Phân lập và đặc trưng các loci microsatellite ở dơi ma cà rồng giả Ấn Độ Megaderma lyra

Conservation Genetics Resources - Tập 1 - Trang 369-371 - 2009
K. Emmanuvel Rajan1, A. Arul Sundari1, G. Marimuthu2
1Department of Animal Science, School of Life Sciences, Bharathidasan University, Tiruchirappalli, India
2Department of Animal Behaviour and Physiology, School of Biological Sciences, Madurai Kamaraj University, Madurai, (India)

Tóm tắt

Chúng tôi đã phân lập và đặc trưng tám dấu hiệu microsatellite cho loài dơi ma cà rồng giả Ấn Độ Megaderma lyra. Các loci này đã được thử nghiệm trên 60 cá thể đại diện cho bốn quần thể, và tất cả các loci đều có tính đa hình cao. Số allele quan sát được trung bình cho mỗi locus là 13.1 (dao động từ 5 đến 24). Giá trị đa hình quan sát được giao động từ 0.876 đến 0.982, và giá trị đa hình kỳ vọng từ 0.986 đến 1.0. Trong số tám loci, chỉ hai loci lệch đáng kể so với cân bằng Hardy-Weinberg, và không có cặp loci nào có sự phân bố liên kết. Những dấu hiệu đa hình này sẽ hữu ích để xem xét cấu trúc quần thể, hành vi giao phối và phân tán, bao gồm việc theo dõi ảnh hưởng của phân mảnh môi trường sống và phân tích cha mẹ.

Từ khóa

#dơi ma cà rồng giả #microsatellite #tính đa hình #cấu trúc quần thể #hành vi giao phối

Tài liệu tham khảo

Advani R (1981) Seasonal fluctuations in the feeding ecology of the Indian false vampire Megaderma lyra. Int J Mam Biol 46:90–93 Bates PJ, Harrison DL (1997) Bats of the Indian Subcontinent. Harrison Zoological Museum Publication, England Brosset A (1962) The bats of central and western India. J Bombay Nat Hist Soc 59:583–624 Cifarelli RA, Gallitelli M, Cellini R (1995) Random amplified hybridization microsatellites (RAHM): isolation of a new class of microsatellite-containing DNA clones. Nucleic Acids Res 23:3802–3803 Emmanuvel Rajan K, Marimuthu G (1999) Postnatal growth and age estimation in the Indian false vampire bat Megaderma lyra. J Zool (Lond) 248:529–534 Glenn TC, Cary T, Dust M, Hauswaldt S, Prince K, Ramsdell C, Shute I (2000) Microsatellite isolation manual. University of South Caroline, Columbia Hughes C (1998) Integrating molecular techniques with field methods in studies of social behavior: a revolution results. Ecology 79:383–399 Lewis PO, Zaykin D (2001) Genetic Data Analysis: Computer program for the analysis of allelic data. Version 1.0 (d16c). Source code http://lewis.eeb.uconn.edu/lewishome/software.html Lunt DH, Hutchinson WF, Carvalho GR (1999) An efficient method for PCR-based identification of microsatellite arrays (PIMA). Mol Ecol 8:893–894 Neilan BA, Leigh E, Rapley E, McDonald B (1994) Microsatellite genome screening: Rapid non-denaturing, non-isotopic dinucleotide repeat analysis. Biotechniques 17:708–711 Raymond M, Rousset F (2002) GENEPOP version 3.3 (online). Available at http://wbiomed.curtin.edu.au/genepop Rozen S, Skaletsky H (2000) Primer 3 on the WWW for general users and for biologist programmers. In: Krawetz S, Misener S (eds) Bioinformatics methods and protocols: methods in molecular biology. Humama Press, Totowa, NJ, pp 365–386 Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T (1989) Molecular cloning: a laboratory manual, 2nd edn. Cold Spring Harbor Laboratory, New York. Source code available at http://fokker.wi.mit.edu/primer3/ Sripathi K, Raghuram H, Rajasekar R, Karuppudurai T, Abraham SG (2004) Population size and survival in the Indian false vampire bat Megaderma lyra. Acta Chiropterol 6:145–154 Sugg DW, Chesser RK, Dobson FS, Hoogland JL (1996) Population genetics meets behavioral ecology. Trends Ecol Evol 11:338–342 Wilmer WJ, Barratt EM (1996) A non-lethal method of tissue sampling for genetic studies of chiropterans. Bat Res News 37:1–3