Về việc xác định genotypes của Phytophthora infestans bằng phương pháp phân tử

Russian Agricultural Sciences - Tập 40 - Trang 435-438 - 2015
M. P. Beketova1, E. A. Sokolova1, O. P. Malyuchenko1, Ya. I. Alekseev1, M. A. Kuznetsova2, B. E. Kozlovsky2, E. V. Rogozina3, E. E. Khavkin1
1All-Russia Research Institute of Agricultural Biotechnology, Moscow, Russia
2All-Russia Research Institute of Phytopathology, Moscow region, Russia
3N.I. Vavilov All-Russia Research Institute of Plant Industry, St. Peterburg, Russia

Tóm tắt

Các mẫu P. infestans đã được thu thập vào năm 2013 từ lá khoai tây bị nhiễm bệnh tại các ô đất Pushkin thuộc Viện Công nghiệp Thực vật, St. Petersburg. Dữ liệu phytopathological về các kiểu giao phối A1/A2 đã khớp với chứng cứ thu được qua phân tích marker CAPS. Khi được xác định kiểu gen bằng các marker SSR, các mẫu từ Pushkin rõ ràng khác biệt so với các chủng ở Tây Âu được mô tả bởi Cooke và cộng sự (2012).

Từ khóa

#Phytophthora infestans #kiểu gen #xác định phân tử #marker SSR

Tài liệu tham khảo

Cooke, D.E.L., Cano, L.M., Raffaele, S., et al., Genome analyses of an aggressive and invasive lineage of the Irish potato famine pathogen, PloS Pathol., 2012, vol. 8, no. 10, e1002940. Li, Y., Multiplex SSR analysis of Phytophthora infestans in different countries and the importance for potato breeding, PhD Thesis, Wageningen, Netherlands: Wageningen Univ., 2012. Meier-Runge, F., van den Bosch, T., Förch, M., et al., First results of an EU-wide genotype monitoring of Phytophthora infestans using FTA cards, in PPO-Special Report, Schepers, H.T.A.M., Ed., Wageningen: DLO Foundation, 2014, no. 16, pp. 75–82. Chmielarz, M., Sobkowiak, S., Dezbski, K., et al., Diversity of Phytophthora infestans from Poland, Plant Pathol., 2013, vol. 63, pp. 203–211. El-Ganainy, S.M., Tohamy, A.M.M., Awad, M.A., et al., The population dynamics of Phytophthora infestans in Egypt, Phytopathology, 2013, vol. 103, no. 6, suppl. 2, p. S2.39. Chowdappa, P., Kumar, N.B.J., Madhura, S., et al., Emergence of 13-A2 blue lineage of Phytophthora infestans was responsible for severe outbreaks of late blight on tomato in South-West India, J. Phytopathol., 2012, vol. 161, pp. 49–58. Statsyuk, N.V., Semina, Y.V., Perez, F.G.M., et al., Characterization of Russian Phytophthora infestans populations: DNA fingerprinting and SSR analysis, in PPO-Special Report, Schepers, H.T.A.M., Ed., Wageningen: DLO Foundation, 2014, no. 16, pp. 255–266. Mazáková, J., Zouhar, M., Ryšánek, P., et al., Mating type distribution of Phytophthora infestans (Mont.) de Bary in the Czech Republic in 2007 and 2008, Plant Prot., 2010, vol. 46, pp. 89–97. Li, Y., Cooke, D.E.L., Jacobsen, E., and van der Lee, T., Efficient multiplex simple sequence repeat genotyping of the oomycete plant pathogen Phytophthora infestans, J. Microbiol. Methods, 2013, vol. 92, pp. 316–322. Runno-Paurson, E., Hannukkala, A., Kotkas, A., et al., Population changes and phenotypic diversity of Phytophthora infestans isolates in Estonia and Finland, J. Plant Pathol., 2014, vol. 96, pp. 85–95.