Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Mô hình microflora đường ruột trong mô phỏng máy tính: một gói mô phỏng và mô hình hóa cho tương tác giữa vật chủ và microflora
Tóm tắt
Sinh thái học của vi sinh vật đường ruột ở người và sự tương tác của nó với vật chủ còn được hiểu biết hạn chế. Mặc dù ngày càng có nhiều dữ liệu được thu thập, một phần nhờ vào các phương pháp phân tử hiện đại, sự phát triển của lý thuyết định lượng chưa theo kịp với sự gia tăng về khả năng quan sát. Điều này một phần là do sự phức tạp của hệ thống và do thiếu môi trường mô phỏng để kiểm tra ảnh hưởng sinh thái của một cơ chế tương tác giả thuyết trước khi tiến hành các thí nghiệm trong phòng thí nghiệm. Dự án MIMICS cố gắng giải quyết vấn đề này thông qua việc phát triển một tự động hóa tế bào để mô phỏng vi sinh vật đường ruột. Trong bài báo này, thiết kế và đánh giá của mô phỏng này được thảo luận.
Từ khóa
#Computer simulation #Intestines #Computational modeling #Packaging #Biological system modeling #Immune system #Humans #Microorganisms #Pathogens #AntibioticsTài liệu tham khảo
10.1080/089106000750060305
10.1111/j.1365-2672.1961.tb00256.x
héchard, 1992, on-line visualization of the competitive behavior of antagonistic bacteria, Appl Environ Microbiol, 58, 3784, 10.1128/AEM.58.11.3784-3786.1992
10.1023/A:1006590431483
poulsen, 1994, spatial distribution of escherichia coli in the mouse large intestine inferred from rrna in situ hybridization, Infection Immunity, 62, 5191, 10.1128/IAI.62.11.5191-5194.1994
10.1007/3-540-46043-8_11
10.1001/jama.282.9.861
10.1097/00000658-199811000-00001
freter, 1983, survival and implantation of escherichia coli in the intestinal tract, Infection Immunity, 39, 686, 10.1128/IAI.39.2.686-703.1983
coleman, 1996, a simulation of microbial competition in the human colonic ecosystem, Appl Environm Microbiol, 62, 3632, 10.1128/AEM.62.10.3632-3639.1996
10.1006/jtbi.1995.0198
10.1080/089106000750060503
wilkinson, 1997, nonlinear dynamics, chaos-theory and the “sciences of complexity”: their relevance to the study of the interaction between host and microflora, Old Herborn University Seminar Monograph 10 New Antimicrobial Strategies, 111
10.1007/978-1-4615-4078-6_4
10.1007/BF01238189
gerritse, 1992, modeling of mixed chemostat cultures of an anaerobic bacterium comamonas testosteroni and an anaerobic bacterium veilonella alcalescencs: comparison with experimental data, Appl Environ Microbiol, 58, 1466, 10.1128/AEM.58.5.1466-1476.1992
adlerberth, 1999, establishment of a normal intestinal microflora in the newborn infant, Probiotics Other Nutritional Factors and Intestinal Microflora, 63
10.1038/383219a0
10.1007/BF00400776
10.1016/S0934-8840(96)80122-8
10.1016/S0924-8579(99)00111-9
10.1073/pnas.78.10.6324
domin, 1998, highly virulent pathogens-a post antibiotic era?, Br J Theatre Nursing, 8, 14, 10.1177/175045899800800201
10.2307/1591682
10.1093/occmed/50.6.392
10.1017/S0022172400021653
10.1097/00006123-199809000-00072
langendijk, 1995, quantitative fluorescence in situ hybridization of bifidobacterium spp. with genus-specific 16s rrna-targeted probe and its application in fecal samples, Appl Environ Microbiol, 61, 3069, 10.1128/AEM.61.8.3069-3075.1995
10.1007/BF01574688
10.1098/rspb.1997.0097
10.1146/annurev.genet.32.1.255
10.1016/0168-6496(95)00017-5
10.1007/BF00871225
10.1099/00222615-15-2-189
10.1084/jem.122.1.77