Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
KAT2B là một biomarker liên quan đến xâm nhập miễn dịch dự đoán tiên lượng và đáp ứng với liệu pháp miễn dịch trong ung thư phổi không tế bào nhỏ
Tóm tắt
Nền tảng. Trong những năm qua, những đột phá đáng kể trong lĩnh vực liệu pháp miễn dịch khối u với các chất ức chế điểm kiểm tra miễn dịch (ICIs) đã tạo ra một cuộc cách mạng điều trị đối với ung thư phổi không tế bào nhỏ (NSCLC). Dù chỉ một số ít bệnh nhân thể hiện phản ứng tích cực với phương pháp điều trị này. Cần khẩn cấp khám phá các cơ chế phân tử tiềm năng liên quan đến việc điều chỉnh môi trường vi mô miễn dịch của khối u trong quá trình liệu pháp miễn dịch. Acetyltransferase lysine 2B (KAT2B) đóng vai trò quan trọng trong việc điều chỉnh sự biểu hiện gen ở cấp độ sau phiên mã thông qua phản ứng acetyl hóa và có liên quan đến nhiều loại ung thư. Phương pháp. Dữ liệu giải trình tự RNA, dữ liệu đột biến gen và thông tin lâm sàng tương ứng đã được trích xuất từ các cơ sở dữ liệu The Cancer Genome Atlas (TCGA) và Gene Expression Omnibus (GEO), sau đó đã được phân tích về các đặc điểm miễn dịch, sự biểu hiện của gen, sống sót, thay đổi di truyền và phân tích sự phong phú. Kết quả. Sự biểu hiện KAT2B có mối tương quan tích cực với mức độ xâm nhập của nhiều loại tế bào miễn dịch và mức độ biểu hiện mRNA của các gen điểm kiểm tra miễn dịch trong NSCLC. Hơn nữa, sự biểu hiện KAT2B đã bị giảm ở các mô khối u, và sự biểu hiện KAT2B thấp có liên quan đến hiệu quả kém của sự chặn điểm kiểm tra miễn dịch (ICB) và tiên lượng xấu cho bệnh nhân có adenocarcinoma phổi. Hơn nữa, có tần suất đột biến gen soma cao hơn ở những bệnh nhân có sự biểu hiện KAT2B thấp. Cuối cùng, phân tích sự phong phú chức năng cho thấy KAT2B chủ yếu liên quan đến việc điều chỉnh các tế bào miễn dịch và các con đường tín hiệu trung gian interferon − gamma (IFN-γ), phản ứng với IFN-γ, xử lý và trình bày kháng nguyên. Kết luận. Đây là nghiên cứu toàn diện đầu tiên công bố rằng KAT2B có mối tương quan với sự xâm nhập miễn dịch và có thể đóng vai trò như một biomarker mới trong việc dự đoán tiên lượng và phản ứng với liệu pháp miễn dịch trong NSCLC.
Từ khóa
#KAT2B #ung thư phổi không tế bào nhỏ #liệu pháp miễn dịch #xâm nhập miễn dịch #biomarkerTài liệu tham khảo
Bray F, Ferlay J, Soerjomataram I, Siegel RL, Torre LA, Jemal A (2018) Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin 68(6):394–424
Brody H (2020) Lung cancer. Nature 587(7834):S7
Travis WD, Brambilla E, Burke AP, Marx A, Nicholson AG (2015) Introduction to The 2015 World Health Organization Classification of Tumors of the Lung, Pleura, Thymus, and Heart. J Thorac Oncol 10(9):1240–1242
Howlader N, Forjaz G, Mooradian MJ et al (2020) The Effect of Advances in Lung-Cancer Treatment on Population Mortality. N Engl J Med 383(7):640–649
Horvath L, Thienpont B, Zhao L, Wolf D, Pircher A (2020) Overcoming immunotherapy resistance in non-small cell lung cancer (NSCLC) - novel approaches and future outlook. Mol Cancer 19(1):141
Jenke R, Reßing N, Hansen FK, Aigner A, Büch T (2021) Anticancer therapy with HDAC inhibitors: Mechanism-based combination strategies and future perspectives. Cancers (Basel) 13(4)
Liu X, Wang L, Zhao K et al (2008) The structural basis of protein acetylation by the p300/CBP transcriptional coactivator. Nature 451(7180):846–850
Liu T, Wang X, Hu W et al (2019) Epigenetically Down-Regulated Acetyltransferase PCAF Increases the Resistance of Colorectal Cancer to 5-Fluorouracil. Neoplasia 21(6):557–570
Rajendran R, Garva R, Ashour H et al (2013) Acetylation mediated by the p300/CBP-associated factor determines cellular energy metabolic pathways in cancer. Int J Oncol 42(6):1961–1972
Sulkowski PL, Scanlon SE, Oeck S, Glazer PM (2018) PTEN Regulates Nonhomologous End Joining By Epigenetic Induction of NHEJ1/XLF. Mol Cancer Res 16(8):1241–1254
Koutelou E, Farria AT, Dent S (2021) Complex functions of Gcn5 and Pcaf in development and disease. Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech. 1864(2): 194609
Wang T, Yao W, Shao Y, Zheng R, Huang F (2018) PCAF fine-tunes hepatic metabolic syndrome, inflammatory disease, and cancer. J Cell Mol Med 22(12):5787–5800
Wu Y, Wang X, Xu F et al (2020) The regulation of acetylation and stability of HMGA2 via the HBXIP-activated Akt-PCAF pathway in promotion of esophageal squamous cell carcinoma growth. Nucleic Acids Res 48(9):4858–4876
Hu H, Zhu W, Qin J et al (2017) Acetylation of PGK1 promotes liver cancer cell proliferation and tumorigenesis. Hepatology 65(2):515–528
Li YH, Li YX, Li M et al (2020) The Ras-ERK1/2 signaling pathway regulates H3K9ac through PCAF to promote the development of pancreatic cancer. Life Sci 256:117936
Wan J, Xu W, Zhan J et al (2016) PCAF-mediated acetylation of transcriptional factor HOXB9 suppresses lung adenocarcinoma progression by targeting oncogenic protein JMJD6. Nucleic Acids Res 44(22):10662–10675
Li T, Fu J, Zeng Z et al (2020) TIMER2.0 for analysis of tumor-infiltrating immune cells. Nucleic Acids Res 48(W1):W509–W514
Ru B, Wong CN, Tong Y et al (2019) TISIDB: an integrated repository portal for tumor-immune system interactions. Bioinformatics 35(20):4200–4202
Jiang P, Gu S, Pan D et al (2018) Signatures of T cell dysfunction and exclusion predict cancer immunotherapy response. Nat Med 24(10):1550–1558
Rhodes DR, Kalyana-Sundaram S, Mahavisno V et al (2007) Oncomine 3.0: genes, pathways, and networks in a collection of 18,000 cancer gene expression profiles. Neoplasia 9(2):166–80
Tang Z, Li C, Kang B, Gao G, Li C, Zhang Z (2017) GEPIA: a web server for cancer and normal gene expression profiling and interactive analyses. Nucleic Acids Res 45(W1):W98–W102
Gao J, Aksoy BA, Dogrusoz U et al (2013) Integrative analysis of complex cancer genomics and clinical profiles using the cBioPortal. Sci Signal 6(269):pl1
Cerami E, Gao J, Dogrusoz U et al (2012) The cBio cancer genomics portal: an open platform for exploring multidimensional cancer genomics data. Cancer Discov 2(5):401–404
Fridman WH, Zitvogel L, Sautès-Fridman C, Kroemer G (2017) The immune contexture in cancer prognosis and treatment. Nat Rev Clin Oncol 14(12):717–734
Azimi F, Scolyer RA, Rumcheva P et al (2012) Tumor-infiltrating lymphocyte grade is an independent predictor of sentinel lymph node status and survival in patients with cutaneous melanoma. J Clin Oncol 30(21):2678–2683
Ingold Heppner B, Untch M, Denkert C et al (2016) Tumor-Infiltrating Lymphocytes: A Predictive and Prognostic Biomarker in Neoadjuvant-Treated HER2-Positive Breast Cancer. Clin Cancer Res 22(23):5747–5754
Bagchi S, Yuan R, Engleman EG (2021) Immune Checkpoint Inhibitors for the Treatment of Cancer: Clinical Impact and Mechanisms of Response and Resistance. Annu Rev Pathol 16:223–249
Barlesi F, Tomasini P (2020) Non-small-cell lung cancer brain metastases and PD-(L)1 immune checkpoint inhibitors. Lancet Oncol 21(5):607–608
Topalian SL, Drake CG, Pardoll DM (2015) Immune checkpoint blockade: a common denominator approach to cancer therapy. Cancer Cell 27(4):450–461
Hirsch FR, Suda K, Wiens J, Bunn PA Jr (2016) New and emerging targeted treatments in advanced non-small-cell lung cancer. Lancet 388(10048):1012–1024
Ettinger DS, Wood DE, Aisner DL et al (2021) NCCN Guidelines Insights: Non-Small Cell Lung Cancer, Version 2.2021. J Natl Compr Canc Netw 19(3):254–266
Hellmann MD, Paz-Ares L, Bernabe Caro R et al (2019) Nivolumab plus Ipilimumab in Advanced Non-Small-Cell Lung Cancer. N Engl J Med 381(21):2020–2031
Beatty GL, Gladney WL (2015) Immune escape mechanisms as a guide for cancer immunotherapy. Clin Cancer Res 21(4):687–692
Hu J, Xia X, Zhao Q, Li S (2021) Lysine acetylation of NKG2D ligand Rae-1 stabilizes the protein and sensitizes tumor cells to NKG2D immune surveillance. Cancer Lett 502:143–153
Hu J, Bernatchez C, Zhang L et al (2017) Induction of NKG2D Ligands on Solid Tumors Requires Tumor-Specific CD8(+) T Cells and Histone Acetyltransferases. Cancer Immunol Res 5(4):300–311
Hu J, Xia X, Gorlick R, Li S (2019) Induction of NKG2D ligand expression on tumor cells by CD8(+) T-cell engagement-mediated activation of nuclear factor-kappa B and p300/CBP-associated factor. Oncogene 38(49):7433–7446