H3K4me3 có phải là yếu tố chỉ dẫn cho sự kích hoạt phiên mã?

BioEssays - Tập 39 Số 1 - Trang 1-12 - 2017
Françoise S. Howe1, Harry Fischl1, Struan C. Murray1, Jane Mellor1
1Department of Biochemistry, University of Oxford, Oxford, UK

Tóm tắt

Tri-methyl hóa lysine 4 trên histone H3 (H3K4me3) là một biến đổi nhiễm sắc thể gần như phổ quát tại vị trí bắt đầu phiên mã của các gen hoạt động ở eukaryote từ nấm men đến con người và mức độ của nó phản ánh lượng phiên mã. Do mối liên hệ này, H3K4me3 thường được mô tả là một biến đổi histone 'kích hoạt' và được cho là có vai trò chỉ dẫn trong việc phiên mã của các gen, nhưng lĩnh vực này đang thiếu một cơ chế bảo tồn để hỗ trợ quan điểm này. Phát hiện áp đảo từ các nghiên cứu toàn bộ gen là thực tế có rất ít sự thay đổi phiên mã khi loại bỏ hầu hết H3K4me3 dưới các điều kiện trạng thái ổn định hoặc thay đổi động, bao gồm cả tại các trình khởi động của đảo CpG ở động vật có vú. Thay vào đó, thay vì có vai trò chính trong việc chỉ dẫn phiên mã, các thí nghiệm xác định theo thời gian cung cấp nhiều bằng chứng hơn hỗ trợ cho việc lắng đọng H3K4me3 vào nhiễm sắc thể như một kết quả của phiên mã, ảnh hưởng đến các quá trình như trí nhớ về các trạng thái trước đó, tính nhất quán trong phiên mã giữa các tế bào trong một quần thể và quá trình kết thúc phiên mã.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1038/nature01080

10.1038/38444

10.1016/j.molcel.2014.07.004

10.1016/j.cell.2014.06.027

10.1038/ncomms11949

10.1146/annurev-biochem-051710-134100

10.1038/378505a0

10.1242/dev.02302

10.1073/pnas.0810100105

10.1128/MCB.00976-08

10.1038/emboj.2011.194

10.1128/MCB.06092-11

10.1038/nsmb1128

10.1038/nsmb1131

10.1128/MCB.00924-09

10.1128/MCB.01181-13

10.1038/nrc3929

10.1038/nature09195

Ingham PW., 1998, Trithorax and the regulation of homeotic gene expression in Drosophila: a historical perspective, Int J Dev Biol, 42, 423

10.1016/j.cell.2005.03.036

10.1016/j.cell.2011.03.003

10.1016/j.cell.2011.01.020

10.1016/j.stem.2016.02.004

10.1073/pnas.082249499

10.1016/j.cell.2005.01.001

10.1371/journal.pbio.0030328

10.1016/j.cell.2007.05.009

10.1016/j.cell.2007.05.042

10.1038/nature06160

10.1105/tpc.107.056879

10.1186/gb-2009-10-6-r62

10.1186/1471-2229-10-238

10.1371/journal.pgen.1001354

10.1016/j.cell.2011.09.057

10.1038/ng.3385

10.1016/j.jmb.2008.04.061

10.1371/journal.pgen.1001082

10.1038/emboj.2008.257

10.1126/science.1225739

10.1016/j.molcel.2012.11.008

10.1186/gb-2014-15-6-r85

10.1186/s12864-015-1485-5

10.1371/journal.pgen.1002952

10.1371/journal.pgen.1006224

10.1016/j.cell.2015.10.051

10.1016/j.cell.2005.06.021

10.1371/journal.pgen.1003111

10.1002/j.1460-2075.1992.tb05408.x

10.1016/j.cub.2010.01.017

10.1016/j.molcel.2005.05.009

10.1016/j.molcel.2005.07.024

10.1038/nature08924

10.1371/journal.pgen.1004095

10.1128/MCB.21.22.7601-7606.2001

10.1128/MCB.25.12.4881-4891.2005

10.1101/gad.2037511

10.1128/MCB.20.6.2108-2121.2000

10.1016/j.molcel.2012.10.026

10.1093/nar/30.4.958

10.1038/onc.2008.443

10.1016/j.cell.2010.05.016

10.1101/gad.194209.112

10.1038/nsmb.2653

10.1242/dev.102681

10.1074/jbc.C600286200

10.1073/pnas.1109360108

10.1016/j.molcel.2013.01.034

Clouaire T, 2014, Cfp1 is required for gene expression‐dependent H3K4 trimethylation and H3K9 acetylation in embryonic stem cells, Genome Biol, 15, 451

10.1016/j.molcel.2011.03.026

10.1038/nature09652

10.7554/eLife.03635

10.1128/MCB.00801-07

10.1038/nsmb1204

10.1038/nsmb1200

10.1074/jbc.M609900200

10.1074/jbc.M110.117333

10.1038/ncomms12284

10.1371/journal.pbio.1001369

10.1016/j.molcel.2015.02.002

10.1016/j.molcel.2006.12.014

10.1016/j.cell.2011.03.053

10.1016/S1097-2765(03)00438-6

10.1016/j.molcel.2007.11.010

10.1128/MCB.01050-08

10.1016/j.cell.2013.01.052

10.1016/j.cell.2007.08.016

10.1128/MCB.21.15.5109-5121.2001

10.1007/s11103-007-9135-1

10.1016/j.cell.2006.04.029

10.1016/S1097-2765(03)00091-1

10.1038/ncb1088

10.1073/pnas.0503630102

10.1128/MCB.01356-07

10.1105/tpc.110.080150

10.1371/journal.pgen.1005794

10.1093/bfgp/ell022

10.1074/jbc.C200348200

10.1038/nature00883

10.1074/jbc.M115.693085

10.1038/nsmb.2881

10.1038/sj.emboj.7600204

10.1371/journal.pbio.1001442

10.1038/nature08866

10.1038/ncomms10148

10.1074/jbc.C500395200

10.1126/science.1184208

10.1016/j.molcel.2003.08.001

10.1146/annurev-biochem-060614-034242

Khan DH, 2016, Dynamic histone acetylation of H3K4me3 nucleosome regulates MCL1 pre‐mRNA splicing, J Cell Physiol, 9999, 1

10.1016/j.celrep.2012.05.019

10.1128/MCB.05590-11

10.1038/nrm3943

10.1128/MCB.05017-11

10.1128/MCB.00573-06

10.1016/j.molcel.2006.10.026

10.1016/S1097-2765(03)00092-3

10.1186/1471-2164-15-247

10.1371/journal.pgen.1000837

10.1038/ncomms1732

10.1038/nrc3959

10.1371/journal.pone.0101538

10.1038/nature04785

Kooistra SM, 2012, Molecular mechanisms and potential functions of histone demethylases, Nat Publ Gr, 13, 297

10.1016/j.cell.2005.04.031

10.1074/jbc.M806936200

10.1038/nsmb.2598

10.1101/gr.204578.116

10.1016/j.cell.2010.08.020

10.1038/emboj.2011.193

10.1074/jbc.C109.097667

10.1038/nsmb.1778

10.1128/MCB.01520-09

10.7554/eLife.10607

10.1038/nature04835

10.1038/nature04290

10.1038/nature04802

10.1038/nature04815

10.1073/pnas.1320337111

10.1016/j.cell.2015.03.027

Thông tin
Thông tin xuất bản

BioEssays

Tập 39 Số 1

1-12

Thông tin tác giả