Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Phân loại số của vi khuẩn axit lactic tâm sinh lý từ thịt đóng gói sẵn và sản phẩm thịt
Tóm tắt
Chín mươi bốn dòng vi khuẩn axit lactic được phân lập từ thịt đóng gói sẵn và sản phẩm thịt được bảo quản lạnh, cùng với 59 dòng tham chiếu của Brochothrix, Lactobacillus, Leuconostoc, Pediococcus và Streptococcus, được phân loại hình thái học với 96 ký tự đơn vị. Dữ liệu được xem xét bằng cách sử dụng hệ số Simple Matching (SSM) hoặc hệ số Jaccard (SJ), và thuật toán nhóm đôi không trọng số với trung bình số học. Hai mươi ba nhóm với hai hoặc nhiều thành viên đã được xác định ở mức độ tương đồng 84% SSM, tương ứng với mức độ tương đồng SJ là 61%. Dựa trên SSM, hầu hết các dòng lấy mẫu thực địa được bao gồm trong chín nhóm, và với ba trường hợp không đáng kể, chúng không chứa dòng tham chiếu nào. Các nhóm thực địa được chỉ định là Carnobacterium piscicola (nhóm 1; 5% mẫu lấy từ thực địa), Carnobacterium divergens (nhóm 2; 9% mẫu lấy từ thực địa), Leuconostoc (nhóm 9; 18% mẫu lấy từ thực địa) và Lactobacillus (nhóm 4, 10, 11, 12, 13 và 14; tổng cộng 60% mẫu lấy từ thực địa). Các nhóm Lactobacillus có nhiều đặc điểm chung với nhóm II của Shaw & Harding (1984). Các đặc điểm hình thái của các nhóm chính được trình bày. Các phân loại dựa trên SSM và SJ cơ bản trùng khớp đối với các dòng thực địa; ngoại lệ là nhóm 4 hiện đã được chia thành hai phần. Mười bốn nhóm chủ yếu được tạo thành từ các dòng tham chiếu (SSM). Hầu hết trong số đó bao gồm nhiều chủng loại hơn một trên mức độ loài; các trường hợp ngoại lệ là Brochothrix thermosphacta (nhóm 3), Lactobacillus salivarius (nhóm 17) và Leuconostoc mesenteroides (nhóm 18). Một số sự sắp xếp lại đã được quan sát thấy giữa các nhóm của các dòng tham chiếu khi SJ, thay vì SSM, được sử dụng để nhóm lại.
Từ khóa
Tài liệu tham khảo
Benno, Y. & T. Mitsuoka (1983) Modification of the Minitek system for identification of lactobacilli. System. Appl. Microbiol. 4: 123–131
Blickstad, E. & G. Molin (1983a) Carbon dioxide as a controller of the spoilage flora of pork, with special reference to temperature and sodium chloride. J. Food Prot. 46: 756–766
Blickstad, E. & G. Molin (1983b) The microbial flora of smoked pork loin and frankfurter sausage stored in different gas atmospheres at 4°C. J. Appl. Bacteriol. 54: 45–56
Blickstad, E. & G. Molin (1984) Growth and end-product formation in fermenter cultures of Brochothrix thermosphacta ATCC 11509 and two psychrotrophic Lactobacillus spp. in different gaseous atmospheres. J. Appl. Bacteriol. 57: 213–220
Bridge, P.D. & P.H.A. Sneath (1983) Numerical taxonomy of Streptococcus. J. Gen. Microbiol. 129: 565–597
Cavett, J.J. (1963) A diagnostic key for identifying the lactic acid bacteria of vacuumed-packed bacon. J. Appl. Bacteriol. 26: 453–470
Champion, A.B., E.L. Barrett, N.J. Palleroni, K.L. Soderberg, R. Kunisawa, R. Contopoulou, A.C. Wilson & M. Doudoroff (1980) Evolution in Pseudomonas fluorescens. J. Gen Microbiol. 120: 485–511
Collins, M.D., J.A.E. Farrow, B.A. Phillips, S. Ferusu & D. Jones (1987) Classification of Lactobacillus divergens, Lactobacillus piscicola, and some catalase-negative, asporogenous, rod-shaped bacteria from poultry in new genus, Carnobacterium. Int. J. System. Bacteriol. 37: 310–316
Dams, E., E. Huysmans, A. Vandenberghe & R.De Wachter (1987). Structure of clostridial 5S ribosomal RNAs and bacterial evolution. System. Appl. Microbiol. 9: 54–61
Enfors, S.-O., G. Molin & A. Ternström (1979) Effect of packaging under carbon dioxide, nitrogen or air on the microbial flora of pork stored at 4°C. J. Appl. Bacteriol. 47: 197–208
Gardner, G.A. (1966) A selective medium for the enumeration of Microbacterium thermosphactum in meat and meat products. J. Appl. Bacteriol. 29: 455–460
Garvie, E.I. (1975) Some properties of gas-forming lactic acid bacteria and their significance in classification. In: J.G. Carr, C.V. Cutting & G.C. Whiting (Eds) Lactic Acid Bacteria in Beverages and Food (pp. 339–349), Academic Press, London
Garvie, E.I. (1986) Genus Leuconostoc van Tieghem 1878. In: P.H.A. Sneath, N. Mair, M.E. Sharpe & J.G. Holt (Eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol 2. Williams & Wilkins, Baltimore
Gibson, T. & Y. Abdel-Malek (1945) The formation of carbon dioxide by lactic acid bacteria and Bacillus licheniformis and a cultural method of detecting the process. J. Dairy Research 14: 35–44
Gregersen, T (1978) Rapid method for distinction of Gram-negative from Gram-positive bacteria. Eur. J. Appl. Microbiol. Biotechnol. 5: 123–127
Harrigan, W.F. & M.E. McCance (1976) Laboratory methods in food and dairy microbiology. Academic Press, London
Hastings, J.W. & W.H. Holzapfel (1987) Numerical taxonomy of lactobacilli surviving radurization of meat. Int. J. Fd. Microbiol. 4: 33–49
Hitchener, B.J., A.F. Egan & P.J. Rogers (1982) Characteristics of lactic acid bacteria isolated from vacuum-packaged beef. J. Appl. Bacteriol. 52: 31–37
Hiu, S.F., R.A. Holt, N. Sriranganathan, R.J. Seidler & J.L. Fryer (1984) Lactobacillus piscicola, a new species from salmonid fish. Int. J. Syst. Bacteriol. 34: 393–400
Holzapfel, W.H. & E.S. Gerber (1983) Lactobacillus divergens sp. nov., a new heterofermentative Lactobacillus species producing L(+)-lactate. System. Appl. Microbiol. 4: 522–534
Kandler, O. & N. Weiss (1986) Regular, nonsporing Gram-positive rods. pp. 1208–1234. In: P.H.A. Sneath, N. Mair, M.E. Sharpe & J.G. Holt (Eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol 2 (pp. 1208–1234). Williams & Wilkins, Baltimore
Kitchell, A.G. & B.G. Shaw (1975) Lactic acid bacteria in fresh and cured meat. In: J.G. Carr, C.V. Cutting & G.C. Whiting (Eds) Lactic Acid Bacteria in Beverages and Food (pp. 209–220). Academic Press, London
Lee, B.H. & R.E. Simard (1984) Three systems for biochemical characterization of lactobacilli associated with meat spoilage. J. Fd. Protect 47: 937–942
Liston, J., W. Wiebe, & R.R. Colwell (1963) Quantitative approach to the study of bacterial species. J. Bacteriol. 85: 1061–1070
Marshall, V.E. (1979) A note on screening hydrogen peroxide-producing lactic acid bacteria using a non-toxic chromogen. J. Appl. Bacteriol. 47: 327–328
Mol, J.H.H., J.E.A. Hietbrink, H.W.M. Mollen & J.Van Tinteren (1971) Observations on the microflora of vacuum-packed sliced cooked meat products. J. Appl. Bacteriol. 34: 377–397
Möller, V. (1955) Simplified test for some amino acid decarboxylases and the arginine dihydrolase system. Acta Path. Microbiol. Scand. 36: 158–172
Priest, F.G. & E.A. Barbour (1985) Numerical taxonomy of lactic acid bacteria and some related taxa. In: M. Goodfellow, D. Jones & F.G. Priest (Eds) Computer-Assisted Bacterial Systematics (pp. 137–163) Academic Press
Reuter, G. (1975) Classification problems, ecology and some biochemical properties of lactobacilli of meat products. In: J.G. Carr, C.V. Cutting & G.C. Whiting (Eds) Lactic Acid Bacteria in Beverages and Food (pp. 221–229) Academic Press, London
Romersburg, H.C. (1984) Cluster analysis for researchers. Lifetime learning publications, Belmont, California.
Sandstedt, K., J. Ursing & M. Walder (1983) Thermotolerant Campylobacter with no or weak catalase activity isolated from dogs. Curr. Microbiol. 8: 209–213
Shaw, B.G. & C.D. Harding (1984) A numerical taxonomic study of lactic acid bacteria from vacuumed-packed beef, pork, lamb and bacon. J. Appl. Bacteriol. 56: 25–40
Shaw, B.G. & C.D. Harding (1985) Atypical lactobacilli from vacuum-packaged meats: comparison by DNA hybridization, cell composition and biochemical tests with a description of Lactobacillus carnis sp. nov. System. Appl. Microbiol. 6: 291–297
Shay, B.J. & A.F. Egan (1981) Hydrogen sulphide production and spoilage of vacuum-packaged beef by a Lactobacillus. In: T.A. Roberts, G. Hobbs, J.H.B. Christian & N. Skovgaard (Eds) Psychrotrophic microorganisms in spoilage and pathogenicity (pp. 241–251). Academic Press, London
Sneath, P.H.A. (1978) Classification of microorganisms. In: J.R. Norris & M.H. Richmond (Eds) Essays in Microbiology (pp. 9/1–9/13). Wiley, London
Sneath, P.H.A., N.S. Mair, M.E. Sharpe & J.G. Holt (1986) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Volume 2. Williams & Wilkins, Baltimore
Sneath, P.H.A., M. Stevens & M.J. Sackin (1981) Numerical taxonomy of Pseudomonas based on published records of substrate utilization. Antonie van Leeuwenhoek J. Microbiol. Serol. 47: 423–448
Stackebrandt, E., V.J. Fowler & C.R. Woese (1983) A phylogenetic analysis of lactobacilli, Pediococcus pentosaceus and Leuconostoc mesenteroides. Syst. Appl. Microbiol. 4: 326–337
Whittenbury, R. (1964) Hydrogen peroxide formation and catalase activity in the lactic acid bacteria. J. Gen. Microbiol 35: 13–26