Metal use in ribonucleotide reductase R2, di-iron, di-manganese and heterodinuclear—an intricate bioinorganic workaround to use different metals for the same reaction

Metallomics - Tập 3 Số 2 - Trang 110 - 2011
Martin Högbom1
1Department of Biochemistry and Biophysics, Stockholm University, Arrhenius Laboratories for Natural Sciences C4,SE-10691 Stockholm,Sweden

Tóm tắt

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Waldron, 2009, Nature, 460, 823, 10.1038/nature08300

Maret, 2010, Metallomics, 2, 117, 10.1039/B915804A

Andrews, 2010, Biochim. Biophys. Acta, 1800, 691, 10.1016/j.bbagen.2010.05.010

Crichton, 2010, Biochim. Biophys. Acta, 1800, 706, 10.1016/j.bbagen.2010.03.019

Nordlund, 1995, Curr. Opin. Struct. Biol., 5, 758, 10.1016/0959-440X(95)80008-5

Nordlund, 1990, Nature, 345, 593, 10.1038/345593a0

Fronko, 1988, J. Am. Chem. Soc., 110, 7554, 10.1021/ja00230a055

Waldo, 1995, Biochemistry, 34, 1507, 10.1021/bi00005a006

Barynin, 2001, Structure, 9, 725, 10.1016/S0969-2126(01)00628-1

Harrison, 1996, Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg., 1275, 161, 10.1016/0005-2728(96)00022-9

Andrews, 2003, FEMS Microbiol. Rev., 27, 215, 10.1016/S0168-6445(03)00055-X

Ilari, 2000, Nat. Struct. Biol., 7, 38, 10.1038/71236

Grant, 1998, Nat. Struct. Biol., 5, 294, 10.1038/nsb0498-294

Almiron, 1992, Genes Dev., 6, 2646, 10.1101/gad.6.12b.2646

Shanklin, 2009, J. Biol. Chem., 284, 18559, 10.1074/jbc.R900009200

Fox, 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 90, 2486, 10.1073/pnas.90.6.2486

Shanklin, 1998, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol., 49, 611, 10.1146/annurev.arplant.49.1.611

Lindqvist, 1996, EMBO J., 15, 4081, 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00783.x

Shu, 1997, Science, 24, 515, 10.1126/science.275.5299.515

Rosenzweig, 1993, Nature, 366, 537, 10.1038/366537a0

Merkx, 2001, Angew. Chem., Int. Ed., 40, 2782, 10.1002/1521-3773(20010803)40:15<2782::AID-ANIE2782>3.0.CO;2-P

Murray, 2007, J. Am. Chem. Soc., 129, 14500, 10.1021/ja076121h

Sazinsky, 2006, Acc. Chem. Res., 39, 558, 10.1021/ar030204v

Coleman, 2006, Environ. Microbiol., 8, 1228, 10.1111/j.1462-2920.2006.01015.x

Lippard, 2005, Philos. Trans. R. Soc. London, Ser. A, 363, 861, 10.1098/rsta.2004.1532

Leahy, 2003, FEMS Microbiol. Rev., 27, 449, 10.1016/S0168-6445(03)00023-8

Baldwin, 2001, J. Am. Chem. Soc., 123, 7017, 10.1021/ja002114g

Parkin, 1998, Biochemistry, 37, 1124, 10.1021/bi9723717

Assarsson, 2001, J. Biol. Chem., 276, 26852, 10.1074/jbc.M008190200

Uchida, 2010, Biochim. Biophys. Acta, Gen. Subj., 1800, 834, 10.1016/j.bbagen.2009.12.005

Davis, 2010, Nature, 464, 1067, 10.1038/nature08956

Shao, 2006, Curr. Cancer Drug Targets, 6, 409, 10.2174/156800906777723949

Nordlund, 2006, Annu. Rev. Biochem., 75, 681, 10.1146/annurev.biochem.75.103004.142443

Reichard, 1993, Science, 260, 1773, 10.1126/science.8511586

Reichard, 1995, Annu. Rev. Biochem., 64, 1, 10.1146/annurev.bi.64.070195.000245

Sjöberg, 1997, Structure and Bonding, 88, 139, 10.1007/3-540-62870-3_5

Larsson, 2004, Nat. Struct. Mol. Biol., 11, 1142, 10.1038/nsmb838

Larsson, 2001, Structure, 9, 739, 10.1016/S0969-2126(01)00627-X

Reichard, 2002, Arch. Biochem. Biophys., 397, 149, 10.1006/abbi.2001.2637

Sintchak, 2002, Nat. Struct. Biol., 9, 293, 10.1038/nsb774

Logan, 1999, Science, 283, 1499, 10.1126/science.283.5407.1499

Uhlin, 1994, Nature, 370, 533, 10.1038/370533a0

Holmgren, 2010, Free Radical Biol. Med., 49, 1617, 10.1016/j.freeradbiomed.2010.09.005

Stubbe, 1998, Chem. Rev., 98, 705, 10.1021/cr9400875

Stubbe, 2003, Curr. Opin. Chem. Biol., 7, 183, 10.1016/S1367-5931(03)00025-5

Stubbe, 2003, Chem. Rev., 103, 2167, 10.1021/cr020421u

Reece, 2006, Philos. Trans. R. Soc. London, Ser. B, 361, 1351, 10.1098/rstb.2006.1874

Larsson, 2010, ACS Chem. Biol., 5, 933, 10.1021/cb1000845

Licht, 1999, J. Am. Chem. Soc., 121, 7463, 10.1021/ja9913840

Booker, 1994, Biochemistry, 33, 12676, 10.1021/bi00208a019

Frey, 2008, Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol., 43, 63, 10.1080/10409230701829169

Eliasson, 1990, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 87, 3314, 10.1073/pnas.87.9.3314

Sofia, 2001, Nucleic Acids Res., 29, 1097, 10.1093/nar/29.5.1097

Fontecave, 2002, Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol., 72, 95, 10.1016/S0079-6603(02)72068-0

Sjöberg, 1994, Structure, 2, 793, 10.1016/S0969-2126(94)00080-8

Himo, 2003, Chem. Rev., 103, 2421, 10.1021/cr020436s

Sjöberg, 1999, J. Inorg. Biochem., 74, 51

Högbom, 2004, Science, 305, 245, 10.1126/science.1098419

Jordan, 1998, Annu. Rev. Biochem., 67, 71, 10.1146/annurev.biochem.67.1.71

Brown, 1969, Eur. J. Biochem., 9, 512, 10.1111/j.1432-1033.1969.tb00639.x

Ehrenberg, 1972, J. Biol. Chem., 247, 3485, 10.1016/S0021-9258(19)45166-1

Sjöberg, 1977, J. Biol. Chem., 252, 536, 10.1016/S0021-9258(17)32750-3

Larsson, 1986, EMBO J., 5, 2037, 10.1002/j.1460-2075.1986.tb04461.x

Ochiai, 1990, J. Biol. Chem., 265, 15758, 10.1016/S0021-9258(18)55462-4

Atkin, 1973, J. Biol. Chem., 248, 7464, 10.1016/S0021-9258(19)43313-9

Rova, 1995, Biochemistry, 34, 4267, 10.1021/bi00013a016

Bollinger, 1994, J. Am. Chem. Soc., 116, 8024, 10.1021/ja00097a009

Sahlin, 1995, J. Biol. Chem., 270, 12361, 10.1074/jbc.270.21.12361

Sahlin, 1994, J. Biol. Chem., 269, 11699, 10.1016/S0021-9258(17)32628-5

Elgren, 1991, J. Biol. Chem., 266, 19265, 10.1016/S0021-9258(18)54992-9

Bollinger, 1991, Science, 253, 292, 10.1126/science.1650033

Åberg, 1993, Nature, 361, 276, 10.1038/361276a0

Logan, 1996, Structure, 4, 1053, 10.1016/S0969-2126(96)00112-8

Sturgeon, 1996, J. Am. Chem. Soc., 118, 7551, 10.1021/ja960399k

Willems, 1997, J. Am. Chem. Soc., 119, 9816, 10.1021/ja9709942

Mitic, 2007, J. Am. Chem. Soc., 129, 9049, 10.1021/ja070909i

Shanmugam, 2009, J. Am. Chem. Soc., 131, 3370, 10.1021/ja809223s

Högbom, 2003, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 100, 3209, 10.1073/pnas.0536684100

Bollinger, 1998, J. Am. Chem. Soc., 120, 1094, 10.1021/ja973651c

Moenne-Loccoz, 1998, Biochemistry, 37, 14659, 10.1021/bi981838q

Reichard, 1997, Trends Biochem. Sci., 22, 81, 10.1016/S0968-0004(97)01003-7

Pierce, 2003, J. Am. Chem. Soc., 125, 8748, 10.1021/ja021290h

Pierce, 2005, J. Am. Chem. Soc., 127, 3613, 10.1021/ja0491937

Högbom, 2001, JBIC, J. Biol. Inorg. Chem., 6, 315, 10.1007/s007750000205

Högbom, 2002, Biochemistry, 41, 1381, 10.1021/bi011429l

Tipples, 1991, J. Bacteriol., 173, 4932, 10.1128/jb.173.16.4932-4940.1991

Tipples, 1993, Mol. Microbiol., 8, 1105, 10.1111/j.1365-2958.1993.tb01655.x

Roshick, 2000, J. Biol. Chem., 275, 38111, 10.1074/jbc.M006367200

Stenmark, 2004, Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr., 60, 376, 10.1107/S0907444903028208

Voevodskaya, 2005, Biochem. Biophys. Res. Commun., 330, 1213, 10.1016/j.bbrc.2005.03.104

Voevodskaya, 2006, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 103, 9850, 10.1073/pnas.0600603103

Voevodskaya, 2007, Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics, 1774, 1254, 10.1016/j.bbapap.2007.07.001

Jiang, 2007, Science, 316, 1188, 10.1126/science.1141179

Voevodskaya, 2007, FEBS Lett., 581, 3351, 10.1016/j.febslet.2007.06.023

Jiang, 2007, J. Am. Chem. Soc., 129, 7504, 10.1021/ja072528a

Jiang, 2008, Biochemistry, 47, 8477, 10.1021/bi800881m

Younker, 2008, J. Am. Chem. Soc., 130, 15022, 10.1021/ja804365e

Voevodskaya, 2009, J. Biol. Chem., 284, 4555, 10.1074/jbc.M807190200

Popovic-Bijelic, 2009, Biochemistry, 48, 6532, 10.1021/bi900693s

Jiang, 2010, Biochemistry, 49, 5340, 10.1021/bi100037b

Han, 2010, Inorg. Chem., 49, 7266, 10.1021/ic902051t

Jiang, 2008, Biochemistry, 47, 13736, 10.1021/bi8017625

Bollinger, Jr., 2008, Curr. Opin. Struct. Biol., 18, 650, 10.1016/j.sbi.2008.11.007

Carboni, 2011, Coord. Chem. Rev., 255, 186, 10.1016/j.ccr.2010.08.003

Roth, 2008, Angew. Chem., Int. Ed., 47, 7588, 10.1002/anie.200802366

Jiang, 2007, Biochemistry, 46, 8709, 10.1021/bi700906g

Jiang, 2008, Biochemistry, 47, 4477, 10.1021/bi702085z

Roos, 2009, Biochemistry, 48, 1878, 10.1021/bi801695d

Oka, 1968, J. Bacteriol., 96, 1760, 10.1128/JB.96.5.1760-1767.1968

Schimpff-Weiland, 1981, Biochem. Biophys. Res. Commun., 102, 1276, 10.1016/S0006-291X(81)80149-0

Willing, 1988, Eur. J. Biochem., 170, 603, 10.1111/j.1432-1033.1988.tb13740.x

Griepenburg, 1996, Free Radical Res., 24, 473, 10.3109/10715769609088046

Griepenburg, 1998, Biochemistry, 37, 7992, 10.1021/bi972801t

Stubbe, 1995, Chem. Biol., 2, 793, 10.1016/1074-5521(95)90084-5

Fieschi, 1998, J. Biol. Chem., 273, 4329, 10.1074/jbc.273.8.4329

Huque, 2000, J. Biol. Chem., 275, 25365, 10.1074/jbc.M002751200

Andersson, 2004, Biochemistry, 43, 7966, 10.1021/bi036088l

Berthold, 2009, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 106, 14247, 10.1073/pnas.0905906106

Christianson, 1999, Annu. Rev. Biochem., 68, 33, 10.1146/annurev.biochem.68.1.33

Ogata, 2009, Acta Crystallogr., Sect. F: Struct. Biol. Cryst. Commun., 65, 878, 10.1107/S1744309109028978

Abbouni, 2009, Free Radical Res., 43, 943, 10.1080/10715760903140568

Oehlmann, 1999, Microbiology, 145, 1595, 10.1099/13500872-145-7-1595

Cotruvo, Jr., 2010, Biochemistry, 49, 1297, 10.1021/bi902106n

Sjoberg, 2010, Science, 329, 1475, 10.1126/science.1196347

Cox, 2010, J. Am. Chem. Soc., 132, 11197, 10.1021/ja1036995

Stolle, 2010, FEBS J., 277, 4849, 10.1111/j.1742-4658.2010.07885.x

Boal, 2010, Science, 329, 1526, 10.1126/science.1190187

Lundin, 2009, BMC Genomics, 10, 589, 10.1186/1471-2164-10-589

McHugh, 2003, J. Biol. Chem., 278, 29478, 10.1074/jbc.M303381200

Vassinova, 2000, Microbiology, 146 Pt 12, 3171, 10.1099/00221287-146-12-3171

Monje-Casas, 2001, J. Biol. Chem., 276, 18031, 10.1074/jbc.M011728200

Gon, 2006, Antioxid. Redox Signaling, 8, 735, 10.1089/ars.2006.8.735

Anjem, 2009, Mol. Microbiol., 72, 844, 10.1111/j.1365-2958.2009.06699.x

Andersson, 2009, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 106, 5633, 10.1073/pnas.0812971106

Högbom, 2010, JBIC, J. Biol. Inorg. Chem., 15, 339, 10.1007/s00775-009-0606-5

Schirmer, 2010, Science, 329, 559, 10.1126/science.1187936

Emerson, 2008, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 105, 7347, 10.1073/pnas.0711179105

Tabares, 2010, Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics, 1804, 308, 10.1016/j.bbapap.2009.09.027

Tawfik, 2010, Nat. Chem. Biol., 6, 692, 10.1038/nchembio.441

Bertini, 2003, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 100, 3601, 10.1073/pnas.0736657100

Atanassova, 2008, Methods Mol. Biol., 426, 319, 10.1007/978-1-60327-058-8_20

Högbom, 2005, Mol. Cell. Proteomics, 4, 827, 10.1074/mcp.T400023-MCP200

Ferrer, 2007, Nature, 445, 91, 10.1038/nature05362

Bertini, 2008, JBIC, J. Biol. Inorg. Chem., 13, 3, 10.1007/s00775-007-0316-9

Passerini, 2007, BMC Bioinformatics, 8, 10.1186/1471-2105-8-39

Sevcenco, 2009, JBIC, J. Biol. Inorg. Chem., 14, 631, 10.1007/s00775-009-0477-9