Phát hiện DNA nhạy cảm cao dựa trên sự phân tán của hạt nano vàng sử dụng kính hiển vi lực nguyên tử

Springer Science and Business Media LLC - Tập 388 - Trang 1185-1190 - 2007
Minh-Phuong Ngoc Bui1, Taek Jin Baek1, Gi Hun Seong1
1Department of Applied Chemistry, Hanyang University, Ansan, South Korea

Tóm tắt

Khả năng tiềm tàng của kính hiển vi lực nguyên tử (AFM) như một công cụ phân tích sinh học định lượng được chứng minh qua việc sử dụng hạt nano vàng như một tác nhân tăng kích thước trong phản ứng hybrid hóa DNA. Hai tập hợp DNA dò đã được chức năng hóa trên hạt nano vàng và sự hybrid hóa sandwich xảy ra giữa hai DNA dò và DNA mục tiêu, dẫn đến sự kết tụ của các hạt nano. Ở nồng độ cao của DNA mục tiêu trong khoảng từ 100 nM đến 10 μM, sự kết tụ của hạt nano vàng được xác định bằng cách theo dõi sự thay đổi màu sắc thông qua quang phổ UV-vis. Các phổ hấp thụ đã mở rộng sau khi DNA-hạt nano vàng tiếp xúc với DNA mục tiêu và một dải hấp thụ mới ở bước sóng >600 nm đã được quan sát. Tuy nhiên, không có sự khác biệt nào được quan sát trong các phổ hấp thụ của hạt nano vàng ở nồng độ thấp của DNA mục tiêu (10 pM đến 10 nM) do sự kết tụ không đủ. AFM đã được sử dụng như một công cụ cảm biến sinh học trong khoảng nồng độ DNA mục tiêu này để theo dõi sự kết tụ của hạt nano vàng và định lượng nồng độ DNA mục tiêu. Dựa trên hình ảnh AFM, chúng tôi đã đánh giá thành công số lượng hạt và kích thước ở nồng độ thấp của DNA mục tiêu. Đường chuẩn thu được khi đường kính trung bình của tập hợp hạt được vẽ trên nồng độ DNA mục tiêu cho thấy tính tuyến tính tốt trong khoảng từ 10 pM đến 10 nM, khoảng làm việc cho phân tích DNA mục tiêu định lượng. Kỹ thuật phát hiện DNA dựa trên AFM này nhạy hơn ba bậc so với phương pháp phát hiện DNA dựa trên quang phổ UV-vis.

Từ khóa

#kính hiển vi lực nguyên tử #hạt nano vàng #phát hiện DNA #hybrid hóa DNA #quang phổ UV-vis

Tài liệu tham khảo

Elghanian R, Storhoff JJ, Mucic RC, Letsinger RL, Mirkin CA (1997) Science 277:1078–1081 Lian W, Litherland SA, Badrane H, Tan W, Wu D, Baker HV, Gulig PA, Lim DV, Jin S (2004) Anal Biochem 334:135–144 Sato K, Hosokawa K, Maeda M (2003) J Am Chem Soc 125:8102–8103 Fang X, Liu X, Schuster S, Tan W (1999) J Am Chem Soc 121:2921–2922 Nie S, Emory S (1997) Science 275:1102–1106 Kneipp K, Kneipp H, Itzkan I, Dasari RR, Feld MS (1999) Chem Rev 99:2957–2976 Rosi NL, Mirkin CA (2005) Chem Rev 105:1547–1562 Daniel MC, Astruc D (2004) Chem Rev 104:293–346 Storhoff JJ, Lucas AD, Garimella V, Bao YP, Müller UR (2004) Nat Biotech 22:883–887 Storhoff JJ, Elghanian R, Mucic RC, Mirkin CA, Letsinger RL (1998) J Am Chem Soc 120:1959–1964 Taton TA, Mirkin CA, Letsinger RL (2000) Science 289:1757–1760 Aslan K, Luhrs CC, Perez-Luna VH (2004) J Phys Chem B 108:15631–15639 Wong AKY, Krull UJ (2005) Anal Bioanal Chem 383:187–200 Seong GH, Yanagida Y, Aizawa M, Kobatake E (2002) Anal Biochem 309:241–247 Kasas S, Thomson NH, Smith BL, Hansma HG, Zhu X, Guthold M, Bustamante C, Kool ET, Kashlev M, Hansma PK (1997) Biochemistry 36:461–468 Lyubchenko YL, Shlyakhtenko LS (1997) Proc Natl Acad Sci USA 94:496–501 Seong GH, Niimi T, Yanagida Y, Kobatake E, Aizawa M (2000) Anal Chem 72:1288–1293 Perrin A, Lanet V, Theretz A (1997) Langmuir 13:2557–2563 Grabar KC, Freeman RG, Hommer MB, Natan MJ (1995) Anal Chem 67:735–743 Crampton N, Bonass WA, Kirkham J, Thomson NH (2005) Langmuir 21:7884–7891 Gourishankar A, Shukla S, Pasricha R, Sastry M, Ganesh KN (2005) Curr Appl Phys 5:102–107 Sönnichsen C, Reinhard BM, Liphardt J, Alivisatos AP (2005) Nat Biotechnol 23:741–745 Kiang CH (2003) Physica A 321:164–169 Aslan K, Lakowicz JR, Geddes CD (2004) Anal Biochem 330:145–155 Thanh NTK, Rosenzweig Z (2002) Anal Chem 74:1624–1628 Chah S, Hammond MR, Zare RN (2005) Chem Biol 12:323–328