Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Kháng thuốc đa dạng và kiểu gen độc lực cao ở Escherichia coli gây bệnh đường tiết niệu do sự khuếch tán của nhóm dòng ST131 sản xuất CTX-M-15: một vấn đề mới nổi tại một bệnh viện ở Tunisia
Tóm tắt
Một bộ sưu tập gồm 201 chủng Escherichia coli được phân lập từ nước tiểu của bệnh nhân tại một bệnh viện ở Tunisia trong khoảng thời gian từ tháng 1 năm 2006 đến tháng 7 năm 2008 đã được nghiên cứu. Việc xác định vi sinh vật được tiến hành bằng các phương pháp truyền thống, và độ nhạy kháng sinh được thực hiện bằng phương pháp khuếch tán đĩa theo hướng dẫn của Viện Tiêu chuẩn và Xét nghiệm Lâm sàng. Việc phát hiện β-lactamase phổ rộng (ESBL) được thực hiện bằng kiểm tra tương tác đĩa đôi (DDST) và phân lập bằng PCR và giải trình tự. Các mẫu phân lập tạo ra ESBL đã được phân loại phân tử bằng DNA đa hình ngẫu nhiên (RAPD) và phát hiện ST131 bằng PCR. Bốn nhóm phát sinh (A, B1, B2 và D), 18 gen độc lực và nhóm CTX-M đã được xác định bằng PCR. Phân tích thống kê được thực hiện bằng kiểm tra Pearson χ2 và kiểm tra U Mann-Whitney. Các chủng được thu hồi chủ yếu từ các khoa tiết niệu (28%), sản khoa (19%) và nội khoa (16%). Tỷ lệ kháng thuốc kháng sinh là ampicilin (72,1%), axit nalidixic (41,8%), ciprofloxacin (38,8%), gentamicin (23,9%) và cefotaxime (17,4%). Ba mươi mốt trong số các mẫu phân lập kháng cefotaxime (n = 35) có DDST dương tính và mang gen bla CTX-M-15. Hai mươi trong số đó (64,5%) thuộc dòng ST131 và có cùng hồ sơ DNA RAPD. Các mẫu phân lập nhạy với ciprofloxacin và cotrimoxazole có sự liên quan đáng kể với nhóm phát sinh B2, trong khi các mẫu phân lập kháng lại những phân tử này liên quan đến các nhóm phát sinh B1 và D, tương ứng. Các gen độc lực xuất hiện thường xuyên hơn rõ rệt ở các chủng nhạy với ciprofloxacin và cotrimoxazole so với những chủng kháng lại các kháng sinh này. Tuy nhiên, các mẫu phân lập sản xuất CXT-M-15 có sự liên quan với nhiều gen độc lực. Các mẫu phân lập nhạy cảm đồng thời với ba tác nhân kháng khuẩn (ciprofloxacin, cefotaxime và cotrimoxazole) có sự liên quan đáng kể với nhóm B2 và chỉ số độc lực cao, trong khi các mẫu phân lập có kiểu kháng đặc biệt, đặc biệt là những mẫu có kháng ciprofloxacin chủ yếu thuộc nhóm phát sinh B1 và mang ít gen độc lực. Sự xuất hiện của E. coli độc lực và kháng đa loại thuốc là một phát triển đáng lo ngại xứng đáng được chú ý sát sao tại cơ sở của chúng tôi.
Từ khóa
#Escherichia coli #kháng thuốc đa dạng #độc lực cao #CTX-M-15 #phân lập vi sinh vật #phân loại phân tửTài liệu tham khảo
Bingen-Dubois M, Clerment O, Bonacorsi S, Terki M, Brahimi N, Loukil C, Barraud D, Bingen E (2002) Phylogenetic analysis and prevalence of urosepsis strains of Escherichia coli bearing pathogenicity island-like domains. Infect Immun 70:3216–3226
Branger C, Zamfir O, Geoffroy S, Laurans G, Arlet G, Thien HV, Gouriou S, Picard B, Denamur E (2005) Genetic background of Escherichia coli and extended-spectrum β-lactamase type. Emerg Infect Dis 11:54–61
Clermont O, Bonacorsi S, Bingen E (2000) Rapid and simple determination of the Escherichia coli phylogenetic group. Appl Environ Microbiol 66:4555–4558
Clermont O, Lavollay M, Vimont S, Deschamps C, Foresier C, Branger C, Denameur E, Arlet G (2008) The CTX-M-15-producing Escherichia coli diffusing clone belongs to a highly virulent B2 phylogenetic subgroup. J Antimicrob Chemother 61:1024–1028
Clermont O, Dhanji H, Upton M, Gibreel T, Fox A, Boyd D, Mulvey MR, Nordmann P, Ruppé E, Sarthou JL, Frank T, Vimont S, Arlet G, Branger C, Woodford N, Denamur E (2009) Rapid detection of the O25b-ST131 clone of Escherichia coli encompassing the CTX-M-15-producing strains. J Antimicrob Chemother 64:274–277
Clinical Laboratory and Standards Institute Guidelines (2008) Performance standards for antimicrobial susceptibility testing, 18th informational supplement, M100-S18. Clinical and Laboratory Standards Institute, Wayne
Drieux L, Brossier F, Sougakoff W, Jarlier V (2008) Phenotypic detection of extended-spectrum beta-lactamase production in Enterobacteriaceae review and bench guide. Clin Microbiol Infect 14:90–103
Johnson JR, Stell A (2000) Extended virulence genotypes of Escherichia coli strains from patients with urosepsis in relation to phylogeny and host compromise. J Infect Dis 181:261–272
Johnson JR, Kuskowski MA, Owens K, Gajewski A, Winokur PL (2003) Phylogenetic origin and virulence genotype in relation to resistance to fluoroquinolones and/or extended-spectrum cephalosporins and cephamycins among Escherichia coli isolates from animals and humans. J Infect Dis 188:759–768
Johnson JR, Kuskowski MA, O'Bryan TT, Colodner R, Raz R (2005) Virulence genotype and phylogenetic origin in relation to antibiotic resistance profile among Escherichia coli urine sample isolates from Israeli women with acute uncomplicated cystitis. Antimicrob Agents Chemother 49:26–31
Karisik E, Ellington MJ, Livermore DM, Woodford N (2007) Virulence factors in Escherichia coli with CTX-M-15 and other extended-spectrum β-lactamases in the UK. J Antimicrob Chemother 61:54–58
Lloyd AL, Rasko DA, Mobley HL (2007) Defining genomic islands and uropathogen-specific genes in uropathogenic Escherichia coli. J Bacteriol 189:3532–3546
Mahenthiralingam E, Campbell ME, Foster J, Lam JS, Speert DP (1996) Random amplified polymorphic DNA typing of Pseudomonas aeruginosa isolates recovered from patients with cystic fibrosis. J Clin Microbiol 34:1129–1135
Moreno E, Prats G, Sabaté M, Pérez T, Johnson JR, Andreu A (2006) Quinolone, fluoroquinolone and trimethoprim/sulfamethoxazole resistance in relation to virulence determinants and phylogenetic background among uropathogenic Escherichia coli. J Antimicrob Chemother 57:204–211
Pagani L, Dell'Amico E, Migliavacca R, D'Andrea MM, Giacobone E, Amicosante G, Romero E, Rossolini GM (2003) Multiple CTX-M-type extended-spectrum beta-lactamases in nosocomial isolates of Enterobacteriaceae from a hospital in northern Italy. J Clin Microbiol 41:4264–4269
Peiranoa G, Pitout JDD (2010) Molecular epidemiology of Escherichia coli producing CTX-M β-lactamases: the worldwide emergence of clone ST131 O25:H4. Int J Antimicrob Agents 35:316–321
Piatti G, Mannini A, Balistreri M, Schito AM (2008) Virulence factors in urinary Escherichia coli strains: phylogenetic background and quinolone and fluoroquinolone resistance. J Clin Microbiol 46:480–487
Ruiz J, Simon K, Horcajada J, Velasco M, Barranco M, Roig G, Moreno-Martínez A, Martínez J, Jiménez de Anta T, Mensa J, Vila J (2002) Differences in virulence factors among clinical isolates of Escherichia coli causing cystitis and pyelonephritis in women and prostatitis in men. J Clin Microbiol 40:4445–4449
Takahashi A, Kanamaru S, Kurazono H, Kunishima Y, Tsukamoto T, Ogawa O, Yamamoto S (2006) Escherichia coli isolates associated with uncomplicated and complicated cystitis and asymptomatic bacteriuria possess similar phylogenies, virulence genes, and O-serogroup profiles. J Clin Microbiol 44:4589–4592
Wiles TJ, Kulesus RR, Mulvey MA (2008) Origins and virulence mechanisms of uropathogenic Escherichia coli. Exp Mol Pathol 85:11–19