Sự hiện diện và xác định phân tử của một chủng côn trùng xâm lấn của sâu quân đội mùa thu Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) từ Sindh, Pakistan, sử dụng chuỗi gene cytochrome c oxidase I ty thể

Sumaira Yousaf1, Abdul Rehman2, Mariyam Masood3, Kashif Ali2, Nazia Suleman1
1Plant Protection Division, Nuclear Institute for Agriculture and Biology, Faisalabad, Pakistan
2Centre for Agriculture and Bioscience International (CABI), Regional Bioscience Centre, Rawalpindi, Pakistan
3Government College University, Faisalabad, Pakistan

Tóm tắt

Tóm tắt

Sâu quân đội mùa thu (FAW), một loài côn trùng xâm lấn đối với cây ngô, đang trở thành một mối đe dọa mới ở Nam Á sau khi đã xuất hiện tại Mỹ và châu Âu. Gần đây, loại côn trùng nổi tiếng này cũng đã được phát hiện tại nhiều khu vực khác nhau của Pakistan. Để đánh giá sự hiện diện của nó tại Pakistan, một cuộc khảo sát đã được thực hiện ở các tỉnh Punjab, Sindh và Khyber Pakhtunkhwa trong thời gian từ tháng 5 đến tháng 10 năm 2019. Chúng tôi quan sát thấy tỉ lệ xuất hiện FAW cao nhất ở Sindh, với tác động tối đa tại các quận Tando-Allahyar và Hyderabad. Những mẫu này đã được xác định là Spodoptera frugiperda dựa trên các tiêu chí hình thái học và phân loại học. Tuy nhiên, việc xác định hình thái của loại côn trùng này rất khó khăn ở các giai đoạn ấu trùng đầu tiên. Tại đây, chúng tôi sử dụng vùng gene cytochrome c oxidase I (COI) ty thể để xác định chính xác ấu trùng của loại côn trùng xâm lấn này ở cấp độ loài. Hai vùng gene COI khác nhau (COI-5′ và COI-3′) đã được sử dụng làm dấu hiệu phân tử để xác định loài này. Các tìm kiếm độ tương đồng chuỗi DNA của các chuỗi gene COI thu được (Số vào NCBI GenBank: MW241537, MW241538, MW349515, MW349516, MW349493 và MW349494) cho thấy rằng về mặt di truyền, chúng có độ tương đồng hơn 99% với S. frugiperda. Phân tích phân loại cho thấy đây là chủng R (R-strain). Cả hai cấu trúc cây 3′- và 5′-fragment đều cho thấy rằng các mẫu thu thập của loài FAW thuộc về chủng R. Theo hiểu biết của chúng tôi, đây là báo cáo đầu tiên cung cấp bằng chứng phân tử về sự tồn tại của chủng R của S. frugiperda được phát hiện ăn cây ngô ở Sindh, Pakistan, sử dụng các chuỗi gene COI làm dấu hiệu.

Từ khóa

#sâu quân đội mùa thu #Spodoptera frugiperda #gen cytochrome c oxidase I #côn trùng xâm lấn #xác định phân tử

Tài liệu tham khảo

Cano-Calle D, Arango-Isaza RE, Saldamando-Benjumea CI (2015) Molecular identification of spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) corn and rice strains in colombia by using a PCR-RFLP of the mitochondrial gene cytochrome oxydase I (COI) and a PCR of the Gene FR (For Rice). Ann Entomol Soc Am 108:172–180. https://doi.org/10.1093/aesa/sav001

Day R, Abrahams P, Bateman M, Beale T, Clottey V, Cock MJ, Gomez J (2017) Fall armyworm: impacts and implications for Africa. Outlooks Pest Manag 28:196–201

Díaz-Álvarez EA, Martínez-Zavaleta JP, López-Santiz EE, la Barrera E, Larsen J, del-Val E (2021) Climate change can trigger fall armyworm outbreaks: a developmental response experiment with two Mexican maize landraces. Int J Pest Manag. DOI: https://doi.org/10.1080/09670874.2020.1869347

Dumas P, Fabrice L, Claire L, Erwan S, Marion O, Le K, Sylvie G (2015) Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) host-plant variants: two host strains or two distinct species? Genetica 143:305–316. https://doi.org/10.1007/s10709-015-9829-2

FAO (2019 a) Briefing note on FAO actions on fall armyworm

FAO (2019 b) Fall armyworm (FAW); Q & A. http://www.fao.org/3/a-i7471e.pdf

FAO-CABI (2019) Community-based fall armyworm (Spodoptera frugiperda ) monitoring, early warning and management. training of trainers manual (First Edition). Food Agric. Organ. U. N. CAB Int

Folmer O, Black M, Hoeh W, Lutz R, Vrijenhoek R (1994) DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from diverse metazoan invertebrates. Mol Mar Biol Biotechnol 3:294–299 (PMID: 7881515)

Frohlich DR, Torres-Jerez I, Bedford ID, Markham PG, Brown JK (1999) A phylogeographical analysis of Bemisia tabaci species complex based on mitochondrial DNA markers. Mol Ecol 8:1683–1691

Ganiger PC, Yeshwanth HM, Muralimohan K, Vinay N, Kumar ARV, Chandrashekara K (2018) Occurrence of the new invasive pest, fall armyworm, Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae), in the maize fields of Karnataka. India Curr Sci 115:621–623

Gilal AA, Bashir L, Faheem M, Rajput A, Soomro JA, Kunbhar S, Mirwani AS, MastoiSahito GSJGM (2020) First record of invasive fall armyworm Spodoptera frugiperda Smith (Lepidoptera: Noctuidae) in corn fields of Sindh, Pakistan. Pakistan J Agri Res 33:247–252

Gilligan TM, Passoa SC (2014) LepIntercept, an identification resource for intercepted Lepidoptera Larvae. Identification technology program (ITP), USDA-APHIS-PPQ-S&T, Fort Collins (US). www.lepintercept.org

Goergen G, Kumar PL, Sankung SB, Togola A, Tamo M (2016) First report of outbreaks of the fall armyworm Spodoptera frugiperda (JE Smith) (Lepidoptera, Noctuidae), a new alien invasive pest in west and central Africa. PLoS ONE 11(10):e0165632. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0165632

Hajibabaei M, Singer GAC, Clare EL, Hebert PDN (2007) Design and applicability of DNA arrays and DNA barcodes in biodiversity monitoring. BMC Biol 5:24

Jacobs A, van Vuuren A, Rong IH (2018) Characterisation of the fall armyworm (Spodoptera frugiperda JE Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) from South Africa. Afr Entomol 26:45–49. https://doi.org/10.4001/003.026.0045

Juárez ML, Schöfl G, Vera MT et al (2014) Population structure of Spodoptera frugiperda maize and rice host forms in South America: are they host strains? Entomol Exp Appl. https://doi.org/10.1111/eea.12215

Kalleshwaraswamy CM, Asokan R, Mahadevaswamy HMM (2019) First record of invasive fall armyworm, Spodoptera frugiperda (JE Smith)(Lepidoptera: Noctuidae) on rice (Oryza sativa) from India. J Entomol Zool Stud 7:332–337

Khan HA, Ali N, Farooq MU, Asif N, Gill TA, Khalique U (2020) First authentic report of fall armyworm presence in Faisalabad Pakistan. J Entomol Zool Stud 8:1512–1514

Kress WJ, Erickson DL (2008) DNA barcodes: genes, genomics, and bioinformatics. PNAS 105:2761–2762

Madden MJL, Young RG, Brown JW, Miller SE, Frewin AJ, Hanner RH (2019) Using DNA barcoding to improve invasive pest identification at US ports–of–entry. PLoS ONE 14(9):e0222291. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0222291

Maruthadurai R, Ramesh R (2020) Occurrence, damage pattern and biology of fall armyworm, Spodoptera frugiperda (JE smith) (Lepidoptera: Noctuidae) on fodder crops and green amaranth in Goa, India. Phytoparasitica 48:15–23. https://doi.org/10.1007/s12600-019-00771-w

Naeem-Ullah U, Ansari MA, Iqbal N, Saeed S (2019) First authentic report of Spodoptera frugiperda (JE Smith) (Noctuidae: Lepidoptera) an alien invasive species from Pakistan. ASBE 6:1–3

Navik O, Shylesha AN, Patil J, Venkatesan T, Lalitha Y, Ashika TR (2021) Damage, distribution and natural enemies of invasive fall armyworm Spodoptera frugiperda (JE Smith) under rainfed maize in Karnataka India. Crop Prot 143:105536

Otim MH, Tay WT, Walsh TK, Kanyesigye D, Adumo S, Abongosi J (2018) Detection of sister-species in invasive populations of the fall armyworm Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) from Uganda. Plos One. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0194571

Pashley DP (1986) Host associated genetic differentiation in fall armyworm (Lepidoptera: Noctuidae): a sibling species complex? Ann Entomol Soc Am 79:898–904

Passoa S (1991) Color identification of economically important Spodoptera larvae in Honduras (Lepidoptera: Noctuidae). Insecta Mundi 5:185–196

Pereira F, Carneiro J, Amorim A (2008) Identification of species with DNA-based technology: current progress and challenges. Recent Pat DNA Gene Seq 2:187–200

Phillips JD, Gillis DJ, Hanner RH (2019) Incomplete estimates of genetic diversity within species: implications for DNA barcoding. Ecol Evol 9:2996–3010. https://doi.org/10.1002/ece3.4757 (PMID: 30891232)

Pogue MG (2002) A world revision of the genus Spodoptera Guenée (Lepidoptera: Noctuidae). Mem Am Entomol Soc 43:1–202

Prasanna BM, Huesing JE, Eddy R, Peschke VM (2018) Fall armyworm in Africa: a guide for integrated pest management. 1st ed. CIMMYT; Edo Mex, Mexico. https://reliefweb.int/sites/reliefweb.int/files/resources/FallArmyworm_IPM_Guide_forAfrica.pdf.

Richardson EB, Troczka BJ, Gutbrod O (2020) Diamide resistance: 10 years of lessons from lepidopteran pests. J Pest Sci 93:911–928. https://doi.org/10.1007/s10340-020-01220-y

Rosas-Garcia NM, Herrera-Mayorga V, Rivera G, Mireles-Martinez M, Sanchez FAP, Villegas-Mendoza JM (2016) Spodoptera frugiperda biotype identification from maize host plants in different regions of Mexico. Southwest Entomol 41:761–770. https://doi.org/10.3958/059.041.0318

Rwomushana I, Bateman M, Beale T, Beseh P, Cameron K, Chiluba M and Clottey V (2018) Fall armyworm status impacts and control options in Africa (Evidence Note Update October–2018). CABI. Pp 1–53

Sharanabasappa D, Kalleshwaraswamy CM, Asokan R, MahadevaSwamy HM, Maruthi MS, Pavithra HB, Hedge K, Navi S, Prabhu ST, Goergen G (2018) First report of the fall armyworm, Spodoptera frugiperda (J E Smith) (Lepidoptera: Noctuidae), an alien invasive pest on maize in India. Pest Manag Hort Ecosyst 24:23–29

Shylesha AN, Jalali SK, Gupta A, Varshney R, Venkatesan T, Shetty P, Ojha R, Ganiger PC, Navik O, Subaharan K, Bakthavatsalam N, Ballal CR (2018) Studies on new invasive pest Spodoptera frugiperda (J. E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) and its natural enemies. J Biol Control 32:145–151

Sisodiya DB, Raghunandan BL, Bhatt NA, Verma HS, Shewale CP, Timbadiya BG, Borad PK (2018) The fall armyworm, Spodoptera frugiperda (JE Smith) (Lepidoptera: Noctuidae); first report of new invasive pest in maize fields of Gujarat, India. J Entomol Zool 6:2089–2091

Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S (2011) MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol 28:2731–2739

Tang RWK, Yau C, Ng WC (2010) Identification of stomatopod larvae (Crustacea: Stomatopoda) from Hong Kong waters using DNA barcodes. Mol Ecol Res 10:439–448

Todd EL, Poole RW (1980) Keys and illustrations for the armyworm moths of the noctuid genus Spodoptera Guenée from the Western Hemisphere. Ann Entomol Soc Am 73:722–738

Watts C, Dopheide A, Holdaway R, Davis C, Wood J, Thornburrow D et al (2019) DNA metabarcoding as a tool for invertebrate community monitoring: a case study comparison with conventional techniques. Austral Entomol 8:e1000417. https://doi.org/10.1111/aen.12384

Wyckhuys K, O’Neil R (2006) Population dynamics of Spodoptera frugiperda Smith (Lepidoptera: Noctuidae) and associated arthropod natural enemies in Honduran subsistence maize. Crop Prot 25:1180