Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Phát hiện phân tử các nấm sản xuất mycotoxin
Tóm tắt
Sự hư hỏng do nấm gây ra là một vấn đề nghiêm trọng đối với ngành công nghiệp thực phẩm vì nó làm cho các sản phẩm không thể chấp nhận để tiêu thụ. Nấm có thể lây nhiễm thực phẩm và thức ăn chăn nuôi ở nhiều giai đoạn khác nhau trước và sau khi thu hoạch, chế biến và xử lý. Khía cạnh quan trọng nhất của sự hư hỏng thực phẩm là sự hình thành mycotoxin, có thể gây ngộ độc thực phẩm. Mặc dù các đặc điểm hình thái và sinh lý truyền thống là những thông số cơ bản góp phần vào việc xác định các vi sinh vật trong thực phẩm và thức ăn chăn nuôi, nhưng các tiêu chí này có thể bị ảnh hưởng bởi các điều kiện môi trường. Để bổ sung cho những phương pháp cổ điển này, một số phương pháp dựa trên axit nucleic đã được phát triển trong vài năm qua. Những phương pháp này có ưu điểm hơn các phương pháp hình thái học rằng chúng có thể cung cấp một lượng nấm chính xác hơn so với bất kỳ phương pháp nào đã được mô tả, và chúng cũng hữu ích khi không có bào tử hoặc các cơ quan đặc trưng khác phát triển. Bài tổng quan này cố gắng đưa ra cái nhìn tổng quát về các phương pháp phân tử đã được phát triển để phát hiện trực tiếp các nấm sản xuất mycotoxin trong thực phẩm và thức ăn chăn nuôi khác nhau.
Từ khóa
#nấm #mycotoxin #thực phẩm #thức ăn chăn nuôi #phát hiện phân tử #vi sinh vậtTài liệu tham khảo
Bagnara, A., Mayer, Z. and Geisen, R. 2000. Quantification of Aspergillus flavus BFE96 by Syhr Green Q-PCR in black pepper. Mycotoxin Res. 16A:244–247.
Bluhm, B.H., Flaherty, J.E., Cousin, M.A. and Woloshuk, C.P. 2002. Multiplex polymerase chain reaction assay for the differential detection of trichothecene- and fumonisin-producing species of Fusarium in cornmeal. J. Food Prot. 65:1955–1961.
Boichenko, L.V., Boichenko, D.M., Vinokurova, N.G., Reshetilova, T.A. and Arinbasarov, M.U. 2001. Use of polymerase chain reaction for searching for producers of ergot alkaloids from among microscopic fungi. Mikrobiologiia 70:360–364.
Brown, D.W., McCormick, S.P., Alexander, N.J., Proctor, R.H. and Desjardins, A.E. 2001. A genetic and biochemical approach to study trichothecene diversity in Fusarium sporotrichioides and Fusarium graminearum Fungal Genet. Biol. 32:121–133.
Brown, M.P., Brown-Jenco, C.S. and Payne, G.A. 1999. Genetic and molecular analysis of aflatoxin biosynthesis. Fungal Genet. Biol. 26:81–98.
Chizhikov, V., Rasooly, A., Chumakov, K. and Levy, D.D. 2001. Microarray analysis of microbial virulence factors. Appl. Environ. Microbiol. 67:3258–3263.
Compton, J. 1991. Nucleic acid sequence based amplification. Nature 350:91–92.
Criseo, A.G., Bagnara, A. and Bisignano, G. 2001. Differentiation of aflatoxin-producing and non-producing strains ofAspergillus flavus group. Lett. Appl. Microbiol. 33:291–295.
Edwards, S.G., Pirgozliev, S.R., Hare, M.C. and Jenkinson, P. 2001. Quantification of trichothecene-producing Fusarium species in harvested grain by competitive PCR to determine efficacies of fungicides against Fusarium head blight of winter wheat. Appl. Environ. Microbiol. 67:1575–1580.
Geisen, R. 1998. PCR methods for the detection of mycotoxin-producing fungi. In: P.D. Bridge, D.K. Aroa, C.A. Reddy, and R.P. Elander, eds. Applications of PCR in mycology. Wallingford: CAB International, pp. 243–266.
Groppe, K. and Boiler, T. 1997. PCR assay based on a microsatellite-containing locus for detection and quantification of Epichlo. endophytes in grass tissue. Appl. Environ. Microbiol. 63:1543–1550.
Loftier, J., Hebart, H., Cox, P., Flues, N., Schumacher, U. and Einsele, H. 2001. Nucleic acid based amplification of Aspergillus RNA in blood samples. J. Clin. Microbiol. 39:1626–1629.
Löffler, J., Henke, N., Hebart, H., Schmidt, D., Hagmeyer, L., Schumacher, U. and Einsele, H. 2000. Quantification of fungal DNA by using fluorescence resonance energy transfer and the Light Cycler system J. Clin. Microbiol. 38:586–590.
Mayer, Z., Bagnara, A., Färber, P. and Geisen, R. 2003. Quantification of the copy number of hör-i, a gene of the aflatoxin biosynthetic pathway by real-time PCR, and its correlation to the cru of Aspergillus flavus in foods. Int. J. Food Microbiol. 82:143–151.
Nicholson, P., Lees, A.K., Maurin, N., Parry, D.W. and Rezanoor, H.N. 1996. Development of a PCR assay to identity and quantify Microdochium nivale var. nivale and Microdochium nivale var. majus in Wheat Phys. J. Mol. Plant Pathol. 48:257–271.
Nicholson, P., Simpson, D.R., Weston, G., Rezanoor, H.N., Lees, A.K., Parry, D.W. and Joyce, D. 1998. Detection and quantification of Fusarium culmorum and Fusarium graminearum in cereals using PCR assays. Phys. Mol. Plant Pathol. 53:17–37.
Niessen, L., Schnerr, H., Knoll, S. and Vogel, R.F. 2003. Modern methods for detection and quantification of trichothecene producers and DON levels in cereals and malt. 2000 National Fusarium Head Blight Forum Proceedings, pp. 201–209.
Niessen, M.L. and Vogel, R.F. 1998. Group specific PCR-detection of potential trichothecene-producing Fusarium species in pure cultures and cereal samples. Syst. Appl. Microbiol. 21:618–631.
O’Callaghan, J., Caddick, M.X. and Dobson, A.D. 2003. A polyketide synthase gene required for ochratoxin A biosynthesis in Aspergillus ochraceus. Microbiology 149. 3485–3491.
Paterson, R.R.M., Archer, S., Kozakiewicz, Z., Lea, A., Locke, T. and O’Grady, E. 2000. A gene probe for the patulin metabolic pathway with potential for use in patulin and novel disease control. Biocontrol Sci. Technol. 10:509–512.
Proctor, R.H., Brown, D.W., Plattner, R.D. and Desjardins, A.E. 2003. Co-expression of 15 contiguous genes delineates a fumonisin biosynthetic gene cluster in Gibberella moniliformis. Fungal Genet. Biol. 38:237–249.
Schmidt, H., Bannier, M., Vogel, R.F. and Niessen, L. 2004. Detection and quantification of Aspergillus ochraceus in green coffee by PCR. Lett. Appl. Microbiol, (in press)
Schmidt, H., Vogel, R.F., Taniwaki, M.H. and Niessen, L. 2003. Molecular typing of Aspergillus ochraceus and construction of species specific SCAR-primers based on AFLP. Syst. Appl. Microbiol. 26:138–146.
Schnerr, H., Niessen, L. and Vogel, R.F. 2001. Real-time detection of the gene in species by Light Cycler-PCR using Sybr Green I for continuous fluorescence monitoring. Int. J. Food Microbiol. 71:53–61.
Southern, E.M. 1975. Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophoresis. J. Mol. Biol. 98:503–517.
Stender, H., Fiancada, M., Hyldig-Nielsen, J.J. and Coull, J. 2002. PNA for rapid microbiology. J. Microbiol. Meth. 48:1–17.
Tudzynski, P., Holter, K., Correia, T., Arntz, C., Grammel, N. and Keller, U. 1999. Evidence for an ergot alkaloid gene cluster in Claviceps purpurea. Mol. Gen. Genet. 261:133–141.
Varga, J. 2003. Molecular detection of fungi in foods and feeds. In: Arora, D.K., Ed., Fungal Biotechnology in Agricultural, Food, and Environmental Applications. New York: Marcel Dekker Inc., pp. 299–309.
Varga, J., Rigö, K., Molnár, J., Szencz, S., Töth, B., Téren, J. and Kozakiewicz, Z. 2003. Mycotoxin production and evolutionary relationships among species of Aspergillus section Clavati. Antonie van Leeuwenhoek 83:191–200.
Vesonder, R.F. and Golinski, P. 1989. Metabolites of Fusarium. In: Chelkowski, J. Ed., Fusarium. Mycotoxins, taxonomy and pathogenicity. Elsevier, Amsterdam, pp. 1–39.
Walker, N.J. 2001. Real-time and quantitative PCR: applications to mechanism-based toxicology. J. Biochem. Mol. Toxicol. 15:121–127.
Wang, X. and Liu, X. 2003. Study on the polymerase chain reaction methods for the detection of fumonisin-producing strains of Fusarium moniliforme. Wei Sheng Yan Jiu 32:228–232 [in Chinese].
Williams, J.G., Kubelik, A.R., Livak, K.J., Rafalski, J.A. and Tingey, S.V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res. 18:6531–6535.