XÁC ĐỊNH CÁC ĐÁNG KÝ DI TRUYỀN ĐẶC HIỆU LOẠI VÀ CHỦNG CỦA CÁC LOÀI ALEXANDRIUM (DINOPHYCEAE) PHÂN BỐ TOÀN CẦU. II. PHÂN TÍCH CHUỖI CỦA MỘT ĐOẠN GEN rRNA LSU1

Journal of Phycology - Tập 30 Số 6 - Trang 999-1011 - 1994
Christopher A. Scholin1, Michel Herzog2, Mitchell L. Sogin3, Donald M. Anderson1
1Biology Department, Woods Hole Oceanographic Institution, Woods Hole, Massachusetts, 02543
2Université Joseph Fourier, CERMO Département de Biologic Moleculaire Végétale, BP 53X 38041 Grenoble, Cedex, France
3Marine Biological Laboratory, MBL St., Woods Hole, Massachusetts 02543

Tóm tắt

TÓM TẮTMột đoạn gen ribosomal RNA lớn (LSU) từ các loài động vật đơn bào sống dưới biển Alexandrium tamarense (Lebour) Balech, A. catenella (Whedon et Kofoid) Balech, A. fundyense Balech, A. affine (Fukuyo et Inoue) Balech, A. minutum Halim, A. lusitanicum Balech, và A. andersoni Balech đã được clon hóa và phân đoạn để đánh giá các mối quan hệ trong và ngoài loài. Các mẫu nuôi cấy được khảo sát đến từ Bắc Mỹ, Tây Âu, Thái Lan, Nhật Bản, Úc và nước chở hàng trên một số tàu cargo, bao gồm cả các mẫu độc tố và không độc tố. Phân tích phân loại cho thấy có tám loại chuỗi gen chính, hay “ribotype”, cho thấy các dấu hiệu di truyền đặc hiệu cho cả loài và chủng. Năm ribotype đã phân chia các thành viên của cụm loài A. tamarense/catenella/fundyense (cụm “tamarensis”) nhưng không tương ứng với các phân loại hình thái. Ba ribotype còn lại liên quan đến các mẫu nuôi cấy khác biệt rõ ràng về mặt hình thái so với cụm tamarensis. Những chuỗi này được đặc trưng bởi 1) A. affine, 2) A. minutum và A. lusitanicum, và 3) A. andersoni. LSU rDNA từ A. minutum và A. lusitanicum không thể phân biệt. Khả năng sản xuất độc tố của một chủng, hoặc thiếu nó, nhất quán trong các loài cuối cùng trong cây phát sinh. Kết quả của nghiên cứu này hoàn toàn đồng nhất với các kết luận từ các nghiên cứu trước đây sử dụng phân tích độ dài mảnh cắt hạn chế của các gen rRNA nhỏ, nhưng các chuỗi LSU rDNA đã cung cấp độ phân giải loài và quần thể tinh tế hơn.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Amann R. I., 1990, Combination of 16S rRNA‐targeted oligonucleotide probes with flow cytometry for analyzing mixed microbial populations, Appl. Environ. Micribiol., 56, 1919, 10.1128/aem.56.6.1919-1925.1990

Anderson D. M., 1989, Red Tides: Biology, Environmental Science and Toxicology. Elsevier, New York, 11

10.1111/j.0022-3646.1984.00418.x

Ausubel F. M., 1987, Current Protocols in Molecular Biology

Balech E., 1985, Toxic Dinoflagellates, 33

10.1080/00364827.1985.10419687

Blanco J., 1985, Toxic Dinoflagellates, 79

10.1016/0305-1978(87)90018-4

10.1016/0305-1978(86)90107-9

Cembella A. D., 1988, Cla‐distic analysis of electrophoretic variants within the toxic dinoflagellate genus Protogonyaulax. Bot, Mar., 31, 39

10.2216/i0031-8884-31-1-121.1

10.1111/j.1558-5646.1984.tb00255.x

Franco J. M., 1994, Proceedings of the Sixth International Conference on Toxic Marine Phyloplankton

Fukuyo Y., 1985, Morphology of Protogonyaulax tamarensis (Le‐bour) Taylor and Protogonyaulax catenella (Whedon and Ko‐foid) Taylor from Japanese coastal waters, Bull. Mar. Sci., 37, 529

10.1016/0025-326X(91)90441-T

10.1093/plankt/14.8.1067

10.1007/BF00541643

10.1093/nar/19.5.1156

Judge B. S., 1993, RFLP analysis of a fragment of the large‐subunit ribosomal RNA gene of globally distributed populations of the toxic dinoflagellate Alexandrium, Biol. Bull., 185, 329, 10.1086/BBLv185n2p329

10.1007/BF02106180

10.1007/BF02099929

10.1093/nar/19.5.1154

10.1016/0300-9084(87)90267-7

10.1093/nar/12.10.4259

Prakash A., 1971, Paralytic shellfish poisoning in eastern Canada, Bull. Fish. Res. Bd. Can., 177, 1

10.1126/science.251.4999.1348

10.1126/science.239.4839.487

Sako Y., 1993, Toxic Phytoplanhton Blooms in the Sea, 87

Sako Y., 1990, Toxic Marine Plytoplankton, 320

Scholin C. A.1993.Analysis of toxic and non‐toxicAlexandrium(Dinophyceae) species using ribosomal RNA gene sequences.Ph.D. thesis Massachusetts Institute of Technology/Woods Hole Oceanographic Institute WHOI 93‐08 251pp.

Scholin C. A., 1993, Toxic Phytoplankton Blooms in the Sea, 95

10.1111/j.0022-3646.1994.00744.x

10.1111/j.0022-3646.1993.00209.x

10.1016/B978-0-12-372180-8.50041-X

Steidinger K. A., 1990, Toxic Marine Phytoplankton, 522

Swofford D. L., 1993, PAUP: Phylogenetic Analysis Using Parsimony

10.1021/bk-1984-0262.ch008

Taylor F. J. R., 1985, Toxic Dinoflagellates, 11

Wiley E. O., 1991, The Complete Cladist. A Primer of Phylogenetic Procedures, 158, 10.5962/bhl.title.4069

Thông tin
Thông tin xuất bản

Journal of Phycology

Tập 30 Số 6

999-1011

Thông tin tác giả