Đặc điểm phân tử của virus sốt lợn cổ điển liên quan đến vụ bùng phát ở Mizoram

Indian Journal of Virology - Tập 21 - Trang 76-81 - 2010
N. N. Barman1, R. S. Gupt1, D. P. Bora1, R. S. Kataria2, A. K. Tiwari3, P. Roychoudhury4
1Department of Microbiology, College of Veterinary Science, Assam Agricultural University, Guwahati, India
2National Bureau of Animal Genetic Resources, Karnal, India
3National Biotechnology Centre, Indian Veterinary Research Institute, Izatnagar, India
4Department of Microbiology, Central Agricultural University, Selesih, India

Tóm tắt

Sốt lợn cổ điển là căn bệnh tàn phá và âm thầm nhất ở lợn và lợn rừng. Virus này có quan hệ mật thiết với các thành viên khác của chi Pestivirus. Vụ bùng phát ghi nhận tại Mizoram, Ấn Độ có tầm quan trọng chiến lược vì bang này có biên giới quốc tế lỏng lẻo với các nước Đông Á. Cả hai kỹ thuật chẩn đoán miễn dịch và phân tử đã được sử dụng để xác định sự tham gia của virus sốt lợn cổ điển (CSFV) trong vụ bùng phát này. Sandwich ELISA và FAT trực tiếp có thể phát hiện CSFV trong các mẫu mô. RT-nPCR đã khuếch đại đặc hiệu sản phẩm E2 và 5'NTR có độ dài 271 bp. Phân tích filogen cho thấy, chủng phân lập tại Mizoram (MZ4/69) rất gần gũi với chủng Trung Quốc Shimen-HVRI (93.0%) hơn là với chủng phân lập Ấn Độ khác (CSF-30-03). Nghiên cứu hiện tại cung cấp dữ liệu phân tử dựa trên chuỗi có giá trị về chủng phân lập Ấn Độ của CSFV và sẽ hữu ích trong việc điều tra về sự truyền bệnh như vậy từ các nước láng giềng.

Từ khóa

#Sốt lợn cổ điển #Virus CSFV #Mizoram #Phân lập #Phân tích filogen

Tài liệu tham khảo

Anonymous. European Union diagnostic manual on swine fever. Hanover: Germany; 2002. Anonymous. Annual report. Animal Husbandry and Veterinary Department, Govt of Mizoram: Mizoram; 2003–2005. Barkha R, Tiwari AK, Barman NN, Chaturvedi U, Ravindra PV, Desai G, Subudhi PK, Tiwari S, Kumar S. Detection of classical swine fever virus in various types of clinical samples by RT-PCR. Indian J Virol. 2009;20(1):4–8. Barman NN, Nath AJ, Hazarika MP, Barman B, Thakuria D. Outbreak of classical swine fever in regularly vaccinated pig herd. Indian J Comp Microbiol Immunol Infect Dis. 2003;24(1):89–90. Depner KR, Hinrichu U, Bickhardt K, Greiser Wilkie I, Pohlenz J, Moennig LeissB. Evaluation of the enzyme-linked immunosorbent assay for the rapid screening and detection of classical swine fever virus antigens in the blood of pigs. Vet Rec. 1995;14:677–89. Dhar P, Rai A, Verma R. Adaptation of classical swine fever virus (lapinized strain) in PK-15 cells and confirmed by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and fluorescent antibody technique (FAT). Indian J Animal Sci. 2008;78(2):135–7. Edwards S, Moennig V, Wensvoort G. The development of international reference panel of monoclonal antibodies for the differentiation of hog cholera virus from other pestiviruses. Vet Microbiol. 1991;29:101–8. Edwards S, Fukusho A, Lefevre PC, Lipowski A, Pejsak Z, Roehe P, Westergaard J. Classical swine fever: the global situation. Vet Microbiol. 2000;73:103–19. Francki RIB, Faquet CM, Knudson DL, Brown F. Fifth report of the international committee on taxonomy of viruses. Arch Virol. 1991;2:223–33. Greiser-Wilke I, Depner K, Fritzemeier J, Haas L, Moennig V. Application of a computer program for genetic typing of classical swine fever virus isolates from Germany. J Virol Methods. 1998;75:141–50. Harkness JW. Classical swine fever and its diagnosis. A current view. Vet Rec. 1985;116:288–93. Jindal N, Sharma PC, Mittal D, Tiwari AK, Narang G, Shukla CL. Occurrence of swine fever in vaccinated piggery units in Haryana: detection by RT-PCR. Indian J Virol. 2008;19(1):44–6. Lowings P, Ibata G, Needham J, Paton D. Classical swine fever virus diversity and evolution. J Gen Virol. 1996;77(6):1311–21. Moennig V. Introduction to classical swine fever: virus, disease and control policy. Vet Microbiol. 2000;73:93–102. Paton DJ, McGoldrick A, Greiser-Wilke I, Parchariyanon S, Song JY, Liou PP, Stadejek T, Lowings JP, Bjorklund H, Belak S. Genetic typing of classical swine fever virus. Vet Microbiol. 2000;73:137–57. Sakoda Y, Ozawa S, Damrongwatanopokin S, Sato M, Ishikawa K, Fukusho A. Genetic heterogenicity of porcine and ruminant viruses mainly isolated in Japan. Vet Microbiol. 1999;65:75–86. Singh NK. Immuno and histopathological diagnosis of Hog Cholera in field outbreaks. MVSc Thesis, Assam Agricultural University, Guwahati, India; 2005. Singh VK, Saikumar G, Bandyopadhyay SK, Paliwal OP. Phylogenetic analysis of classical swine fever virus (CSFV) by cloning and sequencing of partial 5′ non translated genomic region. Indian J Animal Sci. 2004;74(11):1093–7. Verma ND. An outbreak of swine fever in Mizoram state. Indian J Animal Sci. 1988;58(7):774–6. Vilcek S, Herring AJ, Herring JA, Nettleton PF, Lowings JP, Paton DJ. Pestiviruses isolated from pigs, cattle and sheep can be allocated into at least three genogroups using PCR and restriction endonuclease analysis. Arch Virol. 1994;136:309–23.