Phân tích gen của một vi-rút pestivirus bò không điển hình từ huyết thanh thai bò

Virus Genes - Tập 52 - Trang 561-563 - 2016
Shandian Gao1, Junzheng Du1, Zhancheng Tian1, Shanshan Xing1, Huiyun Chang1, Guangyuan Liu1, Jianxun Luo1, Hong Yin1,2
1State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology, Key Laboratory of Veterinary Parasitology of Gansu Province, Lanzhou Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Science, Lanzhou, People’s Republic of China
2Jiangsu Co-innovation Center for Prevention and Control of Important Animal Infectious Diseases and Zoonoses, Yangzhou, People’s Republic of China

Tóm tắt

Chúng tôi báo cáo chuỗi gen hoàn chỉnh của một vi-rút pestivirus bò LVRI/cont-1 có nguồn gốc từ một lô huyết thanh thai bò thương mại. Chuỗi gen hoàn chỉnh của nó bao gồm 12,282 nucleotides (nt), trong đó chứa một khung đọc mở (ORF) dài 11,700 bp được flanking bởi các vùng không dịch mã 5′ và 3′ (383 và 199 bp). Kích thước của 5′UTR và vùng mã hóa protein riêng lẻ của LVRI/cont-1 giống hệt với các chủng vi-rút tham chiếu Th/04_KhonKaen, nhưng có một đoạn thiếu 56 nt đầu tiên trong 3′UTR. Sự so khớp của chuỗi nucleotide hoàn chỉnh và phân tích hệ gen cho thấy rằng phân lập vi-rút này thuộc về các vi-rút pestivirus không điển hình.

Từ khóa

#vi-rút pestivirus #bò #chuỗi gen #huyết thanh thai bò #phân tích gen

Tài liệu tham khảo

P. Simmonds, P. Becher, M.S. Collett, E.A. Gould, F.X. Heinz, G. Meyers, T. Monath, A. Pletnev, C.M. Rice, K. Stiasny, H.-J. Thiel, A. Weiner, J. Bukh, in Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. by A.M.Q. King, M.J. Adams, E.B. Carstens, E.J. Lefkowitz (Elsevier, Amsterdam, 2012), pp. 1003–1020 J.F. Ridpath, Vet. Clin. N. Am. Food Anim. Pract. 26, 105–121 (2010) L. Liu, H. Xia, N. Wahlberg, S. Belák, C. Baule, Virology 385, 351–357 (2009) H. Schirrmeier, G. Strebelow, K. Depner, B. Hoffmann, M. Beer, J. Gen. Virol. 85, 3647–3652 (2004) K. Ståhl, M. Beer, H. Schirrmeier, B. Hoffmann, S. Belak, S. Alenius, Vet. Microbiol. 142, 90–93 (2010) H. Xia, B. Vijayaraghavan, S. Belak, L. Liu, PLoS One 6, e28553 (2011) J. Kampa, S. Alenius, U. Emanuelson, A. Chanlun, S. Aiumlamai, Vet. J. 182, 223–230 (2009) N. Decaro, M.S. Lucente, V. Mari, F. Cirone, P. Cordioli, M. Camero, R. Sciarretta, M. Losurdo, E. Lorusso, C. Buonavoglia, Emerg. Infect. Dis. 17, 1549–1552 (2011) N. Decaro, V. Mari, P. Pinto, M.S. Lucente, R. Sciarretta, F. Cirone, M.L. Colaianni, G. Elia, H.J. Thiel, C. Buonavoglia, J. Gen. Virol. 93, 1976–1983 (2012) N. Decaro, M. Losurdo, M.S. Lucente, R. Sciarretta, V. Mari, V. Larocca, G. Elia, N. Cavaliere, V. Martella, A. Fasanella, C. Buonavoglia, J. Clin. Microbiol. 51, 1241–1243 (2013) L. Mao, W. Li, W. Zhang, L. Yang, J. Jiang, J. Virol. 86, 12444 (2012) L. Liu, J. Kampa, S. Belák, C. Baule, Vet. Microbiol. 138, 62–68 (2009) R. Harasawa, H. Mizusawa, Microbiol. Immunol. 39, 979–985 (1995) S.A. Audet, R.L. Crim, J. Beeler, Biologicals 28, 41–46 (2000) E. Studer, G. Bertoni, U. Candrian, Biologicals 30, 289–296 (2002) T. Kozasa, H. Aoki, N. Nakajima, A. Fukusho, M. Ishimaru, S. Nakamura, Biologicals 39, 242–248 (2011)