlag, New York, pp 18–137 Ponniah AG, Gopalakrishnan A, Basheer VS, Muneer PMA, Paul B, Padmakumar KG, Krishnan A (2000) Captive breeding and gene banking of endangered, endemic yellow catfish Horabagrus brachysoma. Sustainable fisheries and aquaculture for nutritional security (national seminar), Chennai. Abstract, p 99 Pouyaud L, Teugels GG, Gustiano R, Legendre M (2000). Contribution to the phylogeny of pangasiid catfish (Siluriformes, Pangasiidae) based on allozymes and mitochondrial DNA. J Fish Biol 56:1509–1538 Raymond M, Rousset F (1998). GenePop (ver. 3.1): A population genetics software for exact test and ecumenicism. J Heredity 86:248–249 Rognon X, Teugels G, Guyomard R, Andramanga M, Volckaert F, Agnèse JF (1998). Morphometric and allozyme variation in the African catfishes Clarias gariepinus and C. anguillaris. J Fish Biol 53:192–207 Salini JP, Milton DA, Rahman MJ, Hussein MG (2004). Allozyme and morphological variation throughout the geographic range of the tropical shad, Tenualosa ilisha. Fish Res 66(1):53–69 Shaklee JB, Tamaru CS, Waples RS (1982). Speciation and evolution of marine fishes studied by electrophoretic analysis of proteins. Pac Sci 36:141–156 Shaklee JB, Allendorf FW, Morizon DC, Whitt GS (1990). Gene nomenclature for protein-coding loci in fish. Trans Amer Fish Soc 119:2–15 Shaw CR, Prasad R (1970). Starch gel electrophoresis of enzymes: a compilation of recipes. Biochem Genet 4:297–320 Singh RK, Chauhan T, Mohindra V, Kapoor D, Punia P, Lal KK (2004). Identification of allozyme markers for population structure analysis in Cirrhinus mrigala (Hamilton-Buchanan, 1882). Ind J Fish 51(1):117–122 Sneath PHA, Sokal RR (1973). Numerical taxonomy. W. H. Freeman and Co., San Francisco, 573 pp Yeh FC, Yang RC, Boyle T (1999). PopGene Version 1.31: Microsoft Windows based freeware for population genetics analysis. http://www.ualberta.ca/_fyeh. University of Alberta and Centre for International Forestry Research, Canada