Các dấu ấn phân tử thu được từ PCR và mối quan hệ phát sinh loài trong chi Secale

Institute of Experimental Botany - Tập 37 - Trang 481-489 - 1995
J. C. Del Pozo1, A. M. Figueiras1, C. Benito1, A. De La Peña1
1Departamento de Genética, Facultad de Biologia, Universidad Complutense Madrid, Madrid, Spain

Tóm tắt

DNA từ 22 loài, nhập khẩu, giống và dòng khác nhau thuộc chi Secale đã được phân tích bằng phản ứng chuỗi polymerase (PCR), sử dụng năm cặp oligonucleotide bắt nguồn từ các trình tự đặc hiệu làm mồi. Tổng cộng có 42 băng khuếch đại đã được xem xét, và một số trong số chúng dường như có thể hữu ích như các dấu ấn phân tử cho một số nhóm đã phân tích. Các băng khuếch đại này đã được sử dụng để tạo ra các phenogram phân tử trong chi Secale.

Từ khóa

#PCR #dấu ấn phân tử #mối quan hệ phát sinh loài #Secale

Tài liệu tham khảo

Appels, R., Dennis, E.S., Smith, D.R., Peacoock M.J.: Two repeated sequences from heterochromatic regions in rye chromosomes.—Chromosoma84: 265–277, 1999. Benito, C., Figueiras, A.M., Zaragoza, C., Gallego, F.G., De La Peña, A.: Rapid identification ofTriticeae genotypes from single seeds using the Polymerase Chain Reaction.—Plant mol. Biol.21: 181–183, 1993. Dellaporta, S.L., Wood, J., Hicks, J.B.: A plant DNA minipreparation. Version II.—Plant mol. Biol. Rep.1: 19–21, 1983. Demeke, T., Adams, R.P., Chibbar, R.: Potential taxonomic use of Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD), a case study inBrassica L.—Theor. appl. Genet.84: 990–994, 1992. Fritch, P., Hanson, M.A., Spore, C.D., Pack, P.E., Rieseberg, L.H.: Constancy of RAPD primer amplification strength among distantly related taxa of flowering plants.—Plant mol. Biol. Rep.11: 10–20, 1993. Gausing, K., Barkardottir, R.: Structure and expresion of ubiquitin genes in higher plants.—Eur. J. Biochem.158: 57–62, 1986. Hardrys, H., Balick, M., Schierwater, B.: Applications of random amplified polymorphic DNA (RAPD) in molecular ecology.—Mol. Ecol.1: 55–63, 1992. Hart, G.E., Gale, M.D., McIntosh, R.A.: Linkage maps ofTriticum aestivum (hexaploid wheat, 2n=42, genomes A, B and D) andT. tauschii (2n=14, genome D)—In: O’Brien, S.J. (ed.): Genetic Maps. Cold Spring Harbor Laboratory, New York 1993. Khush, G.S.: Cytogenetic and evolutionary studies inSecale II. Interrelationships of the wild species. —Evolution16: 484–496, 1962. Khush, G.S., Stebbins, G.L.: Cytogenetic and evolutionary studies inSecale. Some new data on the ancestry ofSecale.—Amer. J. Bot.48: 723–730, 1961. Knox, C.A., Sonthayanon, B., Chandra, G.R.: Structure and organization of two divergent alphaamylase genes from barley.—Plant mol. Biol.9: 3–17, 1987. Kreis, M., Forde, B.G., Rahman, S., Minflin, B.J., Shewry, P.R.: Molecular evolution of the seed storage proteins of barley, rye and wheat.—J. mol. Biol.183: 499–502, 1985. Marchionni, M., Gilbert, W.: The triosephosphate isomerase gene from maize: introns antedate the plant-animal divergence.—Cell46: 133–141, 1986. Nei, M.: Estimation of average heterozygosity and genetic distance from number of individuals.— Genetics89: 583–590, 1978. Nei, M., Stephens, J.C., Saitou, N.: Methods for computing the standard errors of branching points in an evolutionary tree and their application to molecular data from humans and apes.—Mol. biol. Evol.2: 66–85, 1985. Nei, M., Tajima, F., Taneto, Y.: Accuracy of estimated phylogenetic trees from molecular data. 2. Gene frecuency data.—J. mol. Evol.19: 153–170, 1983. Rohf, J.: NTSYS-pc, Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System. Version 1.6.—Exeter Software, New York 1990. Song, K., Osborconn, T.C., Williams, P.H.:Brassica L. taxonomy based on nuclear restriction fragment length polymorphism (RFLPs)—Theor. appl. Genet.79: 497–506, 1990. Taneto, Y., Nei, M., Tajima, F.: Accuracy of estimated phylogenetic trees from molecular data. 1. Distantly related species.—J. mol. Evol.18: 387–404, 1982. Vences, F.J., Vaquero, F., Pérez De La Vega, M.: Phylogenetic relationships inSecale: an isozymatic study.—Plant Syst. Evol.157: 33–47, 1987. Zhukovsky, P.M.: A new wild growing form of rye in Anatolia.—Bull. appl. Bot.19: 49–56, 1926.