Đặc điểm phân tử của virus viêm gan C ở bệnh nhân bệnh gan tại Botswana: một nghiên cứu cắt ngang hồi cứu

BMC Infectious Diseases - Tập 19 - Trang 1-6 - 2019
Lynnette Bhebhe1,2, Motswedi Anderson1, Sajini Souda3, Wonderful T. Choga1,2, Edward Zumbika2, Zachary M. Shaver1, Tshepiso Mbangiwa1,4, Bonolo B. Phinius1, Chabeni C. Banda1, Pinkie Melamu1, Rosemary M. Musonda1,5, Max Essex1,5, Jason T. Blackard6, Sikhulile Moyo1,5, Simani Gaseitsiwe1,5
1Botswana Harvard AIDS Institute Partnership, Research Laboratory, Gaborone, Botswana
2Department of Applied Biology and Biochemistry, National University of Science and Technology, Bulawayo, Zimbabwe
3Department of Pathology, Faculty of Medicine, University of Botswana, Gaborone, Botswana
4Department of Medical Laboratory Sciences, Faculty of Health Sciences, University of Botswana, Gaborone, Botswana
5Department of Immunology and Infectious Diseases, Harvard T.H. Chan School of Public Health, Boston, USA
6University of Cincinnati College of Medicine, Cincinnati, USA

Tóm tắt

Nhiễm virus viêm gan C (HCV) là nguyên nhân chính gây bệnh gan mãn tính trên toàn cầu. Các thuốc kháng virus trực tiếp (DAAs) đã chứng minh hiệu quả trong việc điều trị khỏi HCV. Tuy nhiên, tiêu chuẩn điều trị hiện tại (SOC) tại Botswana vẫn là interferon-α PEGylated (IFN-α) với ribavirin. Một số đột biến đã được báo cáo gây ra kháng thuốc điều trị dựa trên interferon. Do đó, cần xác định các kiểu gen HCV ở Botswana, vì những dữ liệu này sẽ hướng dẫn các hướng dẫn điều trị mới và hiểu biết về dịch tễ học HCV ở Botswana. Đây là một nghiên cứu cắt ngang hồi cứu, sử dụng huyết tương thu được từ 55 người tham gia tại Bệnh viện Princess Marina ở Gaborone, Botswana. Vùng lõi một phần của HCV đã được khuếch đại và các kiểu gen được xác định bằng phân tích Phylogenetic. Bốn chuỗi kiểu gen 5a và hai chuỗi kiểu gen 4v đã được xác định. Hai đột biến đáng kể - K10Q và R70Q - được quan sát trong các chuỗi kiểu gen 5a và đã liên quan đến nguy cơ gia tăng của carcinoma tế bào gan (HCC), trong khi R70Q gây ra kháng thuốc điều trị dựa trên interferon. Các kiểu gen 5a và 4v đang lưu hành ở Botswana. Sự hiện diện của các đột biến trong kiểu gen 5 cho thấy rằng một số bệnh nhân có thể không đáp ứng với các phác đồ điều trị dựa trên IFN. Thông tin thu được trong nghiên cứu này, bên cạnh các khuyến nghị của Tổ chức Y tế Thế giới (WHO), có thể được các nhà hoạch định chính sách sử dụng để triển khai DAAs như SOC mới cho điều trị HCV tại Botswana.

Từ khóa

#virus viêm gan C #HCV #thuốc kháng virus trực tiếp #interferon #ribavirin #đột biến #kiểu gen #carcinoma tế bào gan

Tài liệu tham khảo

Stanaway JD, Flaxman AD, Naghavi M, Fitzmaurice C, Vos T, Abubakar I, et al. The global burden of viral hepatitis from 1990 to 2013: findings from the global burden of disease study 2013. Lancet. 2016;388(10049):1081–8. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(16)30579-7. El-Zanaty F, Way A. Egypt demographic and health survey, 2008. In: Demographic and health survey (EDHS). Cairo: Ministry of Health and Population; 2009. Razavi H, Waked I, Sarrazin C, Myers RP, Idilman R, Calinas F, et al. The present and future disease burden of hepatitis C virus (HCV) infection with today’s treatment paradigm. J Viral Hepat. 2014;21:34–59. Agyeman AA, Ofori-Asenso R, Mprah A, Ashiagbor G. Epidemiology of hepatitis C virus in Ghana: a systematic review and meta-analysis. BMC Infect Dis. 2016;16(1):391. Gower E, Estes C, Blach S, Razavi-Shearer K, Razavi H. Global epidemiology and genotype distribution of the hepatitis C virus infection. J Hepatol. 2014;61(1):S45–57. https://doi.org/10.1016/j.jhep.2014.07.027. Wester CW, Bussmann H, Moyo S, Avalos A, Gaolathe T, Ndwapi N, et al. Serological evidence of HIV-associated infection among HIV-1-infected adults in Botswana. Clin Infect Dis. 2006;43(12):1612–5. Patel P, Davis S, Tolle M, Mabikwa V, Anabwani G. Prevalence of hepatitis B and hepatitis C coinfections in an adult HIV centre population in Gaborone, Botswana. Am J Trop Med Hyg. 2011;85(2):390–4. https://doi.org/10.4269/ajtmh.2011.10-0510. Choga WT, Anderson M, Zumbika E, Moyo S, Mbangiwa T, Phinius BB, Melamu P, Kayembe MK, Kasvosve I, Sebunya TK, Blackard JT, Essex M, Musonda RM, Gaseitsiwe S. Molecular characterization of hepatitis B virus in blood donors in Botswana. Virus Genes. 2018. https://doi.org/10.1007/s11262-018-1610-z. Van der Meer AJ. Value anti-hepatitis C virus therapy by its clinical efficacy. Hepatology. 2015;62:334–6. WHO. Global hepatitis report. 2017. Available online: https://www.who.int/hepatitis/publications/global-hepatitis-report2017/en/. Accessed 8 Oct 2018. Lole KS, Jha JA, Shrotri SP, Tandon BN, Prasad VGM, Arankalle VA. Comparison of hepatitis C virus genotyping by 5 Ј noncoding region- and core-based reverse transcriptase PCR assay with sequencing and use of the assay for determining subtype distribution in India. J Clin Microbiol. 2003;41(11):5240–4. Cai Q, Zhao Z, Liu Y, Shao X, Gao Z. Comparison of three different HCV genotyping methods: Core, NS5B sequence analysis and line probe assay. Int J Mol Med. 2013;31:347–52. https://doi.org/10.3892/ijmm.2012.1209. Kuiken C, Combet C, Bukh J, Shin-I T, Deleage G, Mizokami M, et al. A comprehensive system for consistent numbering of HCV sequences, proteins and epitopes. Hepatology. 2006;44(5):1355–61. https://doi.org/10.1002/hep.21377. Drummond AJ, Suchard MA, Xie D, Rambaut A. Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7. Mol Biol Evol. 2012;29:1969–73. R Core Team (2019). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. https://www.R-project.org/. Zhang J, Yamada O, Ito T, Akiyama M, Hashimoto Y, Yoshida H, et al. A single nucleotide insertion in the 5′-untranslated region of hepatitis C virus leads to enhanced cap-independent translation. Virology. 1999;261(2):263–70. https://doi.org/10.1006/viro.1999.9879. Sugiyama K, Suzuki K, Nakazawa T, Funami K, Hishiki T, Ogawa K, et al. Genetic analysis of hepatitis C virus with defective genome and its infectivity in vitro. J Virol. 2009;83(13):6922–8. https://doi.org/10.1128/JVI.02674-08. Hu Z, Muroyama R, Kowatari N, Chang J, Omata M, Kato N. Characteristic mutations in hepatitis C virus core gene related to the occurrence of hepatocellular carcinoma. Cancer Sci. 2009;100(12):2465–8. Kuntzen T, Timm J, Berical A, Lennon N, Berlin AM, Young SK, et al. Naturally occurring dominant resistance mutations to hepatitis C virus protease and polymerase inhibitors in treatment-naïve patients. Hepatology. 2008;48(6):1769–78. https://doi.org/10.1002/hep.22549. Bull RA, Eltahla AA, Rodrigo C, Koekkoek SM, Walker M, Pirozyan MR, Luciani F. A method for near full-length amplification and sequencing for six hepatitis C virus genotypes. BMC Genomics. 2016;17(1):247. Sakamoto M, Akahane Y, Tsuda F, Tanaka T, Woodfield DG, Okamoto H. Entire nucleotide sequence and characterization of a hepatitis C virus of genotype V/3a. J Gen Virol. 1994;75(7):1761–8. Akuta N, Suzuki F, Hirakawa M, Kawamura Y, Yatsuji H, Sezaki H, Suzuki Y, Hosaka T, Kobayashi M, Kobayashi M, Saitoh S, Arase Y, Ikeda K, Chayama K, Nakamura Y, Kumada H. Amino acid substitution in hepatitis C virus core region and genetic variation near the interleukin 28B gene predict viral response to telaprevir with peginterferon and ribavirin. Hepatology. 2010;52:421–9. Nakamoto S, Imazeki F, Fukai K, Fujiwara K, Arai M, Kanda T, Yonemitsu Y, Yokosuka O, Nakamoto S, Imazeki F, Fukai K, Fujiwara K, Arai M, Kanda T, Yonemitsu Y, Yokosuka O. Association between mutations in the core region of hepatitis C virus genotype 1 and hepatocellular carcinoma development. J Hepatol. 2010;52(1):72–8 Erratum in: J Hepatol, 52(4):620. Fishman SL, Factor SH, Balestrieri C, Fan X, Dibisceglie AM, Desai SM, Benson G, Branch AD. Mutations in the hepatitis C virus core gene are associated with advanced liver disease and hepatocellular carcinoma. Clin Cancer Res. 2009;15(9):3205–13. El-Shamy A, Eng FJ, Doyle EH, Klepper AL, Sun X, Sangiovanni A, Iavarone M, Colombo M, Schwartz RE, Hoshinda Y, Branch AD. A cell culture system for distinguishing hepatitis C viruses with or without liver cancer-related mutations in the viral core gene. J Hepatol. 2015. https://doi.org/10.1016/j.jhep.2015.07.024. Petruzziello A, Marigliano S, Loquercio G, Cozzolino A, Cacciapuoti C. Global epidemiology of hepatitis C virus infection: an up-date of the distribution and circulation of hepatitis C virus genotypes. World J Gastroenterol. 2016;22(34):7824–40. https://doi.org/10.3748/wjg.v22.i34.7824. Gededzha MP, Selabe SG, Blackard JT, Kyaw T, Mphahlele MJ. Near full-length genome analysis of HCV genotype 5 strains from South Africa. Infect Genet Evol. 2014;21(November):118–23. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2013.10.022. Gededzha MP, Selabe SG, Kyaw T, Rakgole JN, Blackard JT, Mphahlele MJ. Introduction of new subtypes and variants of hepatitis C virus genotype 4 in South Africa. J Med Virol. 2012;84:601–7. https://doi.org/10.1002/jmv.23215. Gededzha MP, Selabe SG, Kyaw T, Rakgole JN, Blackard JT, Mphahlele MJ. Introduction of new subtypes and variants of hepatitis C virus genotype 4 in South Africa. J Med Virol. 2012;84(4):601–7. Iles JC, Raghwani J, Harrison GL, Pepin J, Djoko CF, Tamoufe D, LeBreton M, Schneider BS, Fair JN, Tshala FM, Kayembe PK, Muyembe JJ, Edidi-Basepeo S, Wolfe ND, Simmonds P, Klenerman P, Pybus OG. Phylogeography and epidemic history of hepatitis C virus genotype 4 in Africa. Virology. 2014;464-465:233–43. Hundie GB, Raj VS, GebreMichael D, Pas SD, Haagmans BL. Genetic diversity of hepatitis C virus in Ethiopia. PLoS One. 2017;12(6):0179064. Quer J, Gregori J, Rodríguez-Frias F, Buti M, Madejon A, Perez-del-Pulgar S, Garcia-Cehic D, Casillas R, Blasi M, Homs M, Tabernero D, Alvarez-Tejado M, Muñoz JM, Cubero M, Caballero A, delCampo JA, Domingo E, Belmonte I, Nieto L, Lens S, Muñoz-de-Rueda P, Sanz-Cameno P, Sauleda S, Bes M, Gomez J, Briones C, Perales C, Sheldon J, Castells L, Viladomiu L, Salmeron J, Ruiz-Extremera A, Quiles-Pérez R, Moreno-Otero R, López-Rodríguez R, Allende H, Romero-Gómez M, Guardia J, Esteban R, Garcia-Samaniego J, Forns X, Esteban JI. High- resolution hepatitis C virus subtyping using NS5B deep sequencing and phylogeny, an alternative to current methods. J Clin Microbiol. 2015;53:219–26. https://doi.org/10.1128/JCM.02093-14. Prabdial-Sing N, Blackard JT, Puren AJ, Mahomed A, Abuelhassan W, Mahlangu J, Vermeulen M, Bowyer SM. Naturally occurring resistance mutations within the core and NS5B regions in hepatitis C genotypes, particularly genotype 5a, in South Africa. Antivir Res. 2016;127:90–8.
Thông tin
Thông tin xuất bản

BMC Infectious Diseases

Tập 19

1-6

Thông tin tác giả