Bằng chứng phân tử về chủng ‘N’ của virus khoai tây Y gây bệnh đốm trên ớt chỉ thiên (Capsicum annuum) tại Ấn Độ

Vinodhini J.1, Rajendran L.1, Karthikeyan G.1
1Department of Plant Pathology, Centre for Plant Protection Studies, Tamil Nadu Agricultural University, Coimbatore, India

Tóm tắt

Sự liên quan giữa nhiễm virus khoai tây Y với bệnh đốm trên ớt chỉ thiên đã được phát hiện trong một cuộc khảo sát quy mô nhỏ được thực hiện tại các quận Coimbatore thuộc bang Tamil Nadu. Các mẫu thực vật có triệu chứng rõ ràng của bệnh đốm đã được thu thập và thực hiện RT-PCR với primer suy biến của Potyvirus (PNIb1F & PCPR1) đặc hiệu cho các gen Nib và protein bao. Phân tích phân tử cho thấy virus Potyvirus liên quan đến bệnh đốm trên ớt chỉ thiên là virus khoai tây Y (PVY). Hơn nữa, phân tích phylogenetic cho thấy PVY infecting ớt chỉ thiên là dòng hoại tử (N). Theo kiến thức của chúng tôi, đây là bằng chứng phân tử đầu tiên cho sự liên quan của chủng ‘N’ của virus khoai tây Y với bệnh đốm trên ớt chỉ thiên ở Ấn Độ.

Từ khóa

#virus khoai tây Y #bệnh đốm #ớt chỉ thiên #phân tử #Ấn Độ

Tài liệu tham khảo

Borah M, Kumar RG, Siddappa S (2019) Molecular detection and phylogenetic analysis of Cucumber Mosaic Virus infecting Bhut Jolokia (Capsicum chinense Jacq.) Of Assam. Int J Economic Plants 6:126–129 Glasa M, Hancinsky R, Soltys K, Predajna L, Tomasechova J, Hauptvogel P, Mrkvova M, Mihalik D, Candresse T (2021) Molecular characterization of Potato virus Y (PVY) using high-throughput sequencing: constraints on full genome reconstructions imposed by mixed infection involving recombinant PVY strains. Plants 10(4):753 Hsu YC, Yeh TJ, Chang YC (2005) A new combination of RT-PCR and reverse dot blot hybridization for rapid detection and identification of Potyviruses. J Virol Methods 128:54–60 Karasev AV, Gray SM (2013) Continuous and emerging challenges of Potato virus Y in potato. Annu Rev Phytopathol 51:571–586 Kaur S, Kang SS, Sharma A, Sharma S (2014) First report of Pepper mottle virus infecting chilli pepper in India. New Disease Reports 30(14):2044–0588 Kerlan C, Moury B (2008) Potato virus Y. Encyclopedia of Virology, 3rd edn. Elsevier, Amsterdam, The Netherlands, p 287e296 Laprom A, Nilthong S, Chukeatirote E (2019) Incidence of viruses infecting pepper in Thailand. Biomol concepts 10(1):184–193 Nagendran K, Priyanka R, Aravintharaj R, Balaji CG, Prashant S, Basavaraj B, Mohankumar S, Karthikeyan G (2018) Characterization of Cucumber mosaic virus infecting snake gourd and bottle gourd in India. Physiol Mol Plant Pathol 103:102–106 Nie X, Singh RP (2002) Probable geographical grouping of PVYN and PVYNTN based on sequence variation in P1 and 5′-UTR of PVY genome and methods for differentiating North American PVYNTN. J Virol Methods 103(2):145–156 Rajamanickam S, Nakkeeran S (2020) Molecular characterization of Cucumber mosaic virus infection in chilli (Capsicum annuum L.) and its phylogenetic analysis. Int J Chem Stud 8(4):2967–2970 Ravishankar GA, Suresh B, Giridhar P, Rao SR, Johnson TS (2003) Biotechnological studies on Capsicum for metabolite production and plant improvement. In Capsicum CRC Press 116–148 Talukdar J, Saikia AK, Borah P (2015) Survey and detection of the diseases of Bhut Jolokia (Capsicum chinense Jacq.) In Assam. J Crop Weed 11:186–192 Venkataiah P, Christopher T, Subhash K (2003) Thidiazuron induced high frequency adventitious shoot formation and plant regeneration in Capsicum annuum L. J Plant Biotechnol 5(4):245–250 Vinodhini J, Rajendran L, Abirami R, Karthikeyan G (2021) Co-existence of chlorosis inducing strain of Cucumber mosaic virus with tospoviruses on hot pepper (Capsicum annuum) in India. Sci Rep 11(1):1–9 Vinodhini J, Rajendran L, Raveendran M, Rajasree V, Karthikeyan G (2020) Characterization of Cucumber mosaic virus (CMV) subgroup IB infecting chilli in Tamil Nadu, India. 3 Biotech 10:1–10 Wani S, Saleem S, Nabi SU, Ali G, Paddar PA, Hamid A (2021) Distribution and molecular characterization of potato virus Y (PVY) strains infecting potato (Solanum tuberosum) crop in Kashmir (India). Virus Dis 32:784–788