Phân tích phân tử tiết lộ sự đa dạng ẩn giấu trong Zungaro (Siluriformes: Pimelodidade): một chi cá nheo khổng lồ của Nam Mỹ

Springer Science and Business Media LLC - Tập 145 - Trang 335-340 - 2017
Antonio A. Pires1, Jorge L. Ramirez1, Pedro M. Galetti1, Waldo P. Troy2, Patricia D. Freitas1
1Laboratório de Biodiversidade Molecular e Conservação, Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, Brazil
2Departamento de Ciências Biológicas, Universidade do Estado do Mato Grosso, Tangará da Serra, Brazil

Tóm tắt

Chi Zungaro chứa một số loài cá nheo lớn nhất ở Nam Mỹ. Hiện tại, có hai loài hợp lệ được công nhận: Zungaro jahu, sống ở lưu vực Paraná và Paraguay, và Zungaro zungaro, xuất hiện ở lưu vực Amazonas và Orinoco. Phân tích các mẫu vật Zungaro từ các lưu vực Amazonas, Orinoco, Paraguay và Paraná, dựa trên trình tự COI và D-loop, chúng tôi đã phát hiện ít nhất ba MOTUs, cho thấy sự tồn tại của sự đa dạng ẩn giấu trong nhóm cá này. Xem xét giá trị sinh thái và kinh tế của loài cá này, kết quả của chúng tôi chắc chắn sẽ được hoan nghênh cho công tác bảo tồn, tiết lộ những phát hiện mới về sự đa dạng của nó và chỉ ra sự cần thiết của một cuộc xem xét phân loại chi tiết.

Từ khóa

#Zungaro #cá nheo #sự đa dạng ẩn giấu #phân tích phân tử #bảo tồn

Tài liệu tham khảo

Agostinho AA, Gomes LC, Suzuki HI, Julio Júnior HF (2003) Migratory fishes of the upper paraná river basin, Brazil. In: Carosfeld J, Harvey B, Ross CV, Baer A (eds) Migratory fishes of south america: biology, fisheries and conservation status. The World Bank, International Development Centre, Ottowa, pp 19–98 Albert JS, Reis RE (2011) Historical biogeography of neotropical freshwater fishes. University of California Press, Los Angeles Avise JC (2004) Molecular markers, natural history and evolution, 2nd edn. Sinauer, Sunderland Boni TA, Padial AA, Prioli SMAP et al (2011) Molecular differentiation of species of the genus Zungaro (Siluriformes, Pimelodidae) from the Amazon and Paraná-Paraguay River basins in Brazil. Genet Mol Res 10:2795–2805. doi:10.4238/2011.November.10.2 Britski HA, Lima FCT (2008) A new species of Hemigrammus from the Upper Rio Tapajós basin in Brazil (Teleostei: Characiformes: Characidae). Copeia 2008:565–569. doi:10.1643/CI-07-134 Da Graça WJ, Pavanelli CS (2007) Peixes da Planície de Inundação do Alto Rio Paraná e Áreas Adjacentes. EDUEM, Maringá Darriba D, Taboada GL, Doallo R, Posada D (2012) jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing. Nat Methods 9:772. doi:10.1038/nmeth.2109 Ferraris CJ Jr (2007) Checklist of catfishes, recent and fossil (Osteichthyes: Siluriformes), and catalogue of siluriform primary types. Zootaxa 1418:1–628 Heled J, Drummond AJ (2010) Bayesian inference of species trees from multilocus data. Mol Biol Evol 27:570–580. doi:10.1093/molbev/msp274 Hessen DO, Kaartvedt S (2014) Top-down cascades in lakes and oceans: Different perspectives but same story? J Plankton Res 36:914–924. doi:10.1093/plankt/fbu040 Hrbek T, da Silva VMF, Dutra N et al (2014) A new species of river dolphin from Brazil or: how little do we know our biodiversity. PLoS One 9:e83623. doi:10.1371/journal.pone.0083623 Hubert N, Hanner R, Holm E et al (2008) Identifying Canadian freshwater fishes through DNA barcodes. PLoS One. doi:10.1371/journal.pone.0002490 Kearse M, Moir R, Wilson A et al (2012) Geneious Basic: An integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data. Bioinformatics 28:1647–1649. doi:10.1093/bioinformatics/bts199 Larkin MA, Blackshields G, Brown NP et al (2007) Clustal W and Clustal X version 2.0. Bioinformatics 23:2947–2948. doi:10.1093/bioinformatics/btm404 Lundberg JG, Littmann MW (2003) Family Pimelodidae (Long-Whiskered Catfishes). In: Reis RE, Kullander SO, Ferraris CJ Jr (eds) Check list of the freshwater fishes of South and Central America. EDIPUCRS, Porto Alegre, pp 432–446 Pereira LHG, Hanner R, Foresti F, Oliveira C (2013) Can DNA barcoding accurately discriminate megadiverse Neotropical freshwater fish fauna? BMC Genet 14:20. doi:10.1186/1471-2156-14-20 Ramirez JL, Galetti PM Jr (2015) DNA barcode and evolutionary relationship within Laemolyta Cope 1872 (Characiformes: Anostomidae) through molecular analyses. Mol Phylogenet Evol 93:77–82. doi:10.1016/j.ympev.2015.07.021 Reis RE, Albert JS, Di Dario F et al (2016) Fish biodiversity and conservation in South America. J Fish Biol. doi:10.1111/jfb.13016 Sambrook J, Fritish EF, Maniatis T (1989) Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor Shibatta OA, Dias JHP (2006) 40 peixes do Brazil: CESP 40 anos. Doiis, Rio de Janeiro Tamura K, Stecher G, Peterson D et al (2013) MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol 30:2725–2729. doi:10.1093/molbev/mst197