Sự quá biểu hiện của kinase/phosphatase tiết lộ các con đường điều chỉnh hình thái neuron thái dương của hồi hải mã

Molecular Systems Biology - Tập 6 Số 1 - 2010
William Buchser1, Tatiana I. Slepak1, Omar Gutierrez‐Arenas1, John L. Bixby1, Vance Lemmon1
1The Miami Project to Cure Paralysis, Departments of Pharmacology and Neurological Surgery, and Neuroscience Program, University of Miami, Miller School of Medicine Miami FL USA

Tóm tắt

Phát triển và tái tạo hệ thần kinh yêu cầu sự hình thành chính xác của các sợi trục và nhánh sợi. Các kinase và phosphatase là những điều tiết viên phổ biến của chức năng tế bào và đã được chỉ ra có vai trò trong việc kiểm soát sự phát triển và tái sinh của sợi trục. Chúng tôi đã thực hiện một phân tích tăng cường chức năng để xác định các chức năng của kinase và phosphatase trong việc điều chỉnh hình thái neuron. Hơn 300 kinase và 124 estease và phosphatase đã được nghiên cứu thông qua phân tích nội dung cao trên các neuron hồi hải mã của chuột cống. Các protein trước đây đã được chỉ ra có liên quan đến sự tăng trưởng neurite, như ERK1, GSK3, EphA8, FGFR, PI3K, PKC, p38, và PP1a, đã được xác nhận có tác động trong các thử nghiệm chức năng của chúng tôi. Chúng tôi cũng đã xác định được những điều tiết tích cực và tiêu cực mới cho sự phát triển neurite. Những điều này bao gồm các kinase được điều chỉnh phát triển neuron như thụ thể activin, yếu tố điều tiết interferon 6 (IRF6) và lặp lại leucine giàu trong neuron 1 (LRRN1). Protein kinase N2 (PKN2) và kinase choline α (CHKA), cùng với các phosphatase PPEF2 và SMPD1, hầu như không có chức năng đã được thiết lập trong chức năng neuron, nhưng đã đủ để thúc đẩy sự tăng trưởng neurite. Thêm vào đó, phân tích đường dẫn cho thấy rằng các thành viên của các con đường tín hiệu liên quan đến sự tiến triển của ung thư và hình thành trục đã tăng cường sự phát triển của neurite, trong khi các con đường liên quan đến cytokine đã ức chế đáng kể việc hình thành neurite.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1016/S0960-9822(06)00122-9

10.1074/jbc.M003926200

10.1038/nrn2056

10.1016/S0896-6273(00)00035-0

10.1002/jnr.490080208

10.1083/jcb.127.3.825

10.1038/6854

10.1111/j.2517-6161.1995.tb02031.x

10.1242/dev.122.5.1427

10.1016/0896-6273(89)90253-5

10.1016/j.mcn.2010.02.002

10.1523/JNEUROSCI.2493-05.2005

10.1046/j.1471-4159.2003.01638.x

10.1016/j.yexcr.2003.07.009

10.1242/dev.124.3.655

10.1073/pnas.0306880101

10.1006/dbio.2002.0847

10.1073/pnas.0509955103

10.1016/S0021-9258(19)34116-X

10.1038/nature08779

10.1042/bj3480351

10.1038/nn1442

10.1093/emboj/17.3.754

10.1523/JNEUROSCI.1544-09.2009

10.1242/dev.124.10.1941

10.1016/j.yexcr.2005.02.029

10.1523/JNEUROSCI.1178-08.2008

10.1523/JNEUROSCI.08-04-01454.1988

Efron B, 1993, An introduction to the bootstrap, Monographs on Statistics and Applied Probability Series, 1

10.1242/dev.128.20.3963

10.1523/JNEUROSCI.19-15-06417.1999

10.1002/jnr.21048

10.1242/jcs.114.16.2921

10.1101/gr.2596504

10.1523/JNEUROSCI.2981-04.2004

10.7551/mitpress/4913.003.0020

10.1038/sj.onc.1208584

10.1016/j.ydbio.2005.01.030

10.1016/S0378-1119(97)00512-X

10.1016/j.neuroscience.2008.01.083

10.1523/JNEUROSCI.20-21-07951.2000

10.1038/359609a0

10.1146/annurev.biochem.72.121801.161629

10.1083/jcb.200505075

10.1016/0896-6273(94)90339-5

10.1074/jbc.M105198200

10.1038/35023515

10.1093/nar/gkh063

10.1038/nn840

10.1126/science.1107403

10.1016/S0955-0674(00)00197-6

10.1523/JNEUROSCI.20-06-02238.2000

10.1126/science.1115462

10.1128/MCB.17.8.4633

10.1093/bioinformatics/btm404

10.1523/JNEUROSCI.20-01-00315.2000

10.1083/jcb.104.6.1611

10.1186/1471-213X-7-93

10.1038/35019582

10.1523/JNEUROSCI.16-15-04579.1996

10.1038/sj.cdd.4402258

10.1038/nn1827

10.1126/science.1075762

10.1016/0014-4827(79)90574-3

10.1016/S0896-6273(02)00752-3

10.1046/j.1471-4159.2004.02302.x

10.1523/JNEUROSCI.3162-05.2006

10.1016/0896-6273(95)90172-8

10.1126/science.1175737

10.1016/S0169-328X(96)00136-2

10.1074/jbc.273.38.24285

10.1016/S0014-4886(03)00297-8

10.1016/S0304-3835(01)00530-4

10.1523/JNEUROSCI.20-08-02875.2000

10.1046/j.1432-1327.2001.02157.x

10.1038/26034

10.1111/j.1432-1033.1978.tb12383.x

10.1523/JNEUROSCI.2625-06.2006

10.1126/science.1161566

10.1016/S0960-9822(07)00485-X

10.1016/j.ceb.2008.06.002

10.1016/j.febslet.2008.12.012

10.1038/sj.emboj.7601637

10.1371/journal.pgen.1000111

10.1038/nbt1037

10.1126/science.1179735

10.1016/S0898-6568(02)00089-X

10.1021/bi060773l

10.1038/ncb1762

10.1038/nn1742

10.1042/bj1780753

10.1523/JNEUROSCI.4531-04.2005

10.1523/JNEUROSCI.23-02-00403.2003

10.1093/nar/22.22.4673

10.1073/pnas.94.2.377

10.1126/science.8266103

10.1523/JNEUROSCI.3294-03.2004

10.1128/MCB.22.8.2871-2881.2002

10.1074/jbc.271.30.18217

10.1074/jbc.M708766200

10.1126/science.279.5348.222

10.1126/science.270.5240.1326

10.2741/1210

10.1016/j.cell.2004.11.012