Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
DNA Mitochondria Xác Nhận Nguồn Gốc Mỹ Của Các Loại Thông Hiện Đại
Tóm tắt
Kết quả phân tích phát sinh loài của 15 loài, đại diện cho tất cả các dòng tiến hóa chính của chi Abies, và Keteleeria davidiana được sử dụng làm nhóm ngoài, được trình bày. Dữ liệu bao gồm các trình tự nucleotide của DNA ty thể dài khoảng 28 kb thu được bằng cách tái giải trình tự một phần của bộ gen ty thể của thông Siberia A. sibirica. Vị trí cơ sở của các haplotype mtDNA của một số loài thông ở Mỹ đã được xác lập, điều này xác nhận nguồn gốc Mỹ của các loài Abies hiện đại. Các mitotype của hầu hết các loài ở Âu - Á hình thành một nhánh con so với các loài thông ở Mỹ, cho thấy nguồn gốc của nó là kết quả của một lần di cư từ Mỹ sang Âu - Á. Đồng thời, các dữ liệu trước đây về DNA nhân và DNA lục lạp cho thấy có các di cư lặp đi lặp lại của các loài thông từ Mỹ sang Âu - Á. Xung đột giữa dữ liệu mitochondrial và nuclear này có thể được giải thích bằng việc các loài di cư đã bắt giữ DNA ty thể của các loài bản địa Âu - Á.
Từ khóa
#DNA ty thể #nguồn gốc Mỹ #Abies #Keteleeria #di cư #phân tích phát sinh loàiTài liệu tham khảo
Tiffney, B.H., Perspectives on the origin of the floristic similarity between eastern Asia and eastern North America, J. Arnold Arbor., 1985, vol. 66, pp. 73–94. https://doi.org/10.5962/bhl.part.13179
Wen, J., Nie, Z.L., and Ickert-Bond, S.M., Intercontinental disjunctions between eastern Asia and western North America in vascular plants highlight the biogeographic importance of the Bering land bridge from late Cretaceous to Neogene, J. Syst. Evol., 2016, vol. 54, no. 5, pp. 469–490. https://doi.org/10.1111/jse.12222
Tsutsui, K., Suwa, A., Sawada, K., et al., Incongruence among mitochondrial, chloroplast and nuclear gene trees in Pinus subgenus Strobus (Pinaceae), J. Plant Res., 2009, vol. 122, pp. 509–521. https://doi.org/10.1007/s10265-009-0246-4
Wang, B.S. and Wang, X.R., Mitochondrial DNA capture and divergence in Pinus provide new insights into the evolution of the genus, Mol. Phylogenet. Evol., 2014, vol. 80, pp. 20–30. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2014.07.014
Hao, Z.Z., Liu, Y.Y., Nazaire, M., et al., Molecular phylogenetics and evolutionary history of sect. Quinquefoliae (Pinus): implications for Northern Hemisphere biogeography, Mol. Phylogenet. Evol., 2015, vol. 87, pp. 65–79. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2015.03.013
Ran, J.H., Shen, T.T., Liu, W.J., et al., Mitochondrial introgression and complex biogeographic history of the genus Picea, Mol. Phylogenet. Evol., 2015, vol. 93, pp. 63–76. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2015.07.020
Semerikova, S.A., Khrunyk, Y.Y., Lascoux, M., and Semerikov, V.L., From America to Eurasia: a multigenomes history of the genus Abies, Mol. Phylogenet. Evol., 2018, vol. 125, pp. 14–28. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2018.03.009
Neale, D.B. and Sederoff, R.R., Paternal inheritance of chloroplast DNA and maternal inheritance of mitochondrial DNA in loblolly pine, Theor. Appl. Genet., 1989, vol. 77, pp. 212–216. https://doi.org/10.1007/BF00266189
Watano, Y., Kanai, I., and Tani, N., Genetic structure of hybrid zones between Pinus pumila and P. parviflora var. pentaphylla (Pinaceae) revealed by molecular hybrid index analysis, Am. J. Bot., 2004, vol. 91, no. 1, pp. 65–72. https://doi.org/10.3732/ajb.91.1.65
Semerikov, V.L., Semerikova, S.A., Polezhaeva, M.A., et al., Southern montane populations did not contribute to the recolonization of West Siberian Plain by Siberian larch (Larix sibirica): a range-wide analysis of cytoplasmic markers, Mol. Ecol., 2013, vol. 22, no. 19, pp. 4958–4971. https://doi.org/10.1111/mec.12433
Farjon, A. and Rushforth, K.D., A classification of Abies Miller (Pinaceae), Notes R. Bot. Gard., Edinburg, 1989, vol. 46, pp. 59–79.
Semerikov, V.L., Semerikova, S.A., Putintseva, Y.A., et al., Mitochondrial DNA in Siberian conifers indicates multiple postglacial colonization centers, Canad. J. For. Res., 2019, vol. 49, no. 8, pp. 875–883. https://doi.org/10.1139/cjfr-2018-0498
Untergasser, A., Cutcutache, I., Koressaar, T., et al., Primer3—new capabilities and interfaces, Nucleic Acids Res., 2012, vol. 40, no. 15. e115. https://doi.org/10.1093/nar/gks596
Hall, T.A., BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT, Nucleic Acids Symp. Ser., 1999, vol. 41, pp. 95–98.
Ronquist, F. and Huelsenbeck, J.P., MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models, Bioinformatics, 2003, vol. 19, no. 12, pp. 1572–1574. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg180
Swofford, D.L., PAUP*: Phylogenetic Analysis Using Parsimony (* and Other Methods): Version 4.0, Sunderland: Sinauer Associates, 2002.
Mamanova, L., Coffey, A.J., Scott, C.E., et al., Target-enrichment strategies for next-generation sequencing, Nat. Methods, 2010, vol. 7, no. 2, pp. 111–118. https://doi.org/10.1038/nmeth.1419