Tách và đặc trưng các locus microsatellite trong loài đặc hữu Styrax odoratissimus (Styracaceae) ở các rừng cận nhiệt đới

Conservation Genetics Resources - Tập 6 - Trang 579-580 - 2014
Fang Wang1,2, Zhengfeng Wang3, Wanhui Ye3, Yu Liang1, Keping Ma1
1State Key Laboratory of Vegetation and Environmental Change, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China
2University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China
3Key Laboratory of Vegetation Restoration and Management of Degraded Ecosystems, South China Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Guangzhou, China

Tóm tắt

Styrax odoratissimus, một loài cây nhỏ với phạm vi phân bố hạn chế, đang bị đe dọa nghiêm trọng do hoạt động của con người. Thông tin về sinh thái quần thể và đa dạng gen là cần thiết cho việc bảo tồn loài này và các họ hàng của nó. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã phát triển mười dấu ấn microsatellite đa hình và thử nghiệm chúng trên hai quần thể xa nhau. Tổng số alen mỗi locus dao động từ 5 đến 15. Độ heterozygosity quan sát được và độ heterozygosity kỳ vọng không thiên lệch dao động từ 0.190 đến 0.921 và từ 0.191 đến 0.850, tương ứng. Việc khuếch đại chéo giữa các loài đã được thử nghiệm thành công ở năm locus của Styrax dasyanthus.

Từ khóa

#Styrax odoratissimus #microsatellite markers #genetic diversity #conservation #population ecology

Tài liệu tham khảo

Doyle JJ (1991) DNA protocols for plants—CTAB total DNA isolation. In: Hewitt GM, Johnston A (eds) Molecular techniques in taxonomy. Springer, Berlin, pp 283–293 Huang YL, Fritsch PW, Shi SH (2003) A revision of the imbricate group of Styrax Series Cyrta (Styracaceae) in Asia. Ann Mo Bot Gard 90:491–553 Niu HY, Li XY, Ye WH, Wang ZF, Cao HL, Wang ZM (2012) Isolation and characterization of 36 polymorphic microsatellite markers in Schima superba (Theaceae). Am J Bot 99:e123–e126 Peakall R, Smouse PE (2006) GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Mol Ecol Notes 6:288–295 Rousset F (2008) Genepop’007: a complete re-implementation of the Genepop software for Windows and Linux. Mol Ecol Resour 8:103–106