Virus Hibiscus latent Fort Pierce tại Brazil và tổng hợp clone cDNA dài đầy đủ có hoạt tính sinh học của nó

Virus Genes - Tập 52 - Trang 754-757 - 2016
Ruimin Gao1, Shengniao Niu1, Weifang Dai2, Elliot Kitajima3, Sek-Man Wong1,4,5
1Department of Biological Sciences, National University of Singapore, Singapore, Singapore
2Summer Undergraduate Research Internship Program, University of Toronto, Toronto, Canada
3Departamento de Fitopatologia e Nematologia, Escola Superior e Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo, Piracicaba, Brazil
4Temasek Life Sciences Laboratory, Singapore, Singapore
5National University of Singapore Suzhou Research Institute, Jiangsu, China

Tóm tắt

Một mẫu virus Hibiscus latent Fort Pierce (HLFPV-BR) đã được phát hiện lần đầu tiên trong một cây hibiscus ở Limeira, SP, Brazil. Phương pháp RACE PCR đã được áp dụng để thu nhận các chuỗi gen dài đầy đủ của HLFPV-BR, với tổng chiều dài 6453 nucleotide và có hơn 99,15% sự tương đồng về chuỗi nucleotide RNA của gen với mẫu HLFPV của Nhật Bản. Cấu trúc gen của HLFPV-BR tương tự như các tobamovirus khác. Nó bao gồm một vùng không dịch mã 5' (UTR), sau đó là các khung đọc mở mã hóa cho một protein có trọng lượng phân tử 128-kDa và một protein đọc tiếp có trọng lượng 188-kDa, một protein vận chuyển 38-kDa, protein vỏ 18-kDa và một vùng không dịch mã 3' (UTR). Đặc biệt, đặc điểm độc đáo của đoạn poly(A) cũng được tìm thấy trong vùng 3'-UTR của nó. Hơn nữa, từ tổng số RNA chiết xuất từ các tổn thương địa phương trên lá Chenopodium quinoa bị nhiễm HLFPV-BR, một clone cDNA dài đầy đủ có hoạt tính sinh học bao gồm bộ gen của HLFPV-BR đã được khuếch đại và đặt cạnh một trình khởi động polymerase RNA T7. Các bản sao RNA in vitro có nắp từ cDNA clone đã cho thấy tính lây nhiễm khi được tiêm cơ học vào cây C. quinoa và Nicotiana benthamiana. Đây là báo cáo đầu tiên về sự hiện diện của một mẫu virus HLFPV tại Brazil và tổng hợp thành công một clone cDNA dài đầy đủ có hoạt tính sinh học của HLFPV-BR.

Từ khóa

#HLFPV-BR #Hibiscus latent Fort Pierce virus #cDNA #cấu trúc gen #RNA polymerase T7

Tài liệu tham khảo

M.J. Adams, J.F. Antoniw, J. Kreuze, Arch. Virol. 154, 1967–1972 (2009) N. Takamatsu, Y. Watanabe, T. Iwasaki, T. Shiba, T. Meshi, Y. Okada, J. Virol. 65, 1619–1622 (1991) N. Takamatsu, Y. Watanabe, T. Meshi, Y. Okada, J. Virol. 64, 3686–3693 (1990) T.A. Osman, C.L. Hemenway, K.W. Buck, J. Virol. 74, 11671–11680 (2000) K.G. Srinivasan, R. Narendrakumar, S.M. Wong, Arch. Virol. 147, 1585–1598 (2002) K.G. Srinivasan, B.E. Min, K.H. Ryu, S. Adkins, S.M. Wong, Arch. Virol. 150, 153–166 (2005) S. Niu, S. Cao, L.J. Huang, K.C. Tan, S.M. Wong, Virology 474, 52–64 (2015) I. Kamenova, S. Adkins, D. Achor, D.J. Lewandowski, Plant Dis. 87, 1190–1196 (2003) I. Kamenova, S. Adkins, P. Chiemsombat, C.A. Baker, D.J. Lewandowski, Acta Hortic. 722, 65–70 (2006) I. Kamenova, J.E. Allen, S. Adkins, S.F. Hanson, Plant Health Prog. (2005). doi:10.1094/PHP-2005-0105-01-HN T. Yoshida, Y. Kitazawa, K. Komatsu, Y. Neriya, K. Ishikawa, N. Fujita, M. Hashimoto, K. Maejima, Y. Yamaji, S. Namba, Arch. Virol. 159, 3161–3165 (2014) S.K. Tewary, T. Oda, A. Kendall, W. Bian, G. Stubbs, S.M. Wong, K. Swaminathan, J. Mol. Biol. 406, 516–526 (2011) R. Gao, F.K. Ng, P. Liu, S.M. Wong, Mol. Plant Microbe Interact. 25, 1574–1583 (2012)